More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1381 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1381  response regulator receiver protein  100 
 
 
265 aa  528  1e-149  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2604  response regulator receiver protein  48.68 
 
 
265 aa  276  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000114543 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3481  response regulator receiver protein  50.19 
 
 
265 aa  269  4e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3157  response regulator receiver protein  50.19 
 
 
266 aa  268  7e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0549  response regulator receiver protein  49.81 
 
 
265 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0549  chemotaxis protein CheY/response regulator receiver domain-containing protein  48.68 
 
 
267 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0601  response regulator receiver protein  48.66 
 
 
265 aa  261  8e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3730  response regulator receiver protein  47.08 
 
 
265 aa  258  7e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3324  response regulator receiver protein  47.86 
 
 
265 aa  256  3e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3942  response regulator receiver protein  47.47 
 
 
265 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.395841  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3760  response regulator receiver protein  47.47 
 
 
265 aa  251  6e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.860481 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3816  response regulator receiver protein  47.47 
 
 
265 aa  251  6e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0586034  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0508  response regulator receiver protein  47.47 
 
 
265 aa  251  6e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0266508  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0659  response regulator receiver  44.83 
 
 
265 aa  250  2e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1591  response regulator receiver protein  44.44 
 
 
266 aa  249  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3531  response regulator receiver protein  44.36 
 
 
265 aa  246  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4352  response regulator receiver protein  44.83 
 
 
265 aa  244  9e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01714  chemotaxis protein CheY/response regulator receiver domain protein  49.75 
 
 
209 aa  202  4e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0555  response regulator receiver  41.98 
 
 
266 aa  198  7e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.502991  normal  0.361132 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  35 
 
 
127 aa  99.8  4e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  37.19 
 
 
126 aa  96.7  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  37.19 
 
 
126 aa  94.7  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  38.98 
 
 
132 aa  95.1  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  35.83 
 
 
126 aa  94  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  36.97 
 
 
131 aa  93.2  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0986  response regulator receiver protein  35.83 
 
 
131 aa  92.8  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.491936 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  36.13 
 
 
129 aa  92  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  34.71 
 
 
126 aa  92  8e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  34.17 
 
 
131 aa  91.7  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  35.29 
 
 
129 aa  91.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  35.29 
 
 
129 aa  91.3  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  35.54 
 
 
126 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  35 
 
 
126 aa  90.9  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  33.62 
 
 
121 aa  91.3  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  35.29 
 
 
129 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0775  response regulator receiver protein  37.39 
 
 
122 aa  90.9  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212366  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  35 
 
 
130 aa  90.9  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  35.29 
 
 
129 aa  90.5  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  34.17 
 
 
127 aa  90.5  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  34.45 
 
 
127 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  34.17 
 
 
127 aa  89.7  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  34.17 
 
 
127 aa  89.7  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  35 
 
 
130 aa  89.4  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  26.74 
 
 
1351 aa  89.4  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  34.45 
 
 
123 aa  89.4  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  34.17 
 
 
129 aa  89.7  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2289  chemotaxis protein CheY  35.29 
 
 
122 aa  89.4  6e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
127 aa  89.4  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  33.33 
 
 
139 aa  89  7e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  35 
 
 
129 aa  89  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  35 
 
 
129 aa  89  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  35 
 
 
129 aa  89  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
127 aa  88.6  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  33.33 
 
 
127 aa  88.6  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
127 aa  88.6  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
127 aa  88.6  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
127 aa  88.6  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
127 aa  88.6  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
127 aa  88.6  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  34.45 
 
 
129 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  34.17 
 
 
128 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  34.45 
 
 
129 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
135 aa  88.2  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  32.5 
 
 
127 aa  88.2  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  34.45 
 
 
129 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0718  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
128 aa  88.2  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  33.61 
 
 
123 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  34.45 
 
 
129 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  34.45 
 
 
124 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  34.45 
 
 
129 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  32.76 
 
 
121 aa  88.6  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1203  response regulator of chemotaxis  37.93 
 
 
123 aa  87.4  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.266578  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  34.17 
 
 
130 aa  87.4  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  32.2 
 
 
130 aa  87.4  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3598  response regulator receiver protein  33.06 
 
 
298 aa  87.4  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  32.5 
 
 
127 aa  87.8  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  34.75 
 
 
132 aa  87.4  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  34.17 
 
 
130 aa  87.4  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  32.5 
 
 
148 aa  86.7  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  32.5 
 
 
127 aa  87  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
133 aa  87  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  33.08 
 
 
139 aa  87  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1136  chemotaxis protein CheY  33.62 
 
 
130 aa  86.7  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1261  chemotaxis protein CheY  33.62 
 
 
130 aa  86.7  4e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0603  chemotaxis protein CheY  33.62 
 
 
130 aa  86.7  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  32.77 
 
 
129 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  32.77 
 
 
129 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  32.77 
 
 
129 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  32.77 
 
 
129 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  32.77 
 
 
129 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  32.77 
 
 
129 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  32.77 
 
 
129 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  32.77 
 
 
129 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  32.77 
 
 
129 aa  85.9  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  33.05 
 
 
131 aa  85.5  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2124  response regulator receiver protein  38.39 
 
 
122 aa  85.5  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.453448  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  31.93 
 
 
126 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1672  response regulator receiver domain-containing protein  33.62 
 
 
124 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494239  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4402  response regulator receiver protein  36.28 
 
 
280 aa  85.1  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0150  response regulator receiver protein  36.28 
 
 
300 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>