More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0237 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0290  NifU family protein  99.69 
 
 		 323 aa  666    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0264  NifU family protein  99.69 
 
 		 323 aa  666    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0237  NifU family protein  100 
 
 		 323 aa  667    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1487  NifU-like protein  88.85 
 
 		 323 aa  611  9.999999999999999e-175  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1771  NifU family protein  79.7 
 
 		 330 aa  551  1e-156  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.630256  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1162  acetolactate synthase small subunit  79.09 
 
 		 330 aa  551  1e-156  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0043  nitrogen fixation protein NifU  76.67 
 
 		 330 aa  535  1e-151  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1697  nitrogen fixation protein NifU  71.47 
 
 		 333 aa  494  1e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0518954  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2153  nitrogen-fixing NifU domain protein  69.6 
 
 		 329 aa  483  1e-135  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2007  nitrogen-fixing NifU-like-like  64.62 
 
 		 324 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.39 
 
 		 284 aa  201  1.9999999999999998e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.41 
 
 		 277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.36 
 
 		 284 aa  195  9e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.36 
 
 		 284 aa  195  9e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  38.22 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.22 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.87 
 
 		 309 aa  188  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  35.45 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.51 
 
 		 286 aa  186  6e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.43 
 
 		 329 aa  182  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.64 
 
 		 306 aa  179  4.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2363  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.44 
 
 		 296 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2121  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.11 
 
 		 293 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.33 
 
 		 309 aa  177  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.12 
 
 		 298 aa  177  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.66 
 
 		 277 aa  172  5e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.11 
 
 		 344 aa  171  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.59 
 
 		 294 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.59 
 
 		 294 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3915  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.12 
 
 		 300 aa  170  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1606  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.36 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2684  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.5 
 
 		 276 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0380338 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.62 
 
 		 283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2012  NifU family protein  34.98 
 
 		 285 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000109359  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0991  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.54 
 
 		 286 aa  160  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000244062  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.35 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2016  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.13 
 
 		 290 aa  158  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000826142  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4135  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.86 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000225432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.65 
 
 		 280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.37 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2295  Fe-S cluster assembly protein NifU  31.21 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.65 
 
 		 281 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1084  nitrogen-fixing NifU-like  29.46 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0980  nitrogen-fixing NifU-like protein  28.32 
 
 		 333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4452  nitrogen-fixing NifU-like  28.85 
 
 		 338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5090  Fe-S cluster assembly protein NifU  26.96 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41017  Iron sulfur cluster assembly protein 1, mitochondrial precursor (Iron sulfur cluster scaffold protein 1)  41.79 
 
 		 182 aa  103  4e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.27253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1951  scaffold protein  43.61 
 
 		 127 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000468917  normal  0.344726 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1046  FeS cluster assembly scaffold IscU  42.11 
 
 		 128 aa  100  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  36.71 
 
 		 149 aa  99.8  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  40.97 
 
 		 139 aa  99.4  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1562  FeS cluster assembly scaffold IscU  42.86 
 
 		 137 aa  99  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.43451 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0483  scaffold protein  41.35 
 
 		 128 aa  99  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1876  scaffold protein  42.86 
 
 		 135 aa  98.6  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.473661  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1777  scaffold protein  41.79 
 
 		 127 aa  97.8  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1489  scaffold protein  42.11 
 
 		 127 aa  97.8  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2035  scaffold protein  42.54 
 
 		 135 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1239  scaffold protein  41.04 
 
 		 126 aa  98.2  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351631  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2423  scaffold protein  42.54 
 
 		 127 aa  98.2  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2162  scaffold protein  42.54 
 
 		 135 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.789596  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  40.6 
 
 		 139 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1707  scaffold protein  42.54 
 
 		 135 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1165  scaffold protein  42.86 
 
 		 128 aa  97.1  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0089491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2732  scaffold protein  42.54 
 
 		 135 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2654  scaffold protein  42.54 
 
 		 135 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.978602  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5431  scaffold protein  42.54 
 
 		 135 aa  97.4  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2374  FeS cluster assembly scaffold IscU  39.85 
 
 		 133 aa  97.4  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.161574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1361  FeS cluster assembly scaffold IscU  41.35 
 
 		 142 aa  97.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1457  FeS cluster assembly scaffold IscU  42.54 
 
 		 135 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2598  scaffold protein  42.54 
 
 		 135 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0662204  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1488  scaffold protein  42.54 
 
 		 135 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.719074  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2261  (Fe-S) cluster formation/repair protein  40.6 
 
 		 138 aa  97.4  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3104  scaffold protein  42.54 
 
 		 135 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.653609  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2216  scaffold protein  42.54 
 
 		 135 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2316  scaffold protein  41.04 
 
 		 127 aa  96.7  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.624311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2870  scaffold protein  41.35 
 
 		 127 aa  97.1  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.836462  hitchhiker  0.0000000193406 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1020  scaffold protein  42.11 
 
 		 133 aa  97.1  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154036  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2142  scaffold protein  42.54 
 
 		 135 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2444  FeS cluster assembly scaffold IscU  39.85 
 
 		 132 aa  96.7  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.463921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2179  scaffold protein  41.35 
 
 		 128 aa  97.1  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000106692  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5952  scaffold protein  42.54 
 
 		 135 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2125  scaffold protein  42.54 
 
 		 135 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2204  scaffold protein  42.11 
 
 		 127 aa  96.7  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00285299  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  40.6 
 
 		 125 aa  96.7  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1145  scaffold protein  42.54 
 
 		 135 aa  96.7  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108874  normal  0.133708 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1059  scaffold protein  41.61 
 
 		 133 aa  96.3  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446364  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1568  scaffold protein  39.19 
 
 		 150 aa  96.3  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.497766 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1026  scaffold protein  41.61 
 
 		 133 aa  96.3  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00834233  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2578  scaffold protein  42.54 
 
 		 138 aa  96.3  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115419  hitchhiker  0.00110358 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0278  scaffold protein  42.11 
 
 		 127 aa  96.3  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00334373  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1554  scaffold protein  42.54 
 
 		 137 aa  95.9  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115759  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3998  FeS cluster assembly scaffold IscU  39.55 
 
 		 132 aa  95.9  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455021  hitchhiker  0.00958668 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04655  iron-sulfur cofactor synthesis protein (Isu1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06770)  37.69 
 
 		 173 aa  95.9  9e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.593219 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0873  scaffold protein  43.61 
 
 		 128 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.207282 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0843  scaffold protein  43.61 
 
 		 128 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0886  scaffold protein  43.61 
 
 		 128 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272267  hitchhiker  0.000151152 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2289  scaffold protein  40.6 
 
 		 133 aa  95.9  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0320081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4335  scaffold protein  43.61 
 
 		 128 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.258722  hitchhiker  0.00000000135167 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2178  scaffold protein  39.1 
 
 		 132 aa  95.1  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00857387  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0950  scaffold protein  41.35 
 
 		 133 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.850633  normal  0.0311736 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>