207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1450 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1450  sodium/calcium exchanger membrane region  100 
 
 
355 aa  685    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.879027  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1499  sodium/calcium exchanger membrane region  54.95 
 
 
339 aa  330  3e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3907  sodium/calcium exchanger membrane region  50.73 
 
 
341 aa  308  6.999999999999999e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.93815 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1223  Sodium/calcium exchanger membrane region  47.29 
 
 
339 aa  276  4e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12780  Ca2+/Na+ antiporter  46.63 
 
 
345 aa  246  3e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.63097  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1849  sodium/calcium exchanger membrane region  45.59 
 
 
361 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.353414 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0538  sodium/calcium exchanger membrane region  45.33 
 
 
347 aa  243  5e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.367585  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0449  sodium/calcium exchanger membrane region  45.61 
 
 
347 aa  242  6e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.589797  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4761  sodium/calcium exchanger membrane region  31.82 
 
 
357 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.788461  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6944  sodium/calcium exchanger membrane region  35.06 
 
 
315 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1175  sodium/calcium exchanger membrane region  28.95 
 
 
348 aa  123  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.606796  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2983  sodium/calcium exchanger membrane region  35.2 
 
 
334 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.39585  normal  0.0260778 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4299  sodium/calcium exchanger membrane region  31.88 
 
 
357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2147  sodium/calcium exchanger membrane region  32.29 
 
 
335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3609  sodium/calcium exchanger membrane region  31.83 
 
 
336 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.722589 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1133  sodium/calcium exchanger membrane protein  31.94 
 
 
334 aa  110  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000089866  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3080  sodium/calcium exchanger membrane protein  32.26 
 
 
334 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.036167  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0274  sodium/calcium exchanger membrane region  27.36 
 
 
343 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0384  sodium/calcium exchanger membrane region  31.42 
 
 
336 aa  102  9e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3831  cation antiporter (Na+/Ca2+)  31.94 
 
 
334 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151042 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0501  Ca2+/H+ antiporter  29.74 
 
 
338 aa  92.4  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1122  sodium/calcium exchanger membrane region  28.08 
 
 
338 aa  90.9  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0850  cation transporter, putative  29.64 
 
 
340 aa  87  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.495798  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20130  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  29.03 
 
 
356 aa  77.4  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1577  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.54 
 
 
311 aa  71.6  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00101794  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2416  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  29.17 
 
 
324 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0831  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  27.54 
 
 
314 aa  64.7  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00973668  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0851  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  42.57 
 
 
364 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1366  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  27.44 
 
 
320 aa  63.2  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2477  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  31.64 
 
 
334 aa  62.8  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0302192  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3670  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  29.1 
 
 
321 aa  62.8  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000078626 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1817  calcium/proton exchanger  33.12 
 
 
331 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.378438  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0590  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  27 
 
 
296 aa  61.6  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03187  sodium-calcium exchanger  25.77 
 
 
318 aa  61.6  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3625  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  41.67 
 
 
326 aa  61.6  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0804  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  32.4 
 
 
335 aa  60.8  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1147  putative calcium/sodium:proton antiporter  24.62 
 
 
324 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0447  putative calcium/sodium:proton antiporter  24.62 
 
 
324 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.597372  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0511  putative calcium/sodium:proton antiporter  24.62 
 
 
324 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2109  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  37.25 
 
 
322 aa  59.7  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.125049  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0181  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  28.73 
 
 
329 aa  59.7  0.00000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00253398  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1072  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  25.56 
 
 
308 aa  59.3  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.301699  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0242  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  27.16 
 
 
369 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217484  normal  0.542951 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1536  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  30.22 
 
 
331 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.153216  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1078  sodium/calcium exchange protein  25.97 
 
 
323 aa  59.3  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00151135  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0562  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  33.33 
 
 
320 aa  58.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0360  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  35.71 
 
 
309 aa  58.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4361  putative calcium/sodium:proton antiporter  26.54 
 
 
325 aa  58.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.17672  normal  0.104496 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3503  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  40.28 
 
 
310 aa  58.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3883  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  33 
 
 
307 aa  58.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.150856  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5993  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  40.62 
 
 
322 aa  58.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1539  inner membrane protein  50 
 
 
318 aa  57.8  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.544691  normal  0.292097 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2051  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  38.36 
 
 
324 aa  57.8  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3841  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  28.47 
 
 
357 aa  57.4  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06321  CaCA family sodium/calcium exchanger  35.19 
 
 
359 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0642  Na+/Ca+ antiporter  29.89 
 
 
312 aa  57.4  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0330  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  42.37 
 
 
310 aa  56.6  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0502313 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0430  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  28.8 
 
 
348 aa  56.6  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3171  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  28.46 
 
 
327 aa  56.2  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.71951 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4588  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  40.68 
 
 
310 aa  56.2  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.902154  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002408  YrbG protein  30.88 
 
 
321 aa  56.2  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.411327  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4537  putative sodium/calcium exchanger protein  26.75 
 
 
326 aa  56.2  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2262  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  26.62 
 
 
328 aa  55.8  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.436095  normal  0.508366 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2404  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  35.85 
 
 
357 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2224  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  53.7 
 
 
327 aa  55.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1174  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  30 
 
 
304 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1369  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  28.18 
 
 
326 aa  55.1  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0468574  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02649  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  32.35 
 
 
204 aa  55.1  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000211636  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0716  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  39.77 
 
 
330 aa  54.7  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2093  sodium/calcium exchanger protein  32.37 
 
 
343 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0504  sodium/calcium exchanger protein  35.24 
 
 
322 aa  54.3  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03659  hypothetical protein  29.63 
 
 
321 aa  54.7  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2577  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  25.73 
 
 
320 aa  54.7  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0348  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  33 
 
 
314 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268506  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1962  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  28.14 
 
 
323 aa  54.3  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0350  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  33 
 
 
314 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.25399  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0355  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  33 
 
 
314 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000157551  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1616  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  43.24 
 
 
312 aa  53.9  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4477  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  35.05 
 
 
343 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3921  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  31.62 
 
 
316 aa  53.9  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0890  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  25.1 
 
 
358 aa  53.5  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000303038  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2522  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  48.72 
 
 
314 aa  53.5  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3173  putative sodium/calcium exchanger protein  26.81 
 
 
331 aa  53.5  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222381  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3438  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  31.73 
 
 
310 aa  53.5  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.852406  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0358  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  33 
 
 
314 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000561801  decreased coverage  0.00000000752949 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1784  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.47 
 
 
320 aa  53.5  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000163312 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0549  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  41.38 
 
 
324 aa  53.1  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.240591 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2414  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  37.76 
 
 
332 aa  53.1  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1188  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  27.97 
 
 
325 aa  53.1  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354687  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0509  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  42.37 
 
 
324 aa  53.1  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0115  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  27.8 
 
 
320 aa  53.1  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00802895  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0203  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.83 
 
 
309 aa  53.1  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.42407  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0205  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.83 
 
 
309 aa  53.1  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.638827  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0833  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger protein  41.54 
 
 
353 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168882  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1742  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  32.41 
 
 
325 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0365853  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1591  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.1 
 
 
318 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0780094  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2992  sodium/calcium exchanger membrane region  42.99 
 
 
274 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0192504  normal  0.0940399 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0521  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  27.03 
 
 
318 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.10267  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0610  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.47 
 
 
320 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.011039  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3082  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  31.11 
 
 
320 aa  51.6  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.389731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>