More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4062 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_4062  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  338  2e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.154683 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1522  hypothetical protein  59.38 
 
 
161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2955  hypothetical protein  56.39 
 
 
161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263755  normal  0.0249448 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2842  hypothetical protein  49.34 
 
 
158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.523389 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0174  hypothetical protein  58.59 
 
 
169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00309519  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2797  hypothetical protein  60.58 
 
 
472 aa  119  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  53.6 
 
 
150 aa  119  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3438  hypothetical protein  62.16 
 
 
165 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0159853  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3434  protein of unknown function UPF0079  54.1 
 
 
165 aa  115  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  48.53 
 
 
504 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4941  protein of unknown function UPF0079  58.72 
 
 
540 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.267606 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4431  hypothetical protein  56.56 
 
 
549 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.319947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4895  protein of unknown function UPF0079  56.56 
 
 
542 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582734  normal  0.663902 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  47.97 
 
 
505 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1606  protein of unknown function UPF0079  56.39 
 
 
529 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0383764  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  47.3 
 
 
503 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1355  P-loop hydrolase/phosphotransferase  46.1 
 
 
497 aa  107  6e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0666  protein of unknown function UPF0079  52.83 
 
 
523 aa  105  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1298  protein of unknown function UPF0079  46.72 
 
 
161 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0134  hypothetical protein  53.7 
 
 
164 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0493  aminoglycoside phosphotransferase  54.14 
 
 
514 aa  101  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248724 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0383  hypothetical protein  54.72 
 
 
506 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0082  hypothetical protein  56.36 
 
 
158 aa  99  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.659659 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0046  hypothetical protein  52.14 
 
 
507 aa  97.8  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.810658  normal  0.280558 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0820  hypothetical protein  50 
 
 
509 aa  97.8  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0587  hypothetical protein  55.06 
 
 
562 aa  97.1  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.977621 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0051  hypothetical protein  50 
 
 
502 aa  96.7  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3297  hypothetical protein  52.48 
 
 
523 aa  96.7  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.480432 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  44.03 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0206  hypothetical protein  50.94 
 
 
505 aa  95.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0259343  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3029  hypothetical protein  41.61 
 
 
153 aa  95.1  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.63375  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0161  hypothetical protein  49.23 
 
 
164 aa  94.4  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4542  hypothetical protein  54.55 
 
 
529 aa  94.4  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  40.74 
 
 
173 aa  94  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0625  hypothetical protein  50.94 
 
 
505 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00759808  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0081  protein of unknown function UPF0079  53.47 
 
 
506 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  32.85 
 
 
150 aa  93.2  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1453  hypothetical protein  54.72 
 
 
149 aa  93.2  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0054  hypothetical protein  50.93 
 
 
507 aa  92.8  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.885213  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3315  hypothetical protein  40 
 
 
152 aa  93.2  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00300444  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2100  hypothetical protein  44.72 
 
 
513 aa  92  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3923  putative ATPase  42.25 
 
 
160 aa  92  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00130971  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2017  hypothetical protein  44.72 
 
 
513 aa  91.7  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0531  protein of unknown function UPF0079  43.24 
 
 
157 aa  91.7  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0352512  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  37.06 
 
 
152 aa  90.9  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  38.46 
 
 
152 aa  90.9  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  38.35 
 
 
153 aa  90.1  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0086  hypothetical protein  43.28 
 
 
509 aa  90.5  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.522913  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  42.2 
 
 
160 aa  90.1  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  38.46 
 
 
152 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  41.13 
 
 
157 aa  89.4  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  36.43 
 
 
153 aa  90.1  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  45.45 
 
 
160 aa  89.4  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1784  protein of unknown function UPF0079  38.99 
 
 
176 aa  89.7  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0485483  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0700  hypothetical protein  38.58 
 
 
139 aa  90.1  2e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.725805  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3725  putative ATPase  42.45 
 
 
160 aa  89  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  37.76 
 
 
152 aa  89.4  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  37.76 
 
 
152 aa  89.4  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2676  hypothetical protein  49.64 
 
 
157 aa  89  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3657  putative ATPase  42 
 
 
156 aa  89  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030083  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0427  putative ATPase  40.13 
 
 
156 aa  88.6  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368421  hitchhiker  0.000000532779 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1081  ATPase  38.06 
 
 
156 aa  88.2  6e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2671  RNA binding S1  40.98 
 
 
157 aa  87.8  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.543969  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5684  putative ATPase  37.58 
 
 
152 aa  87.4  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000102371  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4639  putative ATPase  37.58 
 
 
152 aa  87.4  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.162208  normal  0.0835245 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04035  ATPase with strong ADP affinity  37.58 
 
 
153 aa  87.4  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000985798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3825  protein of unknown function UPF0079  37.58 
 
 
153 aa  87.4  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776436  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3845  putative ATPase  37.58 
 
 
153 aa  87.4  9e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000032368  hitchhiker  0.00000180276 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4410  putative ATPase  37.58 
 
 
153 aa  87.4  9e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000607313  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4699  putative ATPase  37.58 
 
 
153 aa  87.4  9e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000112747  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4725  putative ATPase  37.58 
 
 
153 aa  87.4  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000010993  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03997  hypothetical protein  37.58 
 
 
153 aa  87.4  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000527155  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0936  hypothetical protein  39 
 
 
155 aa  87  1e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000264552  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3803  putative ATPase  41.33 
 
 
156 aa  87  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0703  putative ATPase  41.33 
 
 
156 aa  87  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000204367  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  36.91 
 
 
176 aa  87  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  37.59 
 
 
152 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  37.59 
 
 
152 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  37.59 
 
 
152 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  37.59 
 
 
152 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  38.69 
 
 
152 aa  85.5  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  39.68 
 
 
161 aa  85.1  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  36.84 
 
 
153 aa  84.7  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0351  putative ATPase  39.07 
 
 
153 aa  84.7  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000572111  hitchhiker  0.00108821 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3209  hypothetical protein  44.86 
 
 
157 aa  84.7  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000564317  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04610  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  36.94 
 
 
157 aa  84.7  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.343919 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0488  protein of unknown function UPF0079  43.75 
 
 
160 aa  84.7  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000100685  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  44.04 
 
 
154 aa  84.3  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4635  putative ATPase  36.18 
 
 
153 aa  84.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00161848  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  39.52 
 
 
161 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4754  putative ATPase  36.18 
 
 
152 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3544  hypothetical protein  38.69 
 
 
160 aa  84  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002255  ATPase YjeE  44.04 
 
 
154 aa  83.6  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000336436  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  36.92 
 
 
152 aa  84  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4718  putative ATPase  36.18 
 
 
153 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.983496  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  34.53 
 
 
164 aa  83.6  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4625  putative ATPase  36.18 
 
 
152 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  34.53 
 
 
164 aa  83.6  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4775  putative ATPase  36.18 
 
 
152 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0594287 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6124  protein of unknown function UPF0079  47.66 
 
 
161 aa  83.2  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433891  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>