39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2661 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2661  putative RNA-processing protein  100 
 
 		 180 aa  357  5e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.285005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0700  KH type 1 domain protein  64.12 
 
 		 182 aa  234  4e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.432853  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3655  KH domain protein  64.12 
 
 		 185 aa  231  4.0000000000000004e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1272  putative RNA-processing protein  64.71 
 
 		 182 aa  230  8.000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2094  KH domain protein  64.12 
 
 		 192 aa  227  6e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.472155  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0948  putative RNA-processing protein  51.76 
 
 		 178 aa  179  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1784  putative RNA-processing protein  49.7 
 
 		 182 aa  171  5.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0171  putative RNA-processing protein  53.57 
 
 		 174 aa  166  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1281  KH domain protein  42.11 
 
 		 182 aa  149  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1750  putative RNA-processing protein  43.93 
 
 		 180 aa  148  3e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.595903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2500  putative RNA-processing protein  42.01 
 
 		 180 aa  142  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0287  putative RNA-processing protein  44.85 
 
 		 184 aa  142  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.522935  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1627  putative RNA-processing protein  44.85 
 
 		 184 aa  142  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1477  putative RNA-processing protein  46.06 
 
 		 184 aa  142  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0190069  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2465  putative RNA-processing protein  42.2 
 
 		 179 aa  143  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0000000000949184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1001  putative RNA-processing protein  44.85 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.52348  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2457  putative RNA-processing protein  37.71 
 
 		 181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0593  putative RNA-processing protein  43.64 
 
 		 186 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.459643  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2793  putative RNA-processing protein  39.08 
 
 		 179 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000187863  normal  0.0434325 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1409  putative RNA-processing protein  42.59 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0512  putative RNA-processing protein  41.42 
 
 		 197 aa  114  6e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0772  putative RNA-processing protein  38.82 
 
 		 176 aa  98.2  6e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.41794  normal  0.0119808 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0185  KH domain protein  30.59 
 
 		 189 aa  95.1  5e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00031707  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0851  putative RNA-processing protein  37.5 
 
 		 186 aa  92.8  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1851  putative RNA-processing protein  34.42 
 
 		 184 aa  91.3  7e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.916609  normal  0.125825 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0653  putative RNA-processing protein  35.25 
 
 		 178 aa  88.6  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.873833  normal  0.171663 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1181  putative RNA-processing protein  39.82 
 
 		 174 aa  84.7  6e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0980  putative RNA-processing protein  33.56 
 
 		 184 aa  84.7  6e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05875  rRNA assembly protein Mis3, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11380)  33.06 
 
 		 358 aa  61.2  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.782945  normal  0.951317 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32864  predicted protein  35.35 
 
 		 415 aa  58.2  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05785  Pre-rRNA-processing protein pno1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0Z5]  28.19 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.250915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40963  predicted protein  29.03 
 
 		 356 aa  57  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35737  predicted protein  26.57 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.230119 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69759  Predicted RNA-binding protein Pno1p interacting with Nob1p and involved in 26S proteasome assembly  26.85 
 
 		 257 aa  53.5  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.227667 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9929  predicted protein  25.42 
 
 		 196 aa  52  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545391  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05510  rRNA processing-related protein, putative  32.32 
 
 		 402 aa  52  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.909305  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45441  predicted protein  30 
 
 		 379 aa  48.5  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05860  chaperone, putative  32.88 
 
 		 266 aa  45.1  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_89194  predicted protein  27.15 
 
 		 310 aa  42.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.915191  hitchhiker  0.00870525 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>