More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6028 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6028  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 227 aa  456  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.67 
 
 		 252 aa  201  5e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.67 
 
 		 252 aa  201  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.225424  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0268  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.98 
 
 		 252 aa  198  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.84 
 
 		 255 aa  182  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.07 
 
 		 251 aa  155  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.58 
 
 		 224 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  33.96 
 
 		 225 aa  116  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  36.63 
 
 		 224 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  36.63 
 
 		 224 aa  115  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  33.5 
 
 		 223 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  34.21 
 
 		 227 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  33.91 
 
 		 230 aa  114  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.32 
 
 		 235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0681  protein TolQ  33.91 
 
 		 230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458824  normal  0.677661 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0696  protein TolQ  33.33 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0662  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0697  protein TolQ  33.33 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.553708  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.64 
 
 		 230 aa  112  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564154  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.37 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  32.7 
 
 		 232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.43 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.88 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0706  Tol-Pal system TolQ  32.31 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.199813  normal  0.496524 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0732  TOLQ-like transport transmembrane protein  33.91 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.682761 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3629  tolQ protein  34.13 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0862  protein TolQ  31.44 
 
 		 231 aa  105  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000829474  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2678  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.31 
 
 		 227 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0792  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.88 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4034  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.66 
 
 		 233 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.133642  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.24 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4177  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.66 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143236  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.66 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2717  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.97 
 
 		 228 aa  102  7e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169266  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2463  protein TolQ  30.64 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0263661  normal  0.458025 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1793  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.47 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.418463 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2364  protein TolQ  30.99 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.501441 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2954  transmembrane protein/ biopolymer transport  30.57 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0172322  normal  0.721905 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0785  protein TolQ  28.19 
 
 		 222 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0555571  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.67 
 
 		 209 aa  100  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.03 
 
 		 242 aa  99  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.065084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1246  colicin uptake protein TolQ  30.43 
 
 		 228 aa  98.6  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0152271  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.97 
 
 		 231 aa  99  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  28.63 
 
 		 236 aa  98.6  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.44 
 
 		 228 aa  98.2  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.44 
 
 		 228 aa  98.2  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.44 
 
 		 228 aa  98.2  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  29.44 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  29.44 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  29.44 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.96 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2261  protein TolQ  35.43 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.267713  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2771  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.43 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.978169 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0669  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  29.49 
 
 		 218 aa  96.3  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3618  protein TolQ  28.44 
 
 		 239 aa  96.3  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  30 
 
 		 228 aa  96.3  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1153  colicin uptake protein TolQ  30.74 
 
 		 228 aa  96.3  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  29.33 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29 
 
 		 228 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3115  protein TolQ  35.81 
 
 		 240 aa  96.3  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0746  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.56 
 
 		 339 aa  96.3  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.3 
 
 		 232 aa  95.9  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3090  colicin uptake protein TolQ  29.57 
 
 		 228 aa  95.5  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0237739  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1728  tolQ protein  42.37 
 
 		 228 aa  95.1  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.04 
 
 		 209 aa  95.5  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  29.87 
 
 		 228 aa  95.1  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3499  protein TolQ  28.44 
 
 		 239 aa  95.1  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0280  transport protein ExbB  31 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1276  colicin uptake protein TolQ  29.26 
 
 		 224 aa  94.7  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000244479  hitchhiker  0.000166082 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2227  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.57 
 
 		 233 aa  94.7  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260682  hitchhiker  0.000349255 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  27.95 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.923457  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2664  tolQ protein  27.95 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1946  tolQ protein  27.95 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1235  colicin uptake protein TolQ  29.78 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0719257  normal  0.246715 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3204  protein TolQ  28.44 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2078  tolQ protein  27.95 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3200  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  27.95 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.949255  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.06 
 
 		 268 aa  94.4  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.28 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0830  tolQ protein  27.95 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  30.66 
 
 		 241 aa  94.4  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0394  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.23 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.265292  hitchhiker  0.00010169 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02500  transport protein ExbB  31 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0102562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29 
 
 		 228 aa  94.4  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.09 
 
 		 232 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.928005  normal  0.316985 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3253  tolQ protein  27.95 
 
 		 262 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4062  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.43 
 
 		 236 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.508438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0672  biopolymer transport protein, TolQ  30.09 
 
 		 232 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00353274  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2905  colicin uptake protein TolQ  29.82 
 
 		 228 aa  94  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.045905  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.53 
 
 		 232 aa  92.8  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.794955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1394  colicin uptake protein TolQ  29.65 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00123539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1376  tolQ protein  27.95 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0482994  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3917  biopolymer MotA/TolQ/ExbB proton channel family transporter  30.41 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22506  normal  0.159351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4004  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.03 
 
 		 267 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.894756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2871  colicin uptake protein TolQ  29.65 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018196  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0762  protein TolQ  33.96 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167492  normal  0.258035 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3985  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.33 
 
 		 238 aa  92.8  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912211  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.33 
 
 		 238 aa  92.8  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0125924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2452  protein TolQ  33.96 
 
 		 225 aa  92.8  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.41 
 
 		 231 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>