60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4389 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4389  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 439 aa  803    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4096  outer membrane efflux protein  34.49 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.592471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  29.55 
 
 		 440 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1768  outer membrane heavy metal efflux protein, putative  27.39 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.481614  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  28.8 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  29.88 
 
 		 435 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  28.35 
 
 		 437 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  28.44 
 
 		 439 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  28.44 
 
 		 439 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0516  outer membrane efflux protein  31.18 
 
 		 413 aa  66.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  30.62 
 
 		 438 aa  65.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  30.14 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  29.02 
 
 		 471 aa  63.5  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00407  putative outer membrane cation efflux system protein  31.33 
 
 		 451 aa  62  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00236087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  26.33 
 
 		 472 aa  60.1  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1455  Outer membrane efflux protein  27.98 
 
 		 423 aa  59.3  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.170729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  26.39 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  29.69 
 
 		 438 aa  58.2  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  28.76 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  27.86 
 
 		 423 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  27.9 
 
 		 428 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  30.23 
 
 		 461 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  30.23 
 
 		 461 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  30.23 
 
 		 461 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  30.23 
 
 		 452 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  30.23 
 
 		 461 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  30.23 
 
 		 443 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1848  outer membrane efflux protein  26.05 
 
 		 423 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  30.23 
 
 		 443 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  23.64 
 
 		 437 aa  51.6  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  27.81 
 
 		 451 aa  51.6  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3343  outer membrane efflux protein  27.7 
 
 		 423 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.141208 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  24.49 
 
 		 479 aa  50.4  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4765  outer membrane efflux protein  30.26 
 
 		 485 aa  50.4  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.55701 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3557  outer membrane efflux protein  29.47 
 
 		 442 aa  50.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2185  outer membrane efflux protein  32.79 
 
 		 424 aa  49.7  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.685797  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4530  outer membrane efflux protein  25.37 
 
 		 425 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2298  outer membrane efflux protein  24.71 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2504  outer membrane efflux protein  30.64 
 
 		 436 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10477  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0292  Outer membrane efflux protein  26.17 
 
 		 432 aa  48.5  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.765252  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2705  outer membrane efflux protein  28.48 
 
 		 424 aa  48.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0425807  normal  0.885603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2142  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 423 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143725 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  31.06 
 
 		 422 aa  47.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  27.83 
 
 		 426 aa  47.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1481  outer membrane efflux protein  32.52 
 
 		 424 aa  47  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.103233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3648  outer membrane efflux protein  24.71 
 
 		 424 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  24.4 
 
 		 424 aa  47  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2209  outer membrane efflux protein  28.62 
 
 		 433 aa  46.6  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.798472  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0665  outer membrane efflux protein  24.71 
 
 		 453 aa  45.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000306808  hitchhiker  0.00231848 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  25.99 
 
 		 432 aa  45.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0294  Outer membrane efflux protein  36 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6027  nodulation protein T precursor  27.02 
 
 		 483 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  24.13 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  27.42 
 
 		 432 aa  45.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1089  outer membrane efflux protein  30.94 
 
 		 444 aa  44.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1176  Outer membrane efflux protein  29.54 
 
 		 429 aa  44.7  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  27.21 
 
 		 467 aa  43.9  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00869  outer membrane channel protein  25.62 
 
 		 445 aa  43.9  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  27.16 
 
 		 421 aa  43.5  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11693  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  22.54 
 
 		 1481 aa  43.1  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>