75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1213 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1213  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase and related enzyme  100 
 
 		 154 aa  321  2e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2142  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  68.83 
 
 		 155 aa  223  7e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0259  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  45.03 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0185  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  45.39 
 
 		 158 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2403  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5 epimerase  43.42 
 
 		 158 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.930193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0165  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase related  40.4 
 
 		 151 aa  118  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0055  dTDP-4-dehydrorhamnose 35-epimerase related  39.07 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1887  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  39.07 
 
 		 181 aa  108  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.394283  normal  0.415914 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4813  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  33.79 
 
 		 173 aa  108  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.841507  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2887  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  35.81 
 
 		 147 aa  90.9  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3931  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  33.79 
 
 		 177 aa  90.5  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1352  dTDP-4-dehydrorhamnose 3 5-epimerase and related enzymes-like protein  39.06 
 
 		 157 aa  88.6  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1910  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  34.46 
 
 		 149 aa  88.2  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1258  dTDP-4-dehydrorhamnose epimerase  36.42 
 
 		 158 aa  87.4  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2215  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  28.19 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3696  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  33.99 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0875  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  36.94 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2463  dTDP-4-dehydrorhamnose 3 5-epimerase and related enzymes-like protein  37.78 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0126691  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1754  dTDP-4-dehydrorhamnose 3 5-epimerase and related enzymes-like protein  37.78 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1604  dTDP-4-dehydrorhamnose epimerase  29.53 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.679828  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2861  dTDP-4-dehydrorhamnose 3 5-epimerase and related enzymes-like protein  35.46 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000254374  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2082  hypothetical protein  36.57 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0925  hypothetical protein  35.61 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.540819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2655  hypothetical protein  28.38 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2752  dTDP-4-dehydrorhamnose 35-epimerase related protein  28.77 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.711856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2030  dTDP-4-dehydrorhamnose 3 5-epimerase  30.69 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1146  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  28.95 
 
 		 177 aa  50.4  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000176363  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1244  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  27.45 
 
 		 182 aa  48.9  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.595096  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00989  dTDP-4-keto-6-deoxy-D-glucose-3,6-epimerase  26.67 
 
 		 181 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2730  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  28.21 
 
 		 176 aa  48.5  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.305906  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0383  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  28.95 
 
 		 185 aa  48.1  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2506  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  29.57 
 
 		 177 aa  47.8  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13113  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  23.97 
 
 		 182 aa  47.8  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.611715  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12921  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  25 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.197327  hitchhiker  0.00628301 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15950  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  26.28 
 
 		 182 aa  47  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3157  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  28.48 
 
 		 182 aa  47.4  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0628182 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0540  dTDP-4-dehydrorhamnose 35-epimerase related  26.87 
 
 		 180 aa  47.4  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0255  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  32.08 
 
 		 191 aa  46.6  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000488402  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1539  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  26.87 
 
 		 190 aa  45.1  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.731559  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1571  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  25 
 
 		 190 aa  44.3  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2179  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  26.24 
 
 		 184 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.166271  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6650  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  26.62 
 
 		 193 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.68 
 
 		 372 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506617 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2560  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  28 
 
 		 182 aa  43.9  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0057  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  25 
 
 		 191 aa  43.9  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19755  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3385  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  26.62 
 
 		 193 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4139  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  26.45 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000190407 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1316  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  28.23 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1988  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  25.32 
 
 		 187 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0592  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  24.84 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.430103  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0996  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  26.45 
 
 		 201 aa  42.4  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2857  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  27.1 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.255465  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2343  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  26.14 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1981  WbjC  28.03 
 
 		 373 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4988  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  26.28 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3120  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  25.66 
 
 		 183 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3012  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  24.34 
 
 		 181 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.481041  hitchhiker  0.00156221 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2043  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  27.63 
 
 		 190 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13502  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase rmlC  28.83 
 
 		 202 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.470022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2403  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  29.73 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1394  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  26.57 
 
 		 182 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1070  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  29.03 
 
 		 190 aa  41.2  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.921927  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1252  hypothetical protein  22.45 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3017  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  26.06 
 
 		 178 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0514274  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1961  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  24.6 
 
 		 191 aa  40.8  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3703  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  27.27 
 
 		 182 aa  41.2  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.902093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2219  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  24.11 
 
 		 182 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.107918  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3347  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  25.81 
 
 		 187 aa  40.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8195  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  29.79 
 
 		 200 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2678  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  30.61 
 
 		 183 aa  40.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.298698  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1261  dTDP-4-dehydrorhamnose 35-epimerase related  34.21 
 
 		 179 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1382  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  25.17 
 
 		 183 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.439058  hitchhiker  0.0000218854 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0280  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  23.87 
 
 		 181 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4017  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  25 
 
 		 183 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.392639  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3237  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  24.5 
 
 		 181 aa  40.4  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>