34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1246 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1246  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 346 aa  719    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0312  Radical SAM domain protein  80.66 
 
 		 332 aa  575  1.0000000000000001e-163  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.139539 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0936  Radical SAM domain protein  77.35 
 
 		 343 aa  568  1e-161  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1383  Radical SAM domain protein  79.09 
 
 		 331 aa  547  1e-154  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632636  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3338  Radical SAM domain protein  79.39 
 
 		 331 aa  542  1e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0273  hypothetical protein  43.86 
 
 		 353 aa  287  1e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.888723  normal  0.245364 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0043  radical SAM family Fe-S protein  45.43 
 
 		 348 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0784  radical SAM family protein  40.12 
 
 		 337 aa  247  3e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00132902  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0016  radical SAM domain-containing protein  41.47 
 
 		 344 aa  245  6.999999999999999e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.238462  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0106  Radical SAM domain protein  40.3 
 
 		 343 aa  241  1e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0772  Radical SAM domain protein  40 
 
 		 353 aa  240  2e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00827536  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1789  radical SAM domain-containing protein  40.48 
 
 		 341 aa  236  3e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2062  radical SAM domain-containing protein  36.83 
 
 		 341 aa  228  2e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0117  hypothetical protein  37.35 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0508  radical SAM domain-containing protein  33.81 
 
 		 373 aa  193  3e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2157  radical SAM domain-containing protein  35.33 
 
 		 343 aa  184  1.0000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.350893  hitchhiker  0.000485535 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1063  Radical SAM domain protein  38.55 
 
 		 350 aa  184  3e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.540032  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0983  radical SAM domain-containing protein  35.01 
 
 		 380 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.156314  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0439  radical SAM domain-containing protein  34.56 
 
 		 371 aa  182  7e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1481  radical SAM domain-containing protein  33.81 
 
 		 371 aa  181  1e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0924558  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0398  radical SAM domain-containing protein  32.68 
 
 		 371 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0698777  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0464  radical SAM domain-containing protein  31.99 
 
 		 353 aa  150  3e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0768  radical SAM domain-containing protein  31.72 
 
 		 300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00853946 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0964  radical SAM domain-containing protein  31.11 
 
 		 300 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1901  radical SAM domain-containing protein  30.74 
 
 		 298 aa  125  8.000000000000001e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1414  radical SAM domain-containing protein  31 
 
 		 290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1369  hypothetical protein  28.52 
 
 		 471 aa  107  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1025  Radical SAM domain protein  27.44 
 
 		 409 aa  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3410  Radical SAM domain protein  24.81 
 
 		 433 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.736979  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00200  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  28.44 
 
 		 464 aa  70.1  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.158297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2369  Radical SAM domain protein  25.59 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0697954  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1387  radical SAM family protein  28.17 
 
 		 441 aa  54.3  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05050  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  30.77 
 
 		 457 aa  52  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2925  Radical SAM domain protein  32.82 
 
 		 440 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>