14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2830 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2830  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  168  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.362282  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1059  putative transposase  87.14 
 
 
329 aa  122  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2960  putative transposase  87.14 
 
 
329 aa  122  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26307  normal  0.0520741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2902  putative transposase  85.71 
 
 
335 aa  120  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0802  putative transposase  84.29 
 
 
333 aa  119  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0878  putative transposase  84.29 
 
 
321 aa  118  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110546  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1089  putative transposase  81.43 
 
 
337 aa  118  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.693638  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0990  putative transposase  82.86 
 
 
321 aa  115  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.271034  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6237  putative transposase  80 
 
 
345 aa  114  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62735  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0691  putative transposase  86.15 
 
 
67 aa  113  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.76792  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1150  putative transposase  83.61 
 
 
330 aa  103  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2828  putative transposase  55.07 
 
 
338 aa  78.2  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.949777  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2880  hypothetical protein  50 
 
 
323 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149752  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0894  hypothetical protein  36.23 
 
 
308 aa  46.6  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.284853 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>