150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1492 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1492  methyltransferase small  100 
 
 		 207 aa  414  9.999999999999999e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0529  methyltransferase small  61.65 
 
 		 211 aa  266  1e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2486  putative RNA methylase  60.87 
 
 		 207 aa  261  4e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1798  hypothetical protein  53.7 
 
 		 219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3583  Methyltransferase type 11  54.5 
 
 		 215 aa  210  1e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0006  methyltransferase small  41.06 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0217  methyltransferase  43.84 
 
 		 200 aa  139  3e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2169  methyltransferase small  43.78 
 
 		 202 aa  139  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.59077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1635  methyltransferase  41.05 
 
 		 197 aa  137  7.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1437  methyltransferase  43.62 
 
 		 203 aa  134  8e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0651  methyltransferase related protein  36.14 
 
 		 201 aa  132  3.9999999999999996e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2083  methyltransferase small  39.32 
 
 		 204 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2614  methyltransferase small  43.84 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1845  methyltransferase small  36.82 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1709  SAM-binding motif-containing protein  31.63 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0891  methyltransferase  30.7 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0202  methyltransferase small  31.16 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0317  DNA methylase  27.04 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1507  methyltransferase small  31.13 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.113673  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0577  putative RNA methylase  32.2 
 
 		 209 aa  95.9  4e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0475078  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0520  methyltransferase small  32.85 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89455  predicted protein  35.61 
 
 		 273 aa  90.5  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0270328  hitchhiker  0.00142671 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2885  Methyltransferase type 11  32.62 
 
 		 202 aa  89.7  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0236  methyltransferase  33.33 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.140784 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2199  methyltransferase small  36.17 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0731  methyltransferase  37.41 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.557885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0747  methyltransferase small  34.03 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1027  methyltransferase small  33.33 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.653498  normal  0.0217295 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1045  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.75 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3029  dimethyladenosine transferase  41.28 
 
 		 256 aa  51.6  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  33.33 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3619  methyltransferase  36 
 
 		 179 aa  50.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1487  ribosomal L11 methyltransferase  41.27 
 
 		 285 aa  48.9  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000855878  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3582  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  34.01 
 
 		 254 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0053  hypothetical protein  34.62 
 
 		 404 aa  48.9  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1993  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.13 
 
 		 278 aa  48.5  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2411  methyltransferase small  42.39 
 
 		 248 aa  48.5  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.347035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  39.02 
 
 		 285 aa  48.5  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2577  putative RNA methylase  33.85 
 
 		 374 aa  48.1  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.274965  hitchhiker  0.00000225035 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13478  putative ribosomal protein L11 methyltransferase  39.13 
 
 		 276 aa  47.8  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.248729  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0255  methyltransferase  31.62 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  41.82 
 
 		 264 aa  47.8  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1738  ribosomal L11 methyltransferase  41.82 
 
 		 264 aa  47.8  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3373  methyltransferase small  38.67 
 
 		 243 aa  47.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0772935  normal  0.241252 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  50 
 
 		 316 aa  47.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.62 
 
 		 295 aa  47  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1569  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.75 
 
 		 278 aa  47  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.641228  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1784  modification methylase, HemK family  44.16 
 
 		 318 aa  47  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.483415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.71 
 
 		 295 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.75 
 
 		 294 aa  46.6  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3543  ribosomal protein L11 methylase-like protein  32.08 
 
 		 265 aa  47  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.103113 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.71 
 
 		 295 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  39.29 
 
 		 304 aa  47  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2705  SAM-dependent methyltransferase  28.93 
 
 		 238 aa  45.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.62 
 
 		 295 aa  46.2  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3159  hypothetical protein  36.84 
 
 		 376 aa  45.8  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.14 
 
 		 295 aa  45.8  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.38 
 
 		 293 aa  45.8  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000022526  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.75 
 
 		 295 aa  45.8  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1586  ribosomal L11 methyltransferase  55.56 
 
 		 275 aa  45.4  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.472869  normal  0.567959 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.38 
 
 		 306 aa  45.4  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.38 
 
 		 293 aa  45.8  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.44 
 
 		 295 aa  45.8  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1683  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  37.84 
 
 		 205 aa  45.4  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3214  methyltransferase of 50S ribosomal subunit protein L11  34.09 
 
 		 311 aa  45.4  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0545  methyltransferase small  39.06 
 
 		 333 aa  45.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1296  SAM-dependent methyltransferase  34.15 
 
 		 236 aa  45.1  0.0007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  32.5 
 
 		 262 aa  45.4  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.71 
 
 		 293 aa  45.1  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0469  methyltransferase small  36.46 
 
 		 397 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3507  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.67 
 
 		 293 aa  44.7  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340912  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0540  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.21 
 
 		 293 aa  44.7  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0499  Methyltransferase type 11  42.42 
 
 		 264 aa  44.3  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000709402  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0058  methyltransferase small  33.65 
 
 		 404 aa  44.7  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.520112 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2609  methyltransferase small  35.42 
 
 		 397 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0496  methyltransferase small  35.42 
 
 		 397 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1024  Methyltransferase type 12  37.33 
 
 		 389 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31784 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0115  putative methyltransferase  38.04 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0020  HemK family modification methylase  28.97 
 
 		 285 aa  44.3  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3584  methyltransferase  32.81 
 
 		 377 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.781513 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  40 
 
 		 271 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2819  methyltransferase small  36.36 
 
 		 379 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2555  methyltransferase type 11  32 
 
 		 315 aa  43.9  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00279696  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  36.25 
 
 		 386 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0173  methyltransferase  36.28 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0194  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.94 
 
 		 292 aa  43.5  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2938  modification methylase, HemK family  26.04 
 
 		 282 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.557385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1636  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.9 
 
 		 312 aa  43.5  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0215506  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0373  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.94 
 
 		 292 aa  43.5  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0981448 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1670  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.9 
 
 		 312 aa  43.5  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0891  methyltransferase small  30.21 
 
 		 244 aa  43.5  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0196039 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0579  methyltransferase  33.33 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330232  normal  0.0174607 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  37.66 
 
 		 283 aa  42.7  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2943  hypothetical protein  33.33 
 
 		 378 aa  42.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2012  ribosomal L11 methyltransferase  47.62 
 
 		 296 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.255212 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2340  methyltransferase small  39.47 
 
 		 333 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.271786 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  29.07 
 
 		 228 aa  42.7  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2494  ribosomal protein L11 methyltransferase  40 
 
 		 308 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00440175  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03000  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.62 
 
 		 301 aa  43.1  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  36.25 
 
 		 382 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>