More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1561 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1561  ComEC/Rec2-related protein  100 
 
 
826 aa  1632    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.16578  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13280  ComEC/Rec2-related protein  41.09 
 
 
888 aa  375  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.368254 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17320  ComEC/Rec2-related protein  30.4 
 
 
829 aa  228  4e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.111271  normal  0.0143903 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.42 
 
 
837 aa  227  9e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12450  Putative ComEC/Rec2-related protein  31.65 
 
 
867 aa  207  6e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1203  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.09 
 
 
770 aa  206  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.29 
 
 
778 aa  193  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1519  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.67 
 
 
790 aa  190  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3266  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.28 
 
 
792 aa  181  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.159842  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1887  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.82 
 
 
772 aa  178  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1738  ComEC/Rec2-related protein protein  35.95 
 
 
821 aa  174  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3434  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  42.8 
 
 
800 aa  157  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242762  normal  0.0166392 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.35 
 
 
773 aa  157  7e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.19 
 
 
773 aa  156  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.54 
 
 
773 aa  151  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.81 
 
 
773 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1258  ComEC/Rec2-related protein  39.27 
 
 
872 aa  150  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0672087 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.05 
 
 
818 aa  147  8.000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0825  ComEC/Rec2-related protein  35.36 
 
 
784 aa  147  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0607183  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.9 
 
 
773 aa  146  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17410  ComEC/Rec2-related protein  29.51 
 
 
787 aa  145  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  23.85 
 
 
773 aa  140  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2244  ComEC/Rec2-related protein  37.62 
 
 
656 aa  140  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.425398  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.56 
 
 
757 aa  138  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.27 
 
 
773 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.38 
 
 
752 aa  135  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.35 
 
 
772 aa  134  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.35 
 
 
772 aa  134  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.08 
 
 
654 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0942  ComEC/Rec2-like protein  29.51 
 
 
562 aa  132  3e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.69 
 
 
794 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2229  ComEC/Rec2-related protein  40.67 
 
 
502 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.019727  hitchhiker  0.00295081 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1981  ComEC/Rec2-related protein  35.9 
 
 
710 aa  127  7e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000512904 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5470  ComEC/Rec2-related protein  34.15 
 
 
819 aa  125  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0774  ComEC/Rec2-related protein  37.17 
 
 
559 aa  124  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.434179  normal  0.339317 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3847  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  38.2 
 
 
806 aa  120  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7077  ComEC/Rec2-related protein  33.43 
 
 
516 aa  120  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.429578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2275  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)- like protein  35.71 
 
 
798 aa  118  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805588  normal  0.334125 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1143  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  37.36 
 
 
859 aa  118  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3468  ComEC/Rec2-related protein  35.02 
 
 
806 aa  115  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183145  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0687  ComEC/Rec2-related protein  31.44 
 
 
781 aa  110  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.236524 
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.91 
 
 
795 aa  110  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.73 
 
 
796 aa  109  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1173  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.65 
 
 
750 aa  109  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00434485  hitchhiker  0.000212306 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  23.87 
 
 
795 aa  108  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3524  ComEC/Rec2-related protein  36.21 
 
 
514 aa  108  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.683854  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2103  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.46 
 
 
812 aa  108  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.858083  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10250  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.38 
 
 
734 aa  107  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215433  hitchhiker  0.0000000811582 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3188  ComEC/Rec2-related protein  35.78 
 
 
519 aa  106  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0330  putative hydrolase  30.48 
 
 
474 aa  106  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.2 
 
 
814 aa  105  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0611654  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2663  ComEC/Rec2-related protein  36.95 
 
 
489 aa  104  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.23872  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0575  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.48 
 
 
809 aa  102  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7076  beta-lactamase domain protein  30.5 
 
 
363 aa  102  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.666758 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.32 
 
 
775 aa  101  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.02 
 
 
786 aa  100  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.95 
 
 
789 aa  99.8  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1254  Beta-lactamase-like  32.24 
 
 
348 aa  99.4  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.104793  normal  0.017013 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.22 
 
 
840 aa  96.7  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1656  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.95 
 
 
781 aa  95.5  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.754434  hitchhiker  0.00232522 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1232  beta-lactamase domain protein  28.99 
 
 
453 aa  95.1  4e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000615653  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.18 
 
 
780 aa  95.1  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0782  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.69 
 
 
745 aa  94.4  9e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4309  beta-lactamase domain-containing protein  31.54 
 
 
451 aa  94  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.115113  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0547  ComEC/Rec2-related protein  26.09 
 
 
900 aa  93.2  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1520  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  26.25 
 
 
746 aa  93.2  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.3 
 
 
808 aa  91.7  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.25 
 
 
797 aa  91.3  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4317  ComEC/Rec2-related protein  28.42 
 
 
872 aa  91.7  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0804  ComEC/Rec2-related protein  21.21 
 
 
795 aa  91.3  7e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.569588  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2771  beta-lactamase domain-containing protein  30.2 
 
 
367 aa  91.3  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1235  beta-lactamase domain protein  22.18 
 
 
295 aa  89.7  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000521991  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1806  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.05 
 
 
804 aa  88.2  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2752  beta-lactamase-like protein  28.83 
 
 
443 aa  87.8  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2802  ComEC/Rec2-related protein  34.1 
 
 
524 aa  87.4  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.544709  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.79 
 
 
761 aa  87.4  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3468  beta-lactamase domain protein  28.62 
 
 
283 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000679545  normal  0.805088 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0963  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.63 
 
 
840 aa  86.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116554  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1135  beta-lactamase domain protein  31.42 
 
 
320 aa  85.1  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000516269  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.18 
 
 
791 aa  84.7  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2072  beta-lactamase domain protein  30.04 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438751  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1519  ComEC/Rec2-related protein  29.93 
 
 
531 aa  84.7  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0429537  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1579  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.3 
 
 
883 aa  84.3  0.000000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0482933  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3192  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.15 
 
 
682 aa  83.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1710  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  29.23 
 
 
390 aa  82  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.658274  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2351  beta-lactamase domain-containing protein  27.24 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000261549  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1314  beta-lactamase domain-containing protein  31 
 
 
363 aa  81.6  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.55 
 
 
759 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1713  beta-lactamase domain-containing protein  30.5 
 
 
421 aa  79.3  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14040  beta-lactamase domain protein  23.94 
 
 
406 aa  80.1  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5966  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.98 
 
 
829 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.814009  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1174  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  25.77 
 
 
761 aa  79.7  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000121236  hitchhiker  0.000000673843 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2111  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.98 
 
 
829 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.261797  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.59 
 
 
798 aa  79  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1473  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.34 
 
 
738 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1186  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.31 
 
 
722 aa  79  0.0000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.41344  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12442  hypothetical protein  29.08 
 
 
514 aa  78.6  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4338  ComEC/Rec2-related protein  28.3 
 
 
798 aa  78.2  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.99 
 
 
771 aa  78.2  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1910  metallo-beta-lactamase family protein  23.86 
 
 
284 aa  77.8  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.404298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>