43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_24600 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_24600  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  321  3e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4331  membrane protein  58.9 
 
 		 148 aa  159  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03630  hypothetical protein  52.41 
 
 		 155 aa  128  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17180  hypothetical protein  52.38 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1602  hypothetical protein  53 
 
 		 120 aa  93.6  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1596  hypothetical protein  51.09 
 
 		 123 aa  88.6  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000114337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4949  putative transmembrane protein  43.69 
 
 		 107 aa  84  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.640095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6084  hypothetical protein  44.33 
 
 		 124 aa  83.6  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1951  inner membrane protein  45 
 
 		 119 aa  80.5  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0518016  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28530  hypothetical protein  51.06 
 
 		 124 aa  80.5  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.158089 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5237  hypothetical protein  48.81 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4864  export protein  53.54 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.917726  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37260  hypothetical protein  54.46 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2390  hypothetical protein  41.58 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0727974  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2341  hypothetical protein  43.02 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281359  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1266  hypothetical protein  44.44 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.390774  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3849  hypothetical protein  40.78 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630454 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3937  hypothetical protein  40.78 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.112267 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3863  hypothetical protein  40.78 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.778203  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4315  membrane protein  41.94 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25101  normal  0.607274 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2278  inner membrane protein  43.48 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4304  hypothetical protein  43.56 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.617821  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1333  hypothetical protein  36.7 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5176  hypothetical protein  40.51 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0667281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3889  hypothetical protein  36.9 
 
 		 107 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.993431  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2129  hypothetical protein  26.67 
 
 		 111 aa  46.6  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5661  hypothetical protein  34.78 
 
 		 100 aa  45.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3170  hypothetical protein  35.96 
 
 		 99 aa  45.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.8741 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5792  hypothetical protein  35.06 
 
 		 101 aa  44.3  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3776  hypothetical protein  36.84 
 
 		 108 aa  44.3  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000562489  hitchhiker  0.00860307 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1889  hypothetical protein  27.1 
 
 		 112 aa  43.9  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.716507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4140  hypothetical protein  42.86 
 
 		 103 aa  43.9  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.193534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3536  hypothetical protein  35 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000435682  hitchhiker  0.00283491 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3827  hypothetical protein  28.97 
 
 		 119 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.146373  normal  0.27226 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3915  hypothetical protein  28.97 
 
 		 119 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3841  hypothetical protein  28.97 
 
 		 119 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0616324  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3347  hypothetical protein  32.46 
 
 		 123 aa  42.4  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11958  hypothetical protein  31.52 
 
 		 89 aa  42  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0575  hypothetical protein  32 
 
 		 104 aa  41.6  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07670  hypothetical protein  26.92 
 
 		 127 aa  41.2  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.10496  normal  0.422177 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4848  hypothetical protein  31.63 
 
 		 102 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5421  hypothetical protein  29.73 
 
 		 121 aa  40.8  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226004  normal  0.0109981 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5441  hypothetical protein  29.73 
 
 		 121 aa  40.8  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>