47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3157 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_3157  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  645    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3270  membrane protein-like protein  49.38 
 
 
337 aa  276  3e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0042  hypothetical protein  49.7 
 
 
336 aa  275  5e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0273863 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1408  hypothetical protein  47.43 
 
 
337 aa  272  6e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0552  hypothetical protein  50 
 
 
339 aa  270  2e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1405  hypothetical protein  44.91 
 
 
338 aa  260  2e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.52985  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1066  hypothetical protein  30.2 
 
 
234 aa  86.7  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0448  hypothetical protein  30 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1689  YpdC  31.22 
 
 
224 aa  78.2  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1250  hypothetical protein  30.54 
 
 
228 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0976  hypothetical protein  35.89 
 
 
229 aa  75.9  0.0000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0255663  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2176  hypothetical protein  29.35 
 
 
224 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05830  predicted membrane protein  27.27 
 
 
226 aa  67.4  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.42901  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02140  predicted membrane protein  31.55 
 
 
205 aa  67.8  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1256  hypothetical protein  34.59 
 
 
407 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5989  membrane protein-like protein  30.98 
 
 
445 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.112909 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3589  hypothetical protein  27.23 
 
 
313 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0829  FHA domain containing protein  32.09 
 
 
439 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00203514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0319  membrane protein-like protein  29.02 
 
 
502 aa  58.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495235  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0276  membrane protein-like protein  29.17 
 
 
502 aa  58.9  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0292908 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3715  hypothetical protein  31.94 
 
 
369 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4278  membrane protein-like protein  29.48 
 
 
404 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277261  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0328  membrane protein-like protein  31.05 
 
 
216 aa  56.2  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00221731  hitchhiker  0.00778453 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2583  putative integral membrane protein  30.47 
 
 
327 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.003396 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2739  membrane protein-like protein  31.75 
 
 
408 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1722  membrane protein-like protein  28.09 
 
 
218 aa  54.7  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1820  membrane protein-like protein  33.75 
 
 
411 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.335053  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08850  predicted membrane protein  27.24 
 
 
390 aa  53.1  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0749641  normal  0.0331265 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_961  hypothetical protein  29.41 
 
 
273 aa  50.4  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0043963  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0323  hypothetical protein  28.27 
 
 
442 aa  50.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35570  predicted membrane protein  25.29 
 
 
369 aa  47.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00968721  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0746  membrane protein  37.33 
 
 
389 aa  46.6  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1143  hypothetical protein  30.88 
 
 
273 aa  47  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0307  FHA domain-containing protein  33.67 
 
 
444 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0972  membrane protein-like protein  26.91 
 
 
287 aa  46.2  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000387152  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13920  predicted membrane protein  29.52 
 
 
437 aa  45.8  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0156682  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1254  hypothetical protein  25.93 
 
 
347 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1365  putative integral membrane protein  30.34 
 
 
377 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3033  membrane protein  34.48 
 
 
388 aa  44.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0633  hypothetical protein  24.65 
 
 
267 aa  44.3  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000160183  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0448  hypothetical protein  27.1 
 
 
252 aa  43.5  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2216  membrane protein-like protein  26.82 
 
 
397 aa  43.5  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000105763  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2502  FHA domain containing protein  24.73 
 
 
435 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3055  hypothetical protein  26.73 
 
 
392 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3009  hypothetical protein  26.73 
 
 
392 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1522  membrane protein-like protein  32.31 
 
 
374 aa  42.7  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6011  membrane protein-like protein  30.71 
 
 
406 aa  42.4  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111505  normal  0.791396 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>