29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0843 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0843  glycoside hydrolase family 9  100 
 
 
559 aa  1141    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03428  hypothetical protein  48.41 
 
 
579 aa  534  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002581  glucosamine-link cellobiase  48.06 
 
 
579 aa  523  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0144  endoglucanase-related protein  46.29 
 
 
574 aa  501  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2581  putative chitobiase (exoglucosidase)  45.49 
 
 
575 aa  496  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0426  glycoside hydrolase family protein  39.76 
 
 
613 aa  424  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5748  glycoside hydrolase family 9  38.68 
 
 
613 aa  398  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.843409  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0961  beta-glycosidase-like protein  39.49 
 
 
1452 aa  395  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496478  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0525  glycoside hydrolase family 9  42.76 
 
 
609 aa  395  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4776  glycosy hydrolase family protein  33.51 
 
 
606 aa  324  3e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.520076  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3991  hypothetical protein  24.83 
 
 
1217 aa  63.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.373795  normal  0.68901 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  22.98 
 
 
1601 aa  59.7  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  28.93 
 
 
875 aa  58.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0675  Cellulase  22.4 
 
 
1076 aa  57.4  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379443  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  28.31 
 
 
591 aa  55.5  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2951  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  29.71 
 
 
762 aa  54.7  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  33.13 
 
 
851 aa  53.5  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  34.86 
 
 
1100 aa  52  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  30.1 
 
 
833 aa  52  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  30.87 
 
 
998 aa  51.2  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3980  hypothetical protein  27.93 
 
 
694 aa  50.4  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0435811  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0778  glycosylhydrolase family 9 protein  27.27 
 
 
739 aa  49.7  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6813  glycoside hydrolase family 9  30.07 
 
 
815 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.921794  hitchhiker  0.00389969 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  30.32 
 
 
775 aa  49.3  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  32.54 
 
 
864 aa  48.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4520  glycoside hydrolase family 9  29.48 
 
 
906 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815518  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  25.2 
 
 
885 aa  45.8  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  25.42 
 
 
812 aa  44.3  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3031  glycoside hydrolase family 9  29.12 
 
 
1105 aa  43.9  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>