35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0691 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0691  putative transposase  100 
 
 
67 aa  135  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.76792  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2960  putative transposase  92.31 
 
 
329 aa  123  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26307  normal  0.0520741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1059  putative transposase  92.31 
 
 
329 aa  123  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2902  putative transposase  90.77 
 
 
335 aa  122  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1089  putative transposase  89.23 
 
 
337 aa  120  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.693638  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0802  putative transposase  89.23 
 
 
333 aa  120  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6237  putative transposase  87.69 
 
 
345 aa  119  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62735  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0878  putative transposase  89.23 
 
 
321 aa  119  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110546  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0990  putative transposase  89.23 
 
 
321 aa  117  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.271034  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2830  hypothetical protein  86.15 
 
 
85 aa  113  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.362282  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1150  putative transposase  89.29 
 
 
330 aa  103  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2828  putative transposase  56.25 
 
 
338 aa  75.1  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.949777  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2880  hypothetical protein  48.44 
 
 
323 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149752  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0894  hypothetical protein  38.98 
 
 
308 aa  48.1  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.284853 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0039  transposase  38.6 
 
 
316 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0029  transposase  42.11 
 
 
320 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0147  hypothetical protein  31.15 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.320665  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4566  hypothetical protein  42.37 
 
 
314 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0523  hypothetical protein  34.38 
 
 
311 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04207  predicted transposase  42.37 
 
 
255 aa  40.8  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04170  hypothetical protein  42.37 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.858892  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1400  putative transposase  33.33 
 
 
301 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429556  normal  0.22922 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3166  putative transposase YhgA family protein  32.26 
 
 
317 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1398  putative transposase  33.33 
 
 
289 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3724  putative transposase YhgA family protein  40.68 
 
 
314 aa  40.8  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02230  hypothetical protein  38.98 
 
 
296 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.326611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2599  hypothetical protein  38.98 
 
 
296 aa  40.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00513302  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4885  hypothetical protein  42.37 
 
 
318 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287711  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02190  hypothetical protein  38.98 
 
 
296 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.428095  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3445  hypothetical protein  38.98 
 
 
296 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.143681  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1347  putative transposase YhgA family protein  38.98 
 
 
296 aa  40.4  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0644465  normal  0.765955 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1722  hypothetical protein  31.58 
 
 
308 aa  40  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000483242  normal  0.789674 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1351  putative transposase YhgA family protein  38.98 
 
 
296 aa  40.4  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0581087  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2461  hypothetical protein  38.98 
 
 
300 aa  40  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.171355  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4766  hypothetical protein  40.68 
 
 
334 aa  40  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>