27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4674 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013745  Htur_4674  glycoside hydrolase family 5  100 
 
 		 443 aa  906    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2393  PKD domain containing protein  57.14 
 
 		 600 aa  364  2e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.562625  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4515  glycoside hydrolase family protein  44.75 
 
 		 357 aa  258  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586429 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2048  glycoside hydrolase family protein  42 
 
 		 327 aa  211  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.904754  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0277  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  34.19 
 
 		 469 aa  73.2  0.000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  34.62 
 
 		 815 aa  73.2  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  28.37 
 
 		 468 aa  72.8  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2228  glycoside hydrolase family 5  28.19 
 
 		 403 aa  72.8  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  28.37 
 
 		 449 aa  67  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0064  putative secreted beta-mannosidase  24.9 
 
 		 561 aa  64.7  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000582452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6532  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  33.62 
 
 		 584 aa  63.9  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0656  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.6 
 
 		 507 aa  59.7  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0504  glycoside hydrolase family 5  28.32 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  28.48 
 
 		 1369 aa  57.8  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  28.48 
 
 		 1294 aa  57.8  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  28.48 
 
 		 1414 aa  56.6  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  32.95 
 
 		 577 aa  54.7  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1071  glycoside hydrolase family protein  34.82 
 
 		 728 aa  53.9  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.535323  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  28.57 
 
 		 453 aa  53.5  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  29.55 
 
 		 591 aa  52.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  25.91 
 
 		 543 aa  50.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2811  glycoside hydrolase family 5  27.43 
 
 		 478 aa  50.1  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.684544  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3707  Carbohydrate binding family 6  41.18 
 
 		 1000 aa  50.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176968  normal  0.212982 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  25.82 
 
 		 460 aa  49.7  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  32.04 
 
 		 857 aa  46.6  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  25.59 
 
 		 523 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0942  ribosomal protein L18  27.73 
 
 		 769 aa  44.3  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000113865  hitchhiker  0.00163221 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>