41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0686 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0686  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 177 aa  346  8e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0360  transcriptional regulator, XRE family  64.44 
 
 		 181 aa  191  6e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1903  transcriptional regulator, XRE family  63.19 
 
 		 182 aa  174  9e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2372  transcriptional regulator, XRE family  59.78 
 
 		 173 aa  167  6e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0604  transcriptional regulator, XRE family  57.92 
 
 		 183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196411  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1037  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 172 aa  117  9e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.223775  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1462  helix-turn-helix domain-containing protein  38.15 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217714  normal  0.212223 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1304  helix-turn-helix domain-containing protein  38.86 
 
 		 163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1032  helix-turn-helix domain-containing protein  35.8 
 
 		 162 aa  107  9.000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0938  transcriptional regulator, XRE family  35.63 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.117119  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2112  XRE family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 164 aa  101  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.79317  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0621  XRE family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 161 aa  99.4  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1762  XRE family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 159 aa  94  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1025  XRE family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 158 aa  92.4  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0919  helix-turn-helix domain-containing protein  31.64 
 
 		 158 aa  90.5  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.960971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1419  transcriptional regulator, XRE family  30.99 
 
 		 178 aa  88.2  5e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0459  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 165 aa  86.3  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0951  helix-turn-helix domain-containing protein  32.57 
 
 		 159 aa  84.3  8e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1173  XRE family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 177 aa  80.5  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.359549 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1247  transcriptional regulator, XRE family  29.55 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.797623  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0707  helix-turn-helix domain-containing protein  36.15 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.866911  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0112  helix-turn-helix domain-containing protein  28.21 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.1301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2145  XRE family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1076  XRE family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2081  DNA binding domain-containing protein  28.95 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2276  XRE family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0037  helix-turn-helix domain-containing protein  28.32 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0034  XRE family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00826547 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2656  transcription factor of MBF1-like protein  28.14 
 
 		 186 aa  49.3  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14374  predicted protein  31.87 
 
 		 104 aa  47.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.123267  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1157  DNA binding domain-containing protein  28.75 
 
 		 174 aa  47.4  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0872862  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4478  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3781  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 279 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1892  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 89 aa  42.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.883347  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0798  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 73 aa  42  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0286273  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3025  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 188 aa  42  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314698  normal  0.932142 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4210  XRE family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 106 aa  41.6  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 97 aa  41.6  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 97 aa  41.6  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_8975  predicted protein  33.33 
 
 		 88 aa  41.2  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 77 aa  40.8  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>