183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1575 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1575  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 342 aa  710    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.47256 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1576  Radical SAM domain protein  54.08 
 
 		 423 aa  369  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5485  Radical SAM domain protein  42.31 
 
 		 316 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.269586 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2193  Radical SAM domain protein  40.32 
 
 		 336 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00124948 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2299  radical SAM domain-containing protein  33.45 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.002919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2078  hypothetical protein  33.88 
 
 		 182 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.583376 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1167  radical SAM family protein  36.6 
 
 		 261 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000379498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1782  radical SAM domain-containing protein  35 
 
 		 281 aa  105  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.425379  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0327  Radical SAM domain protein  25.62 
 
 		 281 aa  99  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0959  radical SAM domain-containing protein  27.86 
 
 		 258 aa  96.7  5e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00609549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0182  radical SAM domain-containing protein  30.85 
 
 		 256 aa  95.5  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0739  Radical SAM domain protein  29.81 
 
 		 245 aa  94.7  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.93142  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0556  Radical SAM domain protein  32.66 
 
 		 258 aa  92.4  9e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.162631  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03695  radical SAM domain protein  28.22 
 
 		 356 aa  89.4  8e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1946  radical SAM domain-containing protein  32.43 
 
 		 437 aa  86.3  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041965 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1409  radical SAM domain-containing protein  33 
 
 		 267 aa  85.9  9e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47505  normal  0.209816 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2403  radical SAM domain-containing protein  33.85 
 
 		 389 aa  85.9  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3135  radical SAM family protein  33 
 
 		 365 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0196  radical SAM domain-containing protein  33.87 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1693  Radical SAM domain protein  33.67 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0268  radical SAM domain-containing protein  29.53 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.698085  normal  0.0396119 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0286  radical SAM domain-containing protein  34.59 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3951  radical SAM domain-containing protein  33.16 
 
 		 360 aa  83.2  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2814  Radical SAM domain protein  29.1 
 
 		 343 aa  83.2  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2479  Radical SAM domain protein  35.79 
 
 		 368 aa  82.4  0.000000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.874205  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1419  radical SAM domain-containing protein  31.72 
 
 		 359 aa  82.4  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0387  hypothetical protein  33.33 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1769  Radical SAM domain protein  28.71 
 
 		 352 aa  82  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1206  radical SAM family protein  33.51 
 
 		 393 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649327 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0399  hypothetical protein  33.33 
 
 		 390 aa  82.4  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2719  Radical SAM domain protein  29.1 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1080  radical SAM family protein  33.51 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981176  normal  0.301506 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1225  Radical SAM domain protein  33.51 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2459  hypothetical protein  26.64 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0853217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3183  Radical SAM domain protein  29.02 
 
 		 370 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2341  hypothetical protein  32.31 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1991  radical SAM domain-containing protein  27 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4362  radical SAM family protein  33.15 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1252  radical SAM domain-containing protein  30.43 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1926  radical SAM domain-containing protein  31 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0235565 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2161  radical SAM domain-containing protein  28.8 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0231722 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2600  DNA repair photolyase  31.79 
 
 		 386 aa  79.3  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.64054  normal  0.361396 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2862  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 383 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22952  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0406  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 374 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2549  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 385 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0923  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 385 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0224  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 385 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2972  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 385 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1725  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 		 349 aa  79  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2906  radical SAM family protein  28.4 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0630267 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2923  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 385 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0547  radical SAM domain-containing protein  30.1 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0937  hypothetical protein  31.89 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388526  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0742  radical SAM family protein  31 
 
 		 361 aa  78.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.669971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0704  radical SAM family protein  32.61 
 
 		 384 aa  78.2  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.503182  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0556  Radical SAM domain protein  33.51 
 
 		 359 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0767  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 		 386 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.338567 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4466  radical SAM domain-containing protein  29.7 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0452  radical SAM domain-containing protein  31.79 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0508  radical SAM domain-containing protein  32.26 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233922  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0334  Radical SAM domain protein  29.9 
 
 		 357 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0083  radical SAM family protein  31.16 
 
 		 352 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3222  radical SAM family protein  31.28 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0620  radical SAM family Fe-S protein  30.77 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2190  radical SAM domain-containing protein  29.53 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0946  radical SAM domain-containing protein  31.79 
 
 		 392 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1963  radical SAM domain-containing protein  26.99 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.003672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2176  radical SAM domain-containing protein  30.85 
 
 		 372 aa  76.6  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2980  Radical SAM domain protein  32.31 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0187919 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2545  radical SAM family protein  30 
 
 		 417 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4180  radical SAM family protein  31.79 
 
 		 391 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1658  radical SAM domain-containing protein  32.32 
 
 		 376 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2803  radical SAM domain-containing protein  32.84 
 
 		 402 aa  76.3  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.246146 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2293  Radical SAM domain protein  32.84 
 
 		 385 aa  76.3  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.972622  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0587  radical SAM family protein  31.79 
 
 		 392 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1066  radical SAM domain-containing protein  31.79 
 
 		 392 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1011  radical SAM domain-containing protein  30.88 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1025  radical SAM domain-containing protein  31.79 
 
 		 388 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1768  radical SAM domain-containing protein  32.8 
 
 		 374 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.938086 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4818  Radical SAM domain protein  27.86 
 
 		 350 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2104  Radical SAM domain protein  31.79 
 
 		 380 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124136  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0942  radical SAM domain-containing protein  31.28 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1808  Radical SAM domain protein  28.49 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0645523  normal  0.369217 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1829  radical SAM domain-containing protein  28.31 
 
 		 276 aa  75.5  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1743  Radical SAM domain protein  32.8 
 
 		 375 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.106017  normal  0.444535 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4284  Radical SAM domain protein  27.75 
 
 		 352 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1472  Radical SAM domain protein  30.32 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0561  Radical SAM domain protein  30.77 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4095  radical SAM domain-containing protein  30.81 
 
 		 362 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3317  radical SAM domain-containing protein  29.85 
 
 		 355 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.355052 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1266  radical SAM family protein  31.35 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.249898 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4479  DNA repair photolyase-like protein  29.41 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.123605  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3517  Radical SAM domain protein  30.61 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.918389 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2237  radical SAM domain-containing protein  31.79 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0517  Radical SAM domain protein  30.77 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.619466 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1003  hypothetical protein  31.79 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2509  hypothetical protein  31.58 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.690045 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0685  radical SAM domain-containing protein  30.15 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0316247 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1500  radical SAM family protein  31.28 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6097  Radical SAM domain-containing protein  25.96 
 
 		 338 aa  73.2  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>