248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2269 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2269  translation initiation factor IF-2B subunit delta  100 
 
 
323 aa  642    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0752053 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2762  translation initiation factor IF-2B subunit delta  75.16 
 
 
331 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00225031  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2966  translation initiation factor, aIF-2BII family  66.19 
 
 
351 aa  415  9.999999999999999e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00871533  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0571  translation initiation factor, aIF-2BII family  69.33 
 
 
327 aa  399  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0793  translation initiation factor IF-2B subunit delta  44.74 
 
 
307 aa  257  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2432  translation initiation factor IF-2B subunit delta  45.28 
 
 
320 aa  250  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1938  translation initiation factor IF-2B subunit delta  43.05 
 
 
321 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0331  translation initiation factor, aIF-2BII family  43.46 
 
 
309 aa  242  6e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2067  translation initiation factor IF-2B subunit delta  44.55 
 
 
309 aa  241  2e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0673  translation initiation factor IF-2B subunit delta  42 
 
 
313 aa  231  9e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1262  translation initiation factor IF-2B subunit delta  45.07 
 
 
302 aa  225  6e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156828  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2314  translation initiation factor IF-2B subunit delta  43.71 
 
 
318 aa  225  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0557  translation initiation factor IF-2B subunit delta  40.97 
 
 
319 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0282254 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0257  translation initiation factor IF-2B subunit delta  43.24 
 
 
318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.374492  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0384  translation initiation factor IF-2B subunit delta  42.35 
 
 
331 aa  211  2e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.111584  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0385  initiation factor 2B related  37.92 
 
 
319 aa  171  1e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  37.73 
 
 
346 aa  157  3e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  38.49 
 
 
358 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0639  aIF-2BI family translation initiation factor  36.5 
 
 
372 aa  152  8e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6765  translation initiation factor, aIF-2BI family  39.34 
 
 
369 aa  152  8.999999999999999e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  35.67 
 
 
349 aa  150  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  41.48 
 
 
353 aa  147  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  37.26 
 
 
348 aa  147  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  39.67 
 
 
344 aa  145  8.000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0663  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  36.39 
 
 
365 aa  144  2e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.109881 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  38.64 
 
 
346 aa  143  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  34.31 
 
 
342 aa  143  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  37.07 
 
 
346 aa  142  8e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  36.21 
 
 
332 aa  142  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  35.88 
 
 
334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2541  translation initiation factor, aIF-2BI family  37.42 
 
 
350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0703  translation initiation factor 2B subunit I  36.62 
 
 
351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787843 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0494  translation initiation factor 2B subunit I  36.88 
 
 
332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.93452  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  36.3 
 
 
354 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1400  translation initiation factor, aIF-2BI family  38.11 
 
 
354 aa  139  4.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0211329  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0169  aIF-2BI family translation initiation factor  33.77 
 
 
345 aa  139  7.999999999999999e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  34.65 
 
 
350 aa  139  8.999999999999999e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1041  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  37.55 
 
 
362 aa  138  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.78 
 
 
354 aa  138  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  33.33 
 
 
345 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0191  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.87 
 
 
348 aa  137  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00735  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.11 
 
 
354 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2043  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35 
 
 
354 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0394  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.63 
 
 
348 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.89 
 
 
345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.91 
 
 
357 aa  136  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23250  methylthioribose-1-phosphate isomerase  36.09 
 
 
358 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078361 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  35.45 
 
 
346 aa  135  8e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2124  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.76 
 
 
354 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.369854  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  34.78 
 
 
346 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0319  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.44 
 
 
347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2312  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.28 
 
 
378 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0005  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  36.19 
 
 
365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2033  aIF-2BI family translation initiation factor  31.58 
 
 
354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0332  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.11 
 
 
348 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0347  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.11 
 
 
347 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0396  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  34.6 
 
 
370 aa  134  3e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.359627  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0379  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.11 
 
 
348 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  36.27 
 
 
346 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0316  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.11 
 
 
348 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1960  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.1 
 
 
358 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1543  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.28 
 
 
333 aa  133  3.9999999999999996e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0321135  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.99 
 
 
348 aa  133  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  35.06 
 
 
346 aa  132  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3347  initiation factor 2B related protein  33.11 
 
 
283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2877  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  35.43 
 
 
350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0027  aIF-2BI family translation initiation factor  33.22 
 
 
337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  35.29 
 
 
348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2269  translation initiation factor 2B subunit I  31.73 
 
 
349 aa  130  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1791  translation initiation factor 2B subunit I  32.35 
 
 
321 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  34.73 
 
 
343 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0076  translation initiation factor 2B subunit I  34.74 
 
 
355 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0008  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  34.92 
 
 
351 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.679741  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  34.73 
 
 
343 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  30.09 
 
 
349 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2173  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  34.08 
 
 
366 aa  129  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1203  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.29 
 
 
358 aa  129  9.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4098  methylthioribose-1-phosphate isomerase  32.26 
 
 
351 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463174  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1289  methylthioribose-1-phosphate isomerase  32.78 
 
 
364 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0889723  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2579  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.74 
 
 
354 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0623  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  36.16 
 
 
354 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.242304  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2118  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  37.79 
 
 
339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0503  translation initiation factor, aIF-2BI family  33.55 
 
 
350 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0485  aIF-2BI family translation initiation factor  34.91 
 
 
353 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0156  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  36.69 
 
 
354 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4924  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.66 
 
 
348 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.64519  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0865  aIF-2BI family translation initiation factor  32.03 
 
 
321 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0114166 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0441  methylthioribose-1-phosphate isomerase  32.12 
 
 
348 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0978  translation initiation factor 2B subunit I  35.62 
 
 
338 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0893546  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.29 
 
 
347 aa  126  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1571  initiation factor 2B related protein  33.11 
 
 
283 aa  126  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0491  translation initiation factor 2B subunit I  35.62 
 
 
337 aa  125  7e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.23967 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35743  predicted protein  38.04 
 
 
365 aa  125  7e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.260094 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4334  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  35.88 
 
 
337 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1036  translation initiation factor, aIF-2BI family  37.22 
 
 
347 aa  125  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.313313  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0927  aIF-2BI family translation initiation factor  30.72 
 
 
323 aa  125  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4053  methylthioribose-1-phosphate isomerase  31.94 
 
 
351 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  34.07 
 
 
355 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4159  methylthioribose-1-phosphate isomerase  31.94 
 
 
351 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.109098  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  32.91 
 
 
344 aa  124  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>