182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0428 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0428  transcription factor WhiB  100 
 
 		 116 aa  231  3e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.229171 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5308  transcription factor WhiB  67.06 
 
 		 107 aa  123  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.538653  normal  0.906858 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0236  transcription factor WhiB  61.54 
 
 		 97 aa  122  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512712  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8911  transcription factor WhiB  61.74 
 
 		 133 aa  119  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0110  putative regulatory protein  69.47 
 
 		 102 aa  118  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0461  transcription factor WhiB  72.73 
 
 		 98 aa  118  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.459049 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1057  transcription factor WhiB  61.63 
 
 		 103 aa  118  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4922  transcription factor WhiB  70.45 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0196  transcription factor WhiB  70.45 
 
 		 102 aa  114  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.838219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2003  transcription factor WhiB  73.26 
 
 		 115 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3938  transcription factor WhiB  60.71 
 
 		 103 aa  111  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.593836  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13712  transcriptional regulatory protein whib-like whiB4  61.25 
 
 		 118 aa  108  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0618249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5441  transcription factor WhiB  59.04 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331052 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1366  transcription factor WhiB  59.04 
 
 		 118 aa  104  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.460048 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4278  transcription factor WhiB  68.24 
 
 		 118 aa  104  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.212207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5211  transcription factor WhiB  57.83 
 
 		 118 aa  103  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000534412 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4824  transcription factor WhiB  57.83 
 
 		 118 aa  103  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4910  transcription factor WhiB  57.83 
 
 		 118 aa  103  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.695176  normal  0.54067 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0336  transcription factor WhiB  68.24 
 
 		 118 aa  103  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907394 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0327  transcription factor WhiB  65.12 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0495  transcription factor WhiB  56.63 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1741  transcription factor WhiB  58.62 
 
 		 101 aa  101  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0449249  normal  0.98439 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4353  transcription factor WhiB  63.95 
 
 		 106 aa  102  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4795  transcription factor WhiB  63.95 
 
 		 106 aa  101  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0837605 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36240  transcription factor WhiB  67.07 
 
 		 98 aa  101  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.917187 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26270  transcription factor WhiB  64.37 
 
 		 102 aa  100  6e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5240  transcription factor WhiB  66.67 
 
 		 142 aa  99  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.231068  hitchhiker  0.000573048 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3098  transcription factor WhiB  62.34 
 
 		 105 aa  81.3  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.918982  hitchhiker  0.0000561668 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0605  transcription factor WhiB  48.21 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.167031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6331  transcription factor WhiB  47.06 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0016166  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4172  transcription factor WhiB  47.69 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.632092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2515  WhiB family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13289  transcriptional regulatory protein whib-like whiB2  46.27 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1184  transcription factor WhiB  46.15 
 
 		 108 aa  62  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3301  transcription factor WhiB  44.62 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.70725  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08190  transcription factor WhiB  45.95 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3765  transcription factor WhiB  44.12 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0751  transcription factor WhiB  41.79 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.393905  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4070  transcription factor WhiB  43.94 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233037  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0560  transcription factor WhiB  41.89 
 
 		 83 aa  60.5  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.824957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7609  transcription factor WhiB  43.75 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1325  transcription factor WhiB  45.31 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19841  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1411  transcription factor WhiB  43.28 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1342  transcription factor WhiB  45.31 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1361  transcription factor WhiB  45.31 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.373176  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31070  transcription factor WhiB  42.65 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  0.666972 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0328  transcription factor WhiB  39.71 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0746  transcription factor WhiB  44.07 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0586  transcription factor WhiB  38.46 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.470912 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0636  transcription factor WhiB  40.26 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1383  transcription factor WhiB  40.54 
 
 		 84 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260043  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1401  transcription factor WhiB  40.54 
 
 		 84 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1417  transcription factor WhiB  40.54 
 
 		 84 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4729  transcription factor WhiB  43.08 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0996749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0317  transcription factor WhiB  41.1 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1734  transcription factor WhiB  43.08 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740577 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5864  transcription factor WhiB  44.07 
 
 		 213 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507295  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1232  hypothetical protein  45.59 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353561 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13245  transcriptional regulatory protein whib-like whiB1  39.19 
 
 		 84 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3850  transcription factor WhiB  43.75 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146989  normal  0.0930032 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6289  transcription factor WhiB  40.54 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1782  transcription factor WhiB  39.19 
 
 		 84 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554271  normal  0.754693 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4685  transcription factor WhiB  39.19 
 
 		 84 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.067273  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4662  transcriptional regulatory protein WhiB-like WhiB2  41.18 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.160816 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30700  transcription factor WhiB  39.74 
 
 		 84 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.588059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07590  Transcription factor WhiB  40.79 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.882581  normal  0.470516 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1713  transcription factor WhiB  40.54 
 
 		 83 aa  54.7  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0764  hypothetical protein  35.9 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0534059  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0239  transcription factor WhiB  42.11 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3521  transcription factor WhiB  39.44 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.922627  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1110  transcription factor WhiB  39.44 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1009  transcription factor WhiB  39.13 
 
 		 160 aa  53.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12870  Transcription factor WhiB  34.57 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1506  transcription factor WhiB  34.67 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28690  Transcription factor WhiB  37.21 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5364  transcription factor WhiB  35.62 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3695  transcription factor WhiB  40 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1412  transcription factor WhiB  38.03 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0457  transcription factor WhiB  40.68 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2549  transcription factor WhiB  40.68 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4983  transcription factor WhiB  34.62 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00770439  normal  0.74294 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4081  transcription factor WhiB  36.49 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08530  transcription factor WhiB  40.35 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.590298 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1766  transcription factor WhiB  42.19 
 
 		 80 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5161  transcription factor WhiB  37.5 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4450  transcription factor WhiB  39.19 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1816  transcription factor WhiB  37.04 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2782  transcription factor WhiB  34.67 
 
 		 125 aa  51.2  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145138  hitchhiker  0.0000567183 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0566  transcription factor WhiB  37.14 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.656098  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3478  transcription factor WhiB  38.24 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.712912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1482  transcription factor WhiB  33.33 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.514846  normal  0.360142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1162  transcription factor WhiB  33.33 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07550  Transcription factor WhiB-like protein  51.02 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.873436 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1179  transcription factor WhiB  33.33 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1189  transcription factor WhiB  33.33 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27842  normal  0.105428 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2403  transcription factor WhiB  41.38 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.715181  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0947  transcription factor WhiB  41.38 
 
 		 85 aa  51.2  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3759  transcription factor WhiB  36.49 
 
 		 82 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4097  transcription factor WhiB  41.54 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20790  transcription factor WhiB  38.98 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.116368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>