270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0033 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0033  large-conductance mechanosensitive channel  100 
 
 		 134 aa  259  6e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0027  large-conductance mechanosensitive channel  98.51 
 
 		 134 aa  256  9e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01831  large-conductance mechanosensitive channel  67.91 
 
 		 140 aa  189  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.514761  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3196  large-conductance mechanosensitive channel  64.93 
 
 		 134 aa  170  5.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.977942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  54.74 
 
 		 137 aa  142  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  53.62 
 
 		 133 aa  142  1e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3972  large-conductance mechanosensitive channel  54.41 
 
 		 137 aa  141  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0532201  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  51.09 
 
 		 134 aa  141  3e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3722  large-conductance mechanosensitive channel  50.36 
 
 		 137 aa  137  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  hitchhiker  0.00604869 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0520  large-conductance mechanosensitive channel  55.15 
 
 		 136 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  51.47 
 
 		 136 aa  137  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  51.47 
 
 		 136 aa  137  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  54.41 
 
 		 136 aa  137  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  51.47 
 
 		 136 aa  137  6e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  54.41 
 
 		 136 aa  137  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  51.47 
 
 		 136 aa  137  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  51.47 
 
 		 136 aa  137  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  51.47 
 
 		 136 aa  137  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0521  large-conductance mechanosensitive channel  54.41 
 
 		 136 aa  137  6e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3511  large-conductance mechanosensitive channel  54.41 
 
 		 136 aa  137  6e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  54.41 
 
 		 136 aa  137  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  51.47 
 
 		 136 aa  137  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  51.47 
 
 		 136 aa  137  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  54.41 
 
 		 136 aa  137  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  51.47 
 
 		 136 aa  137  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1750  large conductance mechanosensitive channel protein  52.94 
 
 		 133 aa  137  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  52.21 
 
 		 137 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  50.36 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  52.21 
 
 		 137 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  50.74 
 
 		 139 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  48.91 
 
 		 137 aa  134  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0611  large-conductance mechanosensitive channel  48.91 
 
 		 137 aa  134  6.0000000000000005e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0263138  normal  0.217178 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4507  large-conductance mechanosensitive channel  50.74 
 
 		 139 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0435  large conductance mechanosensitive channel protein  50.72 
 
 		 135 aa  133  8e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 		 139 aa  133  9e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 		 136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0554  large-conductance mechanosensitive channel  52.94 
 
 		 136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000110723  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0352  large conductance mechanosensitive channel protein  49.64 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.559193  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0522  large-conductance mechanosensitive channel  54.41 
 
 		 136 aa  131  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3339  large-conductance mechanosensitive channel  51.47 
 
 		 136 aa  131  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  48.91 
 
 		 148 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4641  large conductance mechanosensitive channel protein  49.26 
 
 		 148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0037  large-conductance mechanosensitive channel  50.74 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4887  large-conductance mechanosensitive channel  48.53 
 
 		 154 aa  128  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  47.52 
 
 		 139 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0312  large-conductance mechanosensitive channel  47.76 
 
 		 134 aa  127  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.929299  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0820  large-conductance mechanosensitive channel  48.25 
 
 		 151 aa  127  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1256  large conductance mechanosensitive channel protein  54.74 
 
 		 136 aa  127  7.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00104806  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2606  hypothetical protein  50 
 
 		 127 aa  125  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2461  hypothetical protein  50 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4515  large-conductance mechanosensitive channel  50.36 
 
 		 138 aa  125  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00658327  hitchhiker  0.00000531483 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3679  large-conductance mechanosensitive channel  51.09 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3777  large-conductance mechanosensitive channel  51.09 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3714  large-conductance mechanosensitive channel  51.09 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.401904 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3606  large-conductance mechanosensitive channel  51.09 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0494582  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3607  large-conductance mechanosensitive channel  51.09 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.256612 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1501  large-conductance mechanosensitive channel  47.89 
 
 		 143 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917907  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2521  large-conductance mechanosensitive channel  47.89 
 
 		 199 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2079  large-conductance mechanosensitive channel  47.89 
 
 		 143 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2000  large-conductance mechanosensitive channel  47.89 
 
 		 143 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3310  large-conductance mechanosensitive channel  47.89 
 
 		 143 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00104042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  47.89 
 
 		 143 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2415  large-conductance mechanosensitive channel  47.89 
 
 		 143 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  47.89 
 
 		 143 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0712  large-conductance mechanosensitive channel  46.43 
 
 		 142 aa  122  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0793  large-conductance mechanosensitive channel  48.91 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2930  large-conductance mechanosensitive channel  47.52 
 
 		 141 aa  121  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3527  large conductance mechanosensitive channel protein  50.74 
 
 		 143 aa  120  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3231  large-conductance mechanosensitive channel  48.57 
 
 		 144 aa  120  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  45.59 
 
 		 142 aa  120  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  47.83 
 
 		 138 aa  120  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3207  large-conductance mechanosensitive channel  48.25 
 
 		 142 aa  120  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6128  large-conductance mechanosensitive channel  47.18 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.316261  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1951  large-conductance mechanosensitive channel  47.18 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1865  large-conductance mechanosensitive channel  46.48 
 
 		 143 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.568071  hitchhiker  0.00372648 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1549  large-conductance mechanosensitive channel  52.14 
 
 		 135 aa  118  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.406526  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1975  large-conductance mechanosensitive channel  46.48 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0443039 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1938  large-conductance mechanosensitive channel  46.48 
 
 		 143 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0756  large conductance mechanosensitive channel protein  47.79 
 
 		 132 aa  118  3e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3491  large conductance mechanosensitive channel protein  50.44 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.215655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5262  large-conductance mechanosensitive channel  46.48 
 
 		 143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0455479  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0880  large-conductance mechanosensitive channel  44.06 
 
 		 155 aa  117  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0911634  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2860  large-conductance mechanosensitive channel  47.55 
 
 		 142 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.219386 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0167  large-conductance mechanosensitive channel  48.39 
 
 		 152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0163  large-conductance mechanosensitive channel  48.39 
 
 		 155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2794  large-conductance mechanosensitive channel  49.14 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1318  large-conductance mechanosensitive channel  47.89 
 
 		 143 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212571  hitchhiker  0.00243459 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0848  large-conductance mechanosensitive channel  48.18 
 
 		 137 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.231503  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4749  large conductance mechanosensitive channel protein  51.33 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1343  large conductance mechanosensitive channel protein  48.91 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.954232  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0108  large conductance mechanosensitive channel protein  48.78 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0747555 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0317  large conductance mechanosensitive channel protein  45.04 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209684  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3455  large conductance mechanosensitive channel protein  42.45 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0277457  normal  0.0882552 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  43.7 
 
 		 138 aa  114  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0381  large conductance mechanosensitive channel protein  48.72 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3035  large conductance mechanosensitive channel protein  49.26 
 
 		 135 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  45.59 
 
 		 131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0387  large conductance mechanosensitive channel protein  50.43 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376217  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  44.6 
 
 		 159 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1425  large conductance mechanosensitive channel protein  47.45 
 
 		 137 aa  114  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>