157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2508 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2508  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
627 aa  1259    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2445  histidine kinase HAMP region domain protein  47.16 
 
 
659 aa  499  1e-140  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2444  histidine kinase HAMP region domain protein  45.88 
 
 
647 aa  496  1e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3308  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.95 
 
 
1064 aa  256  1.0000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1253  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.83 
 
 
931 aa  251  3e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1386  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33 
 
 
867 aa  243  7e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0478  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.77 
 
 
859 aa  241  2e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3334  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.77 
 
 
887 aa  223  9e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.47 
 
 
816 aa  197  6e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0233266  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.88 
 
 
775 aa  181  4e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.733388 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0447  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.52 
 
 
760 aa  177  4e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.58462  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.54 
 
 
988 aa  163  7e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.51 
 
 
819 aa  159  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2681  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.39 
 
 
767 aa  152  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.470169 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3664  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.92 
 
 
753 aa  145  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2382  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.55 
 
 
871 aa  144  6e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.115192  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2639  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.42 
 
 
864 aa  142  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0307  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.91 
 
 
783 aa  140  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2424  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.02 
 
 
809 aa  138  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.052407 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3145  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.13 
 
 
832 aa  137  5e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.390275  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0084  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.34 
 
 
571 aa  118  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.99 
 
 
553 aa  101  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2509  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.01 
 
 
627 aa  99  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1635  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.88 
 
 
529 aa  89.4  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3112  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.52 
 
 
650 aa  82.4  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.579534  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2290  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.12 
 
 
603 aa  81.3  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.400791 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1087  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.07 
 
 
529 aa  79  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.766916  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1483  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.32 
 
 
494 aa  71.6  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.45 
 
 
518 aa  70.1  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.901147  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.06 
 
 
890 aa  65.5  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0271774 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.36 
 
 
628 aa  64.3  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2255  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35 
 
 
521 aa  63.9  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.626762 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.26 
 
 
664 aa  63.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0344435  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.22 
 
 
640 aa  59.7  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43692  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2737  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.12 
 
 
452 aa  58.9  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00060467  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0088  methyl-accepting chemotaxis protein  20.25 
 
 
666 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0943  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.31 
 
 
793 aa  58.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.27721  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2304  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  19.59 
 
 
713 aa  57.8  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4841  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  20.74 
 
 
666 aa  57.8  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1487  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.17 
 
 
659 aa  57.4  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000879913  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5156  methyl-accepting chemotaxis protein  19.94 
 
 
666 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.99909  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1510  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.65 
 
 
751 aa  55.8  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.795012  normal  0.0658131 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2162  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.58 
 
 
665 aa  55.1  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3638  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.58 
 
 
576 aa  55.1  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.01 
 
 
689 aa  55.1  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.63678  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5162  methyl-accepting chemotaxis protein  21.05 
 
 
666 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5151  methyl-accepting chemotaxis protein  21.6 
 
 
666 aa  54.3  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  31.37 
 
 
644 aa  54.3  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4739  methyl-accepting chemotaxis protein  20.74 
 
 
666 aa  53.9  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.96 
 
 
654 aa  53.9  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000706955  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002587  chitin catabolic cascade sensor histidine kinase ChiS  28 
 
 
1111 aa  53.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1266  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.68 
 
 
822 aa  53.5  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1355  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.51 
 
 
494 aa  53.5  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5124  methyl-accepting chemotaxis protein  20.86 
 
 
669 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4882  methyl-accepting chemotaxis protein  20.86 
 
 
666 aa  52.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4724  methyl-accepting chemotaxis protein  20.86 
 
 
666 aa  52.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5256  methyl-accepting chemotaxis protein  20.86 
 
 
666 aa  52.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0594583  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1681  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.82 
 
 
556 aa  52.8  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19740  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.4 
 
 
667 aa  52.4  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3226  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.12 
 
 
732 aa  51.2  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000536436  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5515  chemotaxis sensory transducer  22.37 
 
 
658 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.501051  normal  0.584272 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2460  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.53 
 
 
592 aa  50.8  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.814003  normal  0.142191 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.45 
 
 
458 aa  50.8  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0117  methyl-accepting chemotaxis protein  22.95 
 
 
658 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.17 
 
 
458 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.85 
 
 
454 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0680  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.88 
 
 
679 aa  50.1  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.84 
 
 
768 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04800  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.64 
 
 
658 aa  50.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21590  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.12 
 
 
500 aa  50.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0071  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  22.85 
 
 
658 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0379  methyl-accepting chemotaxis protein  25.75 
 
 
579 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  26.2 
 
 
449 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  0.0000000026524 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1248  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.7 
 
 
417 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03422  hypothetical protein  27.42 
 
 
1128 aa  48.9  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  24.02 
 
 
458 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  24.77 
 
 
1142 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.380177 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0806  methyl-accepting chemotaxis protein  22.1 
 
 
842 aa  49.3  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4013  methyl-accepting chemotaxis protein  25.53 
 
 
756 aa  49.3  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0389  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.36 
 
 
729 aa  48.5  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 
449 aa  48.5  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0909  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.54 
 
 
754 aa  48.5  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0081  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 
571 aa  48.5  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.21 
 
 
820 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3341  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  24.32 
 
 
1142 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.33 
 
 
449 aa  47.4  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3093  methyl-accepting chemotaxis protein  24.55 
 
 
576 aa  47.4  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1543  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.73 
 
 
947 aa  47.4  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.393804  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  23.94 
 
 
658 aa  47.4  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0499  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  25.96 
 
 
933 aa  47.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.292591  normal  0.21261 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1693  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.64 
 
 
598 aa  47.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0850375  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0727  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.03 
 
 
559 aa  47  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0400  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.17 
 
 
843 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170819 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0236  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.11 
 
 
660 aa  46.6  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105118  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0515  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.69 
 
 
656 aa  47  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.39 
 
 
730 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.25 
 
 
785 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0457  sensor histidine kinase  29.51 
 
 
484 aa  47  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889324 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0599  putative sensor with HAMP domain  21.95 
 
 
623 aa  46.6  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.396658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4401  sensor histidine kinase  29.51 
 
 
484 aa  45.8  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>