34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0250 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0250  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 398 aa  808    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3305  polysaccharide deacetylase  36.03 
 
 		 411 aa  241  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2647  polysaccharide deacetylase  35.5 
 
 		 430 aa  237  3e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.502383  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0727  polysaccharide deacetylase  38.04 
 
 		 409 aa  226  6e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1899  polysaccharide deacetylase  35.88 
 
 		 429 aa  220  3.9999999999999997e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.557676  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2171  polysaccharide deacetylase  25.68 
 
 		 435 aa  116  6.9999999999999995e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3274  hypothetical protein  28.38 
 
 		 430 aa  103  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.864769  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4283  polysaccharide deacetylase  28.02 
 
 		 600 aa  86.3  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.916194  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1133  polysaccharide deacetylase  26.04 
 
 		 444 aa  83.6  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3278  polysaccharide deacetylase  25.68 
 
 		 444 aa  73.6  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.703793  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3294  hypothetical protein  27.82 
 
 		 633 aa  70.9  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  39.6 
 
 		 510 aa  60.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  31.03 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  31.03 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  30.48 
 
 		 319 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0504  hypothetical protein  31.78 
 
 		 277 aa  55.5  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1230  polysaccharide deacetylase  35.16 
 
 		 482 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  32.12 
 
 		 234 aa  50.8  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3555  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 		 487 aa  49.7  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1796  polysaccharide deacetylase  29.14 
 
 		 344 aa  49.7  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2337  polysaccharide deacetylase  35.42 
 
 		 500 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00797389  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0853  polysaccharide deacetylase  37.11 
 
 		 318 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000296204  normal  0.358313 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  29.46 
 
 		 255 aa  48.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0880  polysaccharide deacetylase  29.36 
 
 		 271 aa  47.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3897  glycosyl transferase family 2  26.79 
 
 		 501 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1121  polysaccharide deacetylase family protein  25.2 
 
 		 295 aa  46.2  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3874  polysaccharide deacetylase  36.56 
 
 		 281 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  30.19 
 
 		 316 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1782  polysaccharide deacetylase  27.93 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  30.43 
 
 		 321 aa  44.3  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  26.81 
 
 		 626 aa  44.3  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  27.15 
 
 		 282 aa  43.5  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 		 278 aa  42.7  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 		 598 aa  42.7  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>