More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2486 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2486  ABC transporter related  100 
 
 		 375 aa  763    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.948028 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2267  ABC transporter related  68.35 
 
 		 393 aa  529  1e-149  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0010  ABC transporter related protein  67.72 
 
 		 395 aa  528  1e-149  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1852  ABC transporter related protein  65.61 
 
 		 395 aa  515  1.0000000000000001e-145  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  49.61 
 
 		 372 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  48.77 
 
 		 426 aa  364  2e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  48.28 
 
 		 368 aa  360  2e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  48.68 
 
 		 370 aa  358  9e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  48.28 
 
 		 367 aa  355  7.999999999999999e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  48.95 
 
 		 367 aa  352  8e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  48.95 
 
 		 367 aa  352  8e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  47.77 
 
 		 367 aa  351  1e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  47.24 
 
 		 367 aa  350  2e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  48.3 
 
 		 370 aa  348  9e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  48.03 
 
 		 384 aa  347  1e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  46.05 
 
 		 369 aa  347  2e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  49.48 
 
 		 370 aa  345  8e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  48.51 
 
 		 370 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  47.49 
 
 		 365 aa  343  4e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1098  ABC transporter related  48.07 
 
 		 421 aa  341  1e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.894921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  49.07 
 
 		 402 aa  340  2.9999999999999998e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  47.21 
 
 		 369 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.89 
 
 		 366 aa  339  4e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  47.89 
 
 		 366 aa  339  4e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.89 
 
 		 366 aa  339  4e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.89 
 
 		 366 aa  339  4e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  47.89 
 
 		 366 aa  339  4e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  48.01 
 
 		 364 aa  338  8e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.35 
 
 		 366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.35 
 
 		 366 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  45.9 
 
 		 389 aa  337  2.9999999999999997e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  46.17 
 
 		 366 aa  336  2.9999999999999997e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  47.38 
 
 		 370 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.35 
 
 		 366 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  47.37 
 
 		 366 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  48.2 
 
 		 374 aa  335  1e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  47.11 
 
 		 366 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  46.05 
 
 		 366 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  47.62 
 
 		 366 aa  333  3e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  46.17 
 
 		 366 aa  333  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.09 
 
 		 366 aa  333  4e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 		 369 aa  333  4e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  46.58 
 
 		 372 aa  332  5e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06520  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  46.56 
 
 		 393 aa  332  6e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  45.36 
 
 		 367 aa  332  7.000000000000001e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  46.46 
 
 		 363 aa  332  8e-90  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  45.62 
 
 		 356 aa  331  1e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  45.62 
 
 		 356 aa  331  1e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.62 
 
 		 356 aa  331  1e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0329  ABC transporter related  45.65 
 
 		 379 aa  331  1e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.939732 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0946  ABC transporter related  47.28 
 
 		 366 aa  331  1e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.62 
 
 		 356 aa  331  1e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3729  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.62 
 
 		 356 aa  330  2e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0287  ABC transporter related protein  45.41 
 
 		 371 aa  330  2e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0901665  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4487  ABC transporter related protein  45.69 
 
 		 380 aa  330  3e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.211765  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3931  ABC transporter related protein  45.88 
 
 		 425 aa  330  3e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  47.38 
 
 		 370 aa  330  3e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4764  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.62 
 
 		 356 aa  330  3e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.257443 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3928  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.36 
 
 		 356 aa  329  4e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3873  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.62 
 
 		 356 aa  329  4e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0975  ABC transporter related protein  46.09 
 
 		 361 aa  330  4e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  44.74 
 
 		 355 aa  329  6e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4042  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.24 
 
 		 358 aa  329  6e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0265  ABC transporter related protein  45.36 
 
 		 356 aa  328  8e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  45.19 
 
 		 409 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 		 406 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  44.47 
 
 		 355 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7210  ABC transporter related  44.71 
 
 		 360 aa  327  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  45.72 
 
 		 354 aa  327  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2541  ABC transporter-related protein  46.53 
 
 		 399 aa  327  3e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  45.95 
 
 		 381 aa  327  3e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  47.11 
 
 		 364 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  47.11 
 
 		 364 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0739  ABC transporter related  46.36 
 
 		 361 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  44.68 
 
 		 405 aa  326  5e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  44.68 
 
 		 405 aa  326  5e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  44.68 
 
 		 405 aa  325  5e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  46.34 
 
 		 367 aa  325  6e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4683  ABC transporter related  43.47 
 
 		 398 aa  325  6e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1532  ABC transporter related  44.47 
 
 		 360 aa  325  6e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5360  ABC transporter related  46.42 
 
 		 368 aa  325  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.364959 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1821  ABC transporter related  45.89 
 
 		 382 aa  325  9e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  46.92 
 
 		 358 aa  325  9e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  45.87 
 
 		 367 aa  324  1e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  45.87 
 
 		 367 aa  325  1e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  45.86 
 
 		 406 aa  324  1e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1116  ABC transporter related  45.94 
 
 		 418 aa  325  1e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.570799 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  45.93 
 
 		 380 aa  323  2e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4521  ABC transporter related  44.05 
 
 		 352 aa  323  2e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  46.93 
 
 		 354 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  45.48 
 
 		 362 aa  324  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0810  ABC transporter related  45.2 
 
 		 396 aa  323  3e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  47.07 
 
 		 355 aa  323  3e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4422  ABC transporter related protein  44.68 
 
 		 398 aa  323  3e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.406817 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  43.95 
 
 		 410 aa  323  4e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2630  ABC transporter related  45.99 
 
 		 372 aa  323  4e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  43.68 
 
 		 369 aa  323  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  45.81 
 
 		 363 aa  322  5e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  46.79 
 
 		 369 aa  322  6e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  48.24 
 
 		 368 aa  322  7e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.414588 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>