43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1121 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1121  hypothetical protein  100 
 
 		 618 aa  1156    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.642413 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22180  hypothetical protein  47.25 
 
 		 750 aa  375  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.314625  normal  0.946769 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1337  hypothetical protein  51.32 
 
 		 788 aa  238  3e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1512  hypothetical protein  41.54 
 
 		 640 aa  206  9e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000167269 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25500  hypothetical protein  41.95 
 
 		 339 aa  187  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1513  hypothetical protein  40.95 
 
 		 680 aa  185  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5444  hypothetical protein  44.35 
 
 		 918 aa  174  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3800  hypothetical protein  43.15 
 
 		 633 aa  164  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6067  hypothetical protein  38.49 
 
 		 936 aa  160  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0801  hypothetical protein  36.43 
 
 		 591 aa  156  8e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0753536  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0677  hypothetical protein  35.16 
 
 		 543 aa  155  2e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2042  hypothetical protein  36.39 
 
 		 349 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1253  tetratricopeptide TPR_4  54 
 
 		 350 aa  153  8.999999999999999e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.222443 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2161  hypothetical protein  39.56 
 
 		 355 aa  146  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2020  hypothetical protein  49.37 
 
 		 480 aa  145  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5461  hypothetical protein  52.38 
 
 		 341 aa  141  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0553967  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13630  hypothetical protein  39.6 
 
 		 621 aa  139  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4444  Tetratricopeptide TPR_4  45.86 
 
 		 365 aa  134  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457658  normal  0.0435915 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3512  hypothetical protein  40.57 
 
 		 305 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.804632  normal  0.14913 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1906  tetratricopeptide TPR_4  42.78 
 
 		 753 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.346521 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4077  hypothetical protein  52.56 
 
 		 374 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.313284  hitchhiker  0.00876664 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3166  tetratricopeptide TPR_2  34.55 
 
 		 654 aa  127  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.307175  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1746  hypothetical protein  37.55 
 
 		 1079 aa  127  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000886792 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2360  hypothetical protein  55.61 
 
 		 245 aa  126  9e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0182213  hitchhiker  0.00536835 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3019  hypothetical protein  42.03 
 
 		 658 aa  125  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.882061  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1981  tetratricopeptide TPR_2  39.84 
 
 		 321 aa  125  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3293  hypothetical protein  41.59 
 
 		 285 aa  124  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2969  hypothetical protein  39.16 
 
 		 277 aa  120  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2954  hypothetical protein  38.78 
 
 		 277 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2998  hypothetical protein  38.78 
 
 		 277 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.631181  normal  0.549818 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07420  hypothetical protein  36.21 
 
 		 274 aa  118  3.9999999999999997e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.704818  normal  0.126809 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11707  hypothetical protein  40.38 
 
 		 250 aa  111  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.104662 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2830  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  41.27 
 
 		 675 aa  103  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3039  hypothetical protein  44.38 
 
 		 227 aa  101  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.635634  normal  0.640764 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1897  tetratricopeptide TPR_4  48 
 
 		 286 aa  98.2  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2386  hypothetical protein  45.89 
 
 		 200 aa  95.9  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0787  pseudouridine synthase  47.27 
 
 		 728 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000926536  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2316  translation initiation factor IF-2  29.79 
 
 		 1116 aa  70.9  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.100815  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1401  hypothetical protein  41.46 
 
 		 631 aa  68.6  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1275  RNA-binding S4 domain protein  39.75 
 
 		 674 aa  55.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.206781 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1339  RNA-binding S4 domain protein  38.72 
 
 		 627 aa  51.2  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.476364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  24.5 
 
 		 1355 aa  47.8  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1678  pseudouridine synthase, Rsu  36.82 
 
 		 649 aa  45.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151173  normal  0.0771799 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>