More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6478 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2939  Integrase catalytic region  97.83 
 
 		 502 aa  995    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.620801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1139  Integrase catalytic region  93.29 
 
 		 474 aa  934    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4858  Integrase catalytic region  97.83 
 
 		 502 aa  997    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0252827  normal  0.0109178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1063  Integrase catalytic region  98.03 
 
 		 502 aa  998    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.877216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1072  Integrase catalytic region  97.83 
 
 		 502 aa  998    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1589  Integrase catalytic region  97.63 
 
 		 502 aa  995    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6478  Integrase catalytic region  100 
 
 		 507 aa  1023    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4855  Integrase catalytic region  97.83 
 
 		 502 aa  997    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000769666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2874  Integrase catalytic region  97.83 
 
 		 502 aa  997    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0943  Integrase catalytic region  98.22 
 
 		 502 aa  998    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.346378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1052  Integrase catalytic region  98.82 
 
 		 502 aa  1006    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1097  Integrase catalytic region  92.11 
 
 		 474 aa  919    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.81424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0317  transposase, IS21 family  58.48 
 
 		 496 aa  533  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0223423  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0010  transposase, IS21 family  58.28 
 
 		 496 aa  525  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3159  transposase, IS21 family  58.28 
 
 		 496 aa  524  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2090  transposase, IS21 family  58.28 
 
 		 496 aa  524  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4040  hypothetical protein  58.28 
 
 		 496 aa  524  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2468  integrase catalytic subunit  53.45 
 
 		 514 aa  510  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3280  transposase  57.22 
 
 		 363 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.32687 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5534  integrase catalytic region  37.5 
 
 		 427 aa  196  7e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6916  integrase catalytic region  37.5 
 
 		 427 aa  196  7e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7013  hypothetical protein  37.5 
 
 		 427 aa  196  7e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1464  integrase catalytic region  37.5 
 
 		 427 aa  196  7e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1510  integrase catalytic region  37.5 
 
 		 427 aa  196  7e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2452  integrase catalytic region  37.5 
 
 		 427 aa  196  7e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2798  integrase catalytic region  37.5 
 
 		 427 aa  196  7e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3888  integrase catalytic region  37.5 
 
 		 427 aa  196  7e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4700  integrase catalytic region  37.5 
 
 		 427 aa  196  7e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1457  integrase  36.93 
 
 		 410 aa  189  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5106  integrase catalytic subunit  37.46 
 
 		 431 aa  169  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214322  normal  0.182706 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6519  integrase catalytic region  30.11 
 
 		 499 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126482 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3717  integrase catalytic subunit  29.8 
 
 		 412 aa  159  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0554  integrase catalytic region  30.52 
 
 		 501 aa  158  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0566  integrase catalytic region  30.52 
 
 		 501 aa  158  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.478269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1009  integrase catalytic subunit  29.23 
 
 		 412 aa  157  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00535974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1319  integrase catalytic subunit  29.23 
 
 		 412 aa  157  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2854  integrase catalytic subunit  29.23 
 
 		 412 aa  157  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230802  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0210  transposase, IS21 family  27.25 
 
 		 417 aa  156  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000847159 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3279  IS21 family transposase  61.36 
 
 		 131 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4458  transposase  30.07 
 
 		 442 aa  155  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000107543  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1081  Integrase catalytic region  32.2 
 
 		 449 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333924  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0119  Integrase catalytic region  32.2 
 
 		 449 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2255  integrase catalytic region  32.59 
 
 		 502 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.659658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5400  integrase catalytic region  32.59 
 
 		 502 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4173  integrase catalytic region  32.59 
 
 		 502 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4066  Integrase catalytic region  32.53 
 
 		 503 aa  151  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2875  integrase catalytic subunit  30.69 
 
 		 506 aa  151  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853486  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2884  Integrase catalytic region  32.53 
 
 		 503 aa  151  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.53685e-20 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0318  integrase catalytic subunit  30.52 
 
 		 499 aa  150  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0789  integrase catalytic subunit  30.52 
 
