162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2960 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2960  putative transposase  100 
 
 
329 aa  653    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26307  normal  0.0520741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1059  putative transposase  94.53 
 
 
329 aa  588  1e-167  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1089  putative transposase  92.28 
 
 
337 aa  583  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.693638  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0802  putative transposase  92.19 
 
 
333 aa  580  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6237  putative transposase  82.9 
 
 
345 aa  560  1e-158  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62735  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0878  putative transposase  90.27 
 
 
321 aa  556  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110546  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0990  putative transposase  88.75 
 
 
321 aa  545  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.271034  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1150  putative transposase  90 
 
 
330 aa  535  1e-151  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2902  putative transposase  80.18 
 
 
335 aa  529  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2828  putative transposase  50.6 
 
 
338 aa  278  6e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.949777  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2880  hypothetical protein  40.79 
 
 
323 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149752  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1045  putative transposase  27.75 
 
 
343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0831423  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2785  hypothetical protein  29.17 
 
 
310 aa  133  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2781  hypothetical protein  31 
 
 
314 aa  132  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664556  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2623  hypothetical protein  29.08 
 
 
322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0276584  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2698  hypothetical protein  28.83 
 
 
318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2547  hypothetical protein  30.4 
 
 
314 aa  125  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0376053  normal  0.0608447 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1963  putative transposase  28.14 
 
 
331 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0706346  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1994  putative transposase  27.88 
 
 
319 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.735151 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0691  putative transposase  92.31 
 
 
67 aa  123  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.76792  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2830  hypothetical protein  86.96 
 
 
85 aa  120  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.362282  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2863  hypothetical protein  29.08 
 
 
322 aa  119  7.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0523  hypothetical protein  32.86 
 
 
311 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1108  putative transposase  26.51 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0520  hypothetical protein  31.86 
 
 
307 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0539  hypothetical protein  32.51 
 
 
311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1034  hypothetical protein  25.08 
 
 
312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0529  hypothetical protein  32.86 
 
 
311 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3166  putative transposase YhgA family protein  29.67 
 
 
317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0894  hypothetical protein  36 
 
 
308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.284853 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0628  hypothetical protein  24.92 
 
 
327 aa  104  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.939458  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0045  hypothetical protein  28.79 
 
 
341 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.242935 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0911  putative transposase YhgA family protein  30.9 
 
 
298 aa  103  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0492  hypothetical protein  24.15 
 
 
312 aa  103  4e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2307  hypothetical protein  29.8 
 
 
321 aa  103  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000450312  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1250  hypothetical protein  24.68 
 
 
331 aa  102  8e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3726  putative transposase  28.86 
 
 
310 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2289  hypothetical protein  33.85 
 
 
333 aa  97.4  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0492229  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1429  putative transposase YhgA family protein  27.33 
 
 
302 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00131  predicted transposase  27.68 
 
 
300 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3470  putative transposase YhgA family protein  27.68 
 
 
300 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3527  putative transposase YhgA family protein  27.68 
 
 
300 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.653665  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4766  hypothetical protein  28.75 
 
 
334 aa  94  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00130  hypothetical protein  27.68 
 
 
300 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.969091  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4885  hypothetical protein  29.34 
 
 
318 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287711  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0135  hypothetical protein  27.68 
 
 
300 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0125  hypothetical protein  28.16 
 
 
298 aa  93.2  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0658  putative transposase  26.12 
 
 
332 aa  92.8  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000193277 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4072  putative transposase  25.23 
 
 
340 aa  92.8  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1702  hypothetical protein  26.17 
 
 
326 aa  92  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.412934  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0141  hypothetical protein  27.8 
 
 
298 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3878  hypothetical protein  27.78 
 
 
308 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0068  putative transposase  28.99 
 
 
296 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.565138  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0599  putative transposase YhgA family protein  31.52 
 
 
318 aa  91.3  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2267  hypothetical protein  30.46 
 
 
360 aa  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4028  putative transposase  24.92 
 
 
340 aa  90.5  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0086  putative transposase  28.57 
 
 
319 aa  90.9  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864811  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0084  hypothetical protein  28.57 
 
 
319 aa  90.9  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4129  putative transposase YhgA family protein  28.57 
 
 
319 aa  90.9  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.683023  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4014  putative transposase  25.94 
 
 
332 aa  90.1  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.456112  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4059  putative transposase  26.03 
 
 
332 aa  90.5  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.860661 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1504  putative transposase  31.31 
 
 
350 aa  90.1  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1606  hypothetical protein  24.12 
 
 
307 aa  90.1  5e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1121  hypothetical protein  25.81 
 
 
314 aa  89.4  7e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2461  hypothetical protein  30.06 
 
 
300 aa  89.4  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.171355  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0039  transposase  26.64 
 
 
316 aa  88.2  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4566  hypothetical protein  28.73 
 
 
314 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0302  putative transposase YhgA family protein  28.57 
 
 
292 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.78914  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04729  hypothetical protein  30.15 
 
 
309 aa  87.8  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1247  hypothetical protein  22.32 
 
 
336 aa  87.4  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3724  putative transposase YhgA family protein  28.42 
 
 
314 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3792  hypothetical protein  28.57 
 
 
292 aa  87.4  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04207  predicted transposase  30.94 
 
 
255 aa  87  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3445  hypothetical protein  30.17 
 
 
296 aa  87  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.143681  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3973  hypothetical protein  28.08 
 
 
309 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4045  hypothetical protein  28.08 
 
 
309 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal  0.0374243 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4718  hypothetical protein  28.57 
 
 
292 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1543  hypothetical protein  26.64 
 
 
323 aa  86.3  6e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0740  hypothetical protein  26.4 
 
 
323 aa  86.3  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.559811  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0142  ISNCY family transposase  27.74 
 
 
306 aa  86.3  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1351  putative transposase YhgA family protein  30 
 
 
296 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0581087  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1347  putative transposase YhgA family protein  30 
 
 
296 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0644465  normal  0.765955 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02230  hypothetical protein  29.63 
 
 
296 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.326611  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03263  predicted transposase  28.21 
 
 
292 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.100095  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0238  hypothetical protein  28.44 
 
 
344 aa  85.1  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.447255  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3707  hypothetical protein  28.12 
 
 
304 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3710  hypothetical protein  28.12 
 
 
304 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3608  hypothetical protein  28.21 
 
 
292 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2599  hypothetical protein  29.63 
 
 
296 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00513302  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02190  hypothetical protein  29.63 
 
 
296 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.428095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0302  hypothetical protein  28.21 
 
 
292 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.094929  normal  0.0909002 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3692  hypothetical protein  28.21 
 
 
292 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03215  hypothetical protein  28.21 
 
 
292 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0821559  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3782  hypothetical protein  28.22 
 
 
304 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3816  hypothetical protein  28.12 
 
 
304 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.792275 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0147  hypothetical protein  32.79 
 
 
141 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.320665  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3886  hypothetical protein  28.21 
 
 
292 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1722  hypothetical protein  27.27 
 
 
308 aa  84.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000483242  normal  0.789674 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2397  hypothetical protein  27.42 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3382  hypothetical protein  27.7 
 
 
308 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>