155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3279 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3279  IS21 family transposase  100 
 
 
131 aa  268  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4040  hypothetical protein  67.94 
 
 
496 aa  183  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0317  transposase, IS21 family  67.94 
 
 
496 aa  184  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0223423  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2090  transposase, IS21 family  67.94 
 
 
496 aa  183  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3159  transposase, IS21 family  67.94 
 
 
496 aa  183  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0010  transposase, IS21 family  65.65 
 
 
496 aa  178  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2468  integrase catalytic subunit  60.31 
 
 
514 aa  168  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1063  Integrase catalytic region  63.28 
 
 
502 aa  162  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.877216  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2874  Integrase catalytic region  63.28 
 
 
502 aa  162  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4858  Integrase catalytic region  63.28 
 
 
502 aa  162  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0252827  normal  0.0109178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4855  Integrase catalytic region  63.28 
 
 
502 aa  162  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000769666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1052  Integrase catalytic region  63.28 
 
 
502 aa  162  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437105  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1072  Integrase catalytic region  63.28 
 
 
502 aa  162  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1139  Integrase catalytic region  63.78 
 
 
474 aa  161  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650058  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1589  Integrase catalytic region  63.28 
 
 
502 aa  162  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0943  Integrase catalytic region  63.28 
 
 
502 aa  161  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.346378  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1097  Integrase catalytic region  63.78 
 
 
474 aa  161  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.81424  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2939  Integrase catalytic region  63.28 
 
 
502 aa  161  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.620801  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6478  Integrase catalytic region  61.36 
 
 
507 aa  155  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2452  integrase catalytic region  41.28 
 
 
427 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1510  integrase catalytic region  41.28 
 
 
427 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5534  integrase catalytic region  41.28 
 
 
427 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4700  integrase catalytic region  41.28 
 
 
427 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3888  integrase catalytic region  41.28 
 
 
427 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2798  integrase catalytic region  41.28 
 
 
427 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6916  integrase catalytic region  41.28 
 
 
427 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1464  integrase catalytic region  41.28 
 
 
427 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7013  hypothetical protein  41.28 
 
 
427 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9617  transposase  30.53 
 
 
230 aa  63.9  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.106287  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1457  integrase  40.23 
 
 
410 aa  63.9  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3717  integrase catalytic subunit  33.02 
 
 
412 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1009  integrase catalytic subunit  33.02 
 
 
412 aa  60.8  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00535974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1319  integrase catalytic subunit  33.02 
 
 
412 aa  60.8  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2854  integrase catalytic subunit  33.02 
 
 
412 aa  60.8  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230802  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2538  integrase catalytic subunit  33.64 
 
 
424 aa  59.3  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178355  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5106  integrase catalytic subunit  40 
 
 
431 aa  57.4  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214322  normal  0.182706 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6841  integrase catalytic subunit  30 
 
 
257 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4458  transposase  29.37 
 
 
442 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000107543  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31560  Transposase  32.11 
 
 
341 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09530  integrase  32.11 
 
 
341 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1554  Integrase catalytic region  37.04 
 
 
413 aa  53.9  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1183  transposase  31.85 
 
 
489 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138357 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3634  putative transposase  31.85 
 
 
338 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1024  Integrase catalytic region  32.79 
 
 
430 aa  52.4  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.669349  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36480  transposase, helix-turn-helix, Fis-type  31.19 
 
 
341 aa  51.6  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49630  helix-turn-helix, Fis-type  31.19 
 
 
341 aa  51.6  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.840005  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0788  Integrase catalytic region  29.1 
 
 
282 aa  50.8  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00612306  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0210  transposase, IS21 family  26.61 
 
 
417 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000847159 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0098  IS21 family transposase  31.11 
 
 
491 aa  50.4  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.2973499999999993e-20  hitchhiker  2.05788e-63 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0036  transposase  31.11 
 
 
491 aa  50.4  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1238  transposase  31.11 
 
 
491 aa  50.1  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126413 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1305  transposase  31.11 
 
 
491 aa  50.4  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1939  transposase  31.11 
 
 
491 aa  50.4  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0012517  normal  0.673499 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2877  transposase  31.11 
 
 
491 aa  50.4  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3336  insertion sequence transposase  31.11 
 
 
491 aa  50.4  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3393  transposase  31.11 
 
 
491 aa  50.4  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.39722  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3532  transposase  31.11 
 
 
491 aa  50.4  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.0612525 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4054  transposase  31.11 
 
 
491 aa  50.4  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3338  IS100, transposase  31.11 
 
 
340 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2580  integrase catalytic region  33.06 
 
 
408 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0415627  normal  0.0862482 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0001  IS21 family transposase  31.11 
 
 
340 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122483 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0015  IS21 family transposase  31.11 
 
 
340 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0029  IS21 family transposase  31.11 
 
 
340 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0077  insertion sequence transposase  31.11 
 
 
340 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0136  insertion sequence transposase  31.11 
 
 
340 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0217084 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0314  insertion sequence transposase  31.11 
 
 
340 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.415268  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0448  insertion sequence transposase  31.11 
 
 
340 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.453908  hitchhiker  0.00000287146 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0530  insertion sequence transposase  31.11 
 
 
340 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000118737  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0634  insertion sequence transposase  31.11 
 
 
340 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0933756  normal  0.145557 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0689  insertion sequence transposase  31.11 
 
 
340 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0888  insertion sequence transposase  31.11 
 
 
340 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0176798  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1049  insertion sequence transposase  31.11 
 
 
340 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0362189  normal  0.0286616 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1294  insertion sequence transposase  31.11 
 
 
340 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1904  insertion sequence transposase  31.11 
 
 
340 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789725 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2025  insertion sequence transposase  31.11 
 
 
340 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2088  insertion sequence transposase  31.11 
 
 
340 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.207066 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2155  insertion sequence transposase  31.11 
 
 
340 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0564082  normal  0.0481856 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2171  insertion sequence transposase  31.11 
 
 
340 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0335942 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2392  insertion sequence transposase  31.11 
 
 
340 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.392902  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2527  insertion sequence transposase  31.11 
 
 
340 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2586  insertion sequence transposase  31.11 
 
 
340 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00244507  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2677  insertion sequence transposase  31.11 
 
 
340 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.585168  normal  0.0366075 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2797  insertion sequence transposase  31.11 
 
 
340 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000133045  normal  0.199341 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2905  insertion sequence transposase  31.11 
 
 
340 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00121621  normal  0.994964 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2960  insertion sequence transposase  31.11 
 
 
340 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154243 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3154  insertion sequence transposase  31.11 
 
 
340 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3216  insertion sequence transposase  31.11 
 
 
340 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000564447  normal  0.0522706 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3280  insertion sequence transposase  31.11 
 
 
340 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0112823 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3444  insertion sequence transposase  31.11 
 
 
340 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3487  insertion sequence transposase  31.11 
 
 
340 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.169046 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3672  insertion sequence transposase  31.11 
 
 
340 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000543988  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3800  insertion sequence transposase  31.11 
 
 
340 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3951  insertion sequence transposase  31.11 
 
 
340 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4125  insertion sequence transposase  31.11 
 
 
340 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.44357  normal  0.500657 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3601  Integrase catalytic region  30.17 
 
 
407 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000351603  normal  0.0699896 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3701  Integrase catalytic region  30.17 
 
 
407 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25457  normal  0.162574 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0136  integrase catalytic subunit  30.84 
 
 
434 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324788  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2833  integrase catalytic subunit  30.84 
 
 
434 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0048  IS100 transposase orfA  31.11 
 
 
340 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1441  transposase  30.37 
 
 
491 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31725  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>