 		 499 aa  150  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3914  integrase catalytic subunit  30.52 
 
 		 499 aa  150  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2412  Integrase catalytic region  32.27 
 
 		 503 aa  150  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3923  integrase catalytic subunit  32.58 
 
 		 499 aa  150  7e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2004  transposase  27.88 
 
 		 494 aa  147  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2294  transposase  27.88 
 
 		 494 aa  147  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2831  transposase  27.88 
 
 		 494 aa  147  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2198  transposase  27.88 
 
 		 494 aa  147  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3045  integrase catalytic subunit  29.61 
 
 		 499 aa  148  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3056  integrase catalytic subunit  29.61 
 
 		 499 aa  148  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.278904 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0901  integrase catalytic subunit  30.08 
 
 		 499 aa  144  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0261682  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3714  integrase catalytic subunit  30.08 
 
 		 499 aa  144  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.16715  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0906  Integrase catalytic region  29.87 
 
 		 504 aa  144  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2179  Integrase catalytic region  29.87 
 
 		 504 aa  144  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2848  Integrase catalytic region  29.87 
 
 		 504 aa  144  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1294  Integrase catalytic region  29.87 
 
 		 504 aa  144  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0016  Integrase catalytic region  29.87 
 
 		 504 aa  144  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0423553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1436  Integrase catalytic region  29.87 
 
 		 504 aa  144  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0886  Integrase catalytic region  29.87 
 
 		 504 aa  144  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.106081  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2866  Integrase catalytic region  28.7 
 
 		 503 aa  144  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00185303  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2255  Integrase catalytic region  29.87 
 
 		 504 aa  144  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3489  Integrase catalytic region  29.87 
 
 		 504 aa  144  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1971  integrase catalytic subunit  29.73 
 
 		 373 aa  143  8e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139673  normal  0.752349 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0433  integrase catalytic subunit  31.47 
 
 		 504 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0850  integrase catalytic subunit  31.47 
 
 		 504 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.314158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0069  Integrase catalytic region  31.21 
 
 		 502 aa  140  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6841  integrase catalytic subunit  35.37 
 
 		 257 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0136  integrase catalytic subunit  31.56 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2833  integrase catalytic subunit  31.56 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1554  Integrase catalytic region  30.81 
 
 		 413 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1039  Integrase catalytic region  32.81 
 
 		 496 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0651609  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0041  Integrase catalytic region  32.53 
 
 		 501 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.456904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2538  integrase catalytic subunit  33.21 
 
 		 424 aa  136  7.000000000000001e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178355  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4982  integrase catalytic subunit  31.81 
 
 		 423 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5130  integrase catalytic subunit  31.99 
 
 		 501 aa  133  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.819554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5140  integrase catalytic subunit  31.99 
 
 		 501 aa  133  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.920886  normal  0.438385 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2463  integrase catalytic subunit  31.99 
 
 		 501 aa  133  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.587911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3390  integrase catalytic subunit  31.99 
 
 		 501 aa  133  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3053  integrase catalytic subunit  31.99 
 
 		 501 aa  133  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0908  integrase catalytic subunit  31.99 
 
 		 501 aa  133  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3483  integrase catalytic subunit  31.99 
 
 		 501 aa  133  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0683  transposase  27.81 
 
 		 504 aa  131  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3338  IS100, transposase  33.23 
 
 		 340 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3487  insertion sequence transposase  32.91 
 
 		 340 aa  127  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.169046 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2171  insertion sequence transposase  32.91 
 
 		 340 aa  127  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0335942 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3280  insertion sequence transposase  32.91 
 
 		 340 aa  127  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0112823 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3672  insertion sequence transposase  32.91 
 
 		 340 aa  127  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000543988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0530  insertion sequence transposase  32.91 
 
 		 340 aa  127  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000118737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0448  insertion sequence transposase  32.91 
 
 		 340 aa  127  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.453908  hitchhiker  0.00000287146 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1294  insertion sequence transposase  32.91 
 
 		 340 aa  127  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1904  insertion sequence transposase  32.91 
 
 		 340 aa  127  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00789725 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>