More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1816 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1816  recA protein  100 
 
 		 375 aa  756    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.54195  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  67.39 
 
 		 348 aa  466  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  68.35 
 
 		 355 aa  463  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  65.12 
 
 		 361 aa  458  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  65.12 
 
 		 424 aa  459  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  65.41 
 
 		 361 aa  459  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  69.23 
 
 		 350 aa  456  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  66.77 
 
 		 343 aa  454  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  68.44 
 
 		 345 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  68.44 
 
 		 345 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  66.77 
 
 		 365 aa  449  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  64.55 
 
 		 362 aa  449  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  62.78 
 
 		 364 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  64.55 
 
 		 361 aa  449  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  64.53 
 
 		 390 aa  449  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  67.19 
 
 		 362 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  62.39 
 
 		 363 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0440  recombinase A  62.6 
 
 		 358 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  64.4 
 
 		 347 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3750  recA protein  70.66 
 
 		 340 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.79987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1288  recombinase A  65.19 
 
 		 348 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  62.1 
 
 		 363 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  66.67 
 
 		 379 aa  446  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  67.72 
 
 		 360 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  65.33 
 
 		 363 aa  442  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  65.94 
 
 		 361 aa  443  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  65.94 
 
 		 342 aa  444  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  63.13 
 
 		 356 aa  442  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  64.87 
 
 		 362 aa  442  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  64.31 
 
 		 360 aa  441  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  64.11 
 
 		 357 aa  441  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  65.31 
 
 		 362 aa  440  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0387  recA protein  69.61 
 
 		 347 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1523  recombinase A  64.58 
 
 		 346 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  65.71 
 
 		 343 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  62.61 
 
 		 348 aa  439  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  62.61 
 
 		 348 aa  439  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0727  recombinase A  65.94 
 
 		 347 aa  441  9.999999999999999e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.794192  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  65.51 
 
 		 366 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1981  recombinase A  65.94 
 
 		 349 aa  440  9.999999999999999e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686398 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  63.03 
 
 		 363 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  63.58 
 
 		 358 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  59.15 
 
 		 362 aa  441  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38560  recombinase A  65.71 
 
 		 349 aa  438  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17530  recombinase A  64.58 
 
 		 346 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  65.71 
 
 		 348 aa  439  9.999999999999999e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4134  recA protein  62.46 
 
 		 345 aa  436  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00773385  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  64.4 
 
 		 362 aa  437  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  60.93 
 
 		 364 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  61.34 
 
 		 346 aa  436  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  63.29 
 
 		 358 aa  437  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0623  recA protein  62.17 
 
 		 352 aa  436  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.306263  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1231  recombinase A  63.89 
 
 		 355 aa  434  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000000176903 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  63.78 
 
 		 336 aa  436  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  64.33 
 
 		 356 aa  437  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0711  recombinase A  65.19 
 
 		 345 aa  435  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  62.25 
 
 		 364 aa  433  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1629  recombinase A  63.58 
 
 		 355 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.849206  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0814  recombinase A  64.2 
 
 		 356 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  63.41 
 
 		 343 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0272  recombinase A  64.2 
 
 		 356 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1378  recombinase A  64.53 
 
 		 354 aa  431  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0217782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4088  recombinase A  63.58 
 
 		 355 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  64.2 
 
 		 356 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1175  recombinase A  63.1 
 
 		 352 aa  434  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  62.35 
 
 		 345 aa  432  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0810  recombinase A  64.2 
 
 		 356 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  63.38 
 
 		 365 aa  432  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  62.85 
 
 		 358 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3964  RecA protein  58.82 
 
 		 358 aa  431  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4030  recombinase A  63.3 
 
 		 355 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.104307  unclonable  0.0000000000000597568 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2601  recA protein  66.56 
 
 		 366 aa  434  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.2342 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  60.77 
 
 		 357 aa  434  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0070  recombinase A  62.83 
 
 		 354 aa  431  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3015  recombinase A  63.66 
 
 		 347 aa  433  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.514179  hitchhiker  0.000000000000973321 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1303  recombinase A  64.71 
 
 		 355 aa  433  1e-120  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2629  recA protein  65.94 
 
 		 366 aa  432  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2082  recombinase A  60.76 
 
 		 347 aa  431  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2672  recombinase A  64.2 
 
 		 356 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.996925  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2404  recombinase A  64.2 
 
 		 356 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0017  recombinase A  64.2 
 
 		 356 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2824  recA protein  66.56 
 
 		 366 aa  434  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217843  normal  0.126726 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  65.94 
 
 		 358 aa  434  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0650  recombinase A  64.07 
 
 		 357 aa  430  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0881  recombinase A  64 
 
 		 343 aa  429  1e-119  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.115374  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03513  recombinase A  63.22 
 
 		 354 aa  429  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1732  recombinase A  65.91 
 
 		 352 aa  429  1e-119  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0649106  normal  0.0921204 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  64.67 
 
 		 338 aa  430  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0643  recombinase A  63.61 
 
 		 356 aa  431  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.940587  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  63.98 
 
 		 345 aa  428  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  63.08 
 
 		 347 aa  428  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  60.47 
 
 		 357 aa  431  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2014  recombinase A  65.91 
 
 		 352 aa  429  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.306298 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0988  recombinase A  64 
 
 		 343 aa  429  1e-119  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  64.42 
 
 		 359 aa  429  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2699  recombinase A  63.1 
 
 		 359 aa  428  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2652  recombinase A  64.71 
 
 		 356 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1215  recombinase A  62.99 
 
 		 353 aa  430  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1046  recombinase A  64.8 
 
 		 355 aa  428  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.558521 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4075  recA protein  61.59 
 
 		 358 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>