266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3312 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3312  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 		 127 aa  245  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1750  large conductance mechanosensitive channel protein  52.71 
 
 		 133 aa  123  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  48.87 
 
 		 134 aa  114  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  51.08 
 
 		 138 aa  114  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0520  large-conductance mechanosensitive channel  52.67 
 
 		 136 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0521  large-conductance mechanosensitive channel  51.91 
 
 		 136 aa  114  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3511  large-conductance mechanosensitive channel  51.91 
 
 		 136 aa  114  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3339  large-conductance mechanosensitive channel  51.91 
 
 		 136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0522  large-conductance mechanosensitive channel  48.06 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  46.15 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 		 137 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01831  large-conductance mechanosensitive channel  51.82 
 
 		 140 aa  110  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.514761  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 		 133 aa  110  5e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0554  large-conductance mechanosensitive channel  49.25 
 
 		 136 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000110723  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4808  large-conductance mechanosensitive channel  48.44 
 
 		 132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  51.52 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  51.52 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  51.52 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  51.52 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  50.38 
 
 		 132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2606  hypothetical protein  46.46 
 
 		 127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0454  large-conductance mechanosensitive channel  47.66 
 
 		 132 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.116893 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4806  large-conductance mechanosensitive channel  48.06 
 
 		 133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3340  large-conductance mechanosensitive channel  48.44 
 
 		 132 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000422883  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  44.62 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2461  hypothetical protein  47.24 
 
 		 127 aa  108  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2194  large conductance mechanosensitive channel protein  52.67 
 
 		 129 aa  108  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.166081  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3972  large-conductance mechanosensitive channel  49.62 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0532201  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  48.44 
 
 		 136 aa  107  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  48.44 
 
 		 136 aa  107  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  48.44 
 
 		 136 aa  107  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  48.44 
 
 		 136 aa  107  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4785  large-conductance mechanosensitive channel  48.44 
 
 		 132 aa  107  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  48.44 
 
 		 136 aa  107  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  48.44 
 
 		 136 aa  107  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  48.44 
 
 		 136 aa  107  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  48.44 
 
 		 136 aa  107  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  48.44 
 
 		 136 aa  107  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  48.09 
 
 		 136 aa  107  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0756  large conductance mechanosensitive channel protein  49.26 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0820  large-conductance mechanosensitive channel  43.97 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3722  large-conductance mechanosensitive channel  46.09 
 
 		 137 aa  104  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  hitchhiker  0.00604869 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  47.33 
 
 		 139 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  46.21 
 
 		 137 aa  104  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  45.45 
 
 		 148 aa  104  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0611  large-conductance mechanosensitive channel  46.21 
 
 		 137 aa  104  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0263138  normal  0.217178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  47.33 
 
 		 139 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0312  large-conductance mechanosensitive channel  46.21 
 
 		 134 aa  104  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.929299  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  44.2 
 
 		 139 aa  103  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4501  large-conductance mechanosensitive channel  47.29 
 
 		 133 aa  103  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  47.33 
 
 		 137 aa  103  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  47.33 
 
 		 137 aa  103  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0352  large conductance mechanosensitive channel protein  44.36 
 
 		 141 aa  103  9e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.559193  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4641  large conductance mechanosensitive channel protein  46.09 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4569  large-conductance mechanosensitive channel  47.66 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4404  large-conductance mechanosensitive channel  47.66 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4421  large-conductance mechanosensitive channel  47.66 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0386  large conductance mechanosensitive channel protein  45 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.242536 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4924  large-conductance mechanosensitive channel  47.66 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0037  large-conductance mechanosensitive channel  47.29 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4507  large-conductance mechanosensitive channel  46.56 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3196  large-conductance mechanosensitive channel  48.91 
 
 		 134 aa  102  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.977942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2521  large-conductance mechanosensitive channel  46.48 
 
 		 199 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1657  large-conductance mechanosensitive channel  44.09 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1501  large-conductance mechanosensitive channel  46.48 
 
 		 143 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917907  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4790  large-conductance mechanosensitive channel  46.88 
 
 		 132 aa  100  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2079  large-conductance mechanosensitive channel  46.48 
 
 		 143 aa  100  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  45.71 
 
 		 137 aa  100  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3527  large conductance mechanosensitive channel protein  42.42 
 
 		 143 aa  100  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2000  large-conductance mechanosensitive channel  46.48 
 
 		 143 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3310  large-conductance mechanosensitive channel  46.48 
 
 		 143 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00104042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  46.48 
 
 		 143 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2415  large-conductance mechanosensitive channel  46.48 
 
 		 143 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  46.48 
 
 		 143 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4887  large-conductance mechanosensitive channel  45.04 
 
 		 154 aa  100  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  48.18 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0163  large-conductance mechanosensitive channel  45.31 
 
 		 155 aa  98.6  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0317  large conductance mechanosensitive channel protein  41.73 
 
 		 123 aa  98.6  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209684  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2963  large conductance mechanosensitive channel protein  45.71 
 
 		 142 aa  98.2  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  47.45 
 
 		 138 aa  98.2  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0712  large-conductance mechanosensitive channel  43.57 
 
 		 142 aa  98.2  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6128  large-conductance mechanosensitive channel  45.07 
 
 		 143 aa  98.2  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.316261  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0167  large-conductance mechanosensitive channel  44.44 
 
 		 152 aa  97.8  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1951  large-conductance mechanosensitive channel  45.07 
 
 		 143 aa  98.2  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0033  large-conductance mechanosensitive channel  50.37 
 
 		 134 aa  98.2  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  40.58 
 
 		 163 aa  98.2  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0027  large-conductance mechanosensitive channel  51.11 
 
 		 134 aa  97.4  5e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1975  large-conductance mechanosensitive channel  44.37 
 
 		 143 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0443039 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  42.66 
 
 		 139 aa  97.4  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3231  large-conductance mechanosensitive channel  42.86 
 
 		 144 aa  97.1  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1865  large-conductance mechanosensitive channel  43.66 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.568071  hitchhiker  0.00372648 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1938  large-conductance mechanosensitive channel  43.66 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0435  large conductance mechanosensitive channel protein  43.08 
 
 		 135 aa  96.7  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  45.71 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0055  large conductance mechanosensitive channel protein  46.76 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.153997 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2794  large-conductance mechanosensitive channel  44.8 
 
 		 143 aa  95.5  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5262  large-conductance mechanosensitive channel  43.66 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0455479  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0880  large-conductance mechanosensitive channel  41.78 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0911634  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0871  large conductance mechanosensitive channel protein  45.6 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4515  large-conductance mechanosensitive channel  47.01 
 
 		 138 aa  94.7  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00658327  hitchhiker  0.00000531483 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>