122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1581 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1581  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 341 aa  643    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0769558 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1144  protein of unknown function UPF0118  45.67 
 
 		 341 aa  260  2e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.158987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2097  protein of unknown function UPF0118  44.21 
 
 		 336 aa  223  4e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.987772  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3764  protein of unknown function UPF0118  38.63 
 
 		 376 aa  206  5e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2612  protein of unknown function UPF0118  28.23 
 
 		 363 aa  103  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.751344  normal  0.787744 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0113  hypothetical protein  28.17 
 
 		 346 aa  91.7  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0968389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0751  hypothetical protein  24.93 
 
 		 336 aa  89.7  6e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1711  hypothetical protein  26.02 
 
 		 336 aa  89.7  6e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0245  hypothetical protein  22.6 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0191  hypothetical protein  25.3 
 
 		 336 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1639  hypothetical protein  24.86 
 
 		 334 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0262  hypothetical protein  23.12 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00766044 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0574  hypothetical protein  24.73 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.877456  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0445  hypothetical protein  19.73 
 
 		 393 aa  72.8  0.000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000355219  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1366  hypothetical protein  34.95 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4237  protein of unknown function UPF0118  28.31 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4731  hypothetical protein  23.48 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226742  hitchhiker  0.00240822 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  21.47 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0940  protein of unknown function UPF0118  25.96 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.726387  normal  0.96935 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1259  protein of unknown function UPF0118  27.78 
 
 		 345 aa  62  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.324845  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0491  hypothetical protein  22.92 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1671  hypothetical protein  22.6 
 
 		 334 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2679  hypothetical protein  28.19 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689913  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2465  protein of unknown function UPF0118  25.11 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2217  hypothetical protein  22.59 
 
 		 351 aa  57  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.253249  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2416  protein of unknown function UPF0118  26.22 
 
 		 378 aa  56.2  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.25064  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  23.35 
 
 		 347 aa  55.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  27.01 
 
 		 393 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0798  protein of unknown function UPF0118  35.51 
 
 		 380 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2601  hypothetical protein  26.1 
 
 		 352 aa  54.3  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.99204  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0747  hypothetical protein  34.58 
 
 		 381 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122791  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1300  protein of unknown function UPF0118  22.8 
 
 		 345 aa  54.3  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316018  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  25.28 
 
 		 358 aa  53.1  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0336  hypothetical protein  26.47 
 
 		 372 aa  52.4  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000639163  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2413  hypothetical protein  20.87 
 
 		 345 aa  52  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.480547  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4061  hypothetical protein  27.72 
 
 		 351 aa  51.6  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2229  hypothetical protein  27 
 
 		 392 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  22.07 
 
 		 381 aa  51.2  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13258  putative transmembrane protein  20.67 
 
 		 339 aa  50.4  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2958  protein of unknown function UPF0118  26.38 
 
 		 339 aa  50.4  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  22.07 
 
 		 352 aa  50.4  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2944  hypothetical protein  19.92 
 
 		 368 aa  50.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.81591  decreased coverage  0.00297728 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  25.91 
 
 		 363 aa  50.1  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  22.93 
 
 		 353 aa  49.7  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  20.84 
 
 		 391 aa  49.3  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  22.46 
 
 		 362 aa  48.9  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  20.2 
 
 		 394 aa  48.9  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  23.7 
 
 		 352 aa  48.9  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0286  hypothetical protein  23.62 
 
 		 347 aa  48.9  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1555  hypothetical protein  23.62 
 
 		 347 aa  48.1  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1564  putative transmembrane transport protein  30.67 
 
 		 406 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  23.22 
 
 		 352 aa  48.5  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0215  hypothetical protein  30.67 
 
 		 406 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  29.2 
 
 		 373 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  23.23 
 
 		 355 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  23.23 
 
 		 355 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  23.23 
 
 		 355 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  23.23 
 
 		 355 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  21.7 
 
 		 356 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  23.53 
 
 		 353 aa  47.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  23.23 
 
 		 355 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1365  hypothetical protein  22.83 
 
 		 347 aa  47.4  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3044  hypothetical protein  29.29 
 
 		 398 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3370  hypothetical protein  24.87 
 
 		 360 aa  47  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0792  protein of unknown function UPF0118  23.24 
 
 		 344 aa  47  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.101192 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  23.08 
 
 		 355 aa  47  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  22.42 
 
 		 358 aa  46.6  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  32.35 
 
 		 351 aa  46.6  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  32.35 
 
 		 351 aa  46.6  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  23.53 
 
 		 352 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3181  hypothetical protein  29.2 
 
 		 419 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  23.08 
 
 		 355 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  24.7 
 
 		 356 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3102  hypothetical protein  23.77 
 
 		 352 aa  46.2  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1587  protein of unknown function UPF0118  33.93 
 
 		 363 aa  46.2  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  25.51 
 
 		 355 aa  46.2  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  23.46 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0479  hypothetical protein  23.3 
 
 		 372 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  23.46 
 
 		 353 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3672  hypothetical protein  28.99 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00326083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2998  hypothetical protein  25.31 
 
 		 359 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  23.7 
 
 		 352 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0785  hypothetical protein  34.29 
 
 		 363 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0785663 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  23.46 
 
 		 350 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2209  hypothetical protein  24.64 
 
 		 409 aa  44.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3886  hypothetical protein  23.96 
 
 		 359 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  29.31 
 
 		 360 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2610  protein of unknown function UPF0118  26.61 
 
 		 370 aa  44.3  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0472  acid membrane antigen A  26.92 
 
 		 367 aa  44.3  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  25.21 
 
 		 339 aa  44.3  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2212  protein of unknown function UPF0118  25.44 
 
 		 355 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000181482  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1276  acid membrane antigen A  19.84 
 
 		 347 aa  44.3  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1219  protein of unknown function UPF0118  25.18 
 
 		 355 aa  43.9  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000032504  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  24.62 
 
 		 351 aa  43.9  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2037  protein of unknown function UPF0118  29.53 
 
 		 405 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0579571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2995  hypothetical protein  30.11 
 
 		 377 aa  43.9  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1838  protein of unknown function UPF0118  29.53 
 
 		 398 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00200619  normal  0.0419691 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1326  hypothetical protein  19.7 
 
 		 354 aa  43.5  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0447  hypothetical protein  23.86 
 
 		 360 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4008  hypothetical protein  23.86 
 
 		 360 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>