52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2392 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2392  Beta-galactosidase  100 
 
 		 672 aa  1387    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6638  glycoside hydrolase family 35  26.57 
 
 		 644 aa  174  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119053  hitchhiker  0.0000205681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3535  Beta-galactosidase-like protein  30.85 
 
 		 682 aa  124  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0941  glycosyl hydrolase, putative  36.07 
 
 		 808 aa  117  6e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0258  Beta-galactosidase  33.33 
 
 		 898 aa  104  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.178588 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3398  glycoside hydrolase family 35  28.67 
 
 		 837 aa  103  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.481666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4420  Beta-galactosidase  32.63 
 
 		 584 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.574053 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0079  glycoside hydrolase family 35  27.16 
 
 		 739 aa  102  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.579135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3570  Beta-galactosidase  30.6 
 
 		 586 aa  99  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7101  Beta-galactosidase  34.62 
 
 		 625 aa  98.2  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2576  Beta-galactosidase  32.37 
 
 		 579 aa  95.5  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1686  Beta-galactosidase  27.66 
 
 		 780 aa  93.2  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00233252  normal  0.321684 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0104  Beta-galactosidase  27.81 
 
 		 584 aa  91.7  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114999 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13150  beta-galactosidase  29.95 
 
 		 586 aa  91.7  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4556  Beta-galactosidase  29.51 
 
 		 610 aa  89.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108678  normal  0.0283315 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2925  Beta-galactosidase  27.98 
 
 		 799 aa  87.8  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1933  Beta-galactosidase  29.12 
 
 		 612 aa  86.7  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01626  beta-galactosidase  29.39 
 
 		 613 aa  87  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453001  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5411  Beta-galactosidase  25.39 
 
 		 586 aa  86.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.42814  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2009  Beta-galactosidase  28.57 
 
 		 612 aa  85.9  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.237647  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6542  Beta-galactosidase  29.23 
 
 		 632 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.638315  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0771  Beta-galactosidase  29.89 
 
 		 643 aa  85.1  0.000000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7453  Beta-galactosidase  30.6 
 
 		 576 aa  84.7  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563047  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0350  beta-galactosidase  26.06 
 
 		 598 aa  84  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27720  beta-galactosidase  27.64 
 
 		 924 aa  83.2  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.23189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1050  Beta-galactosidase  32.94 
 
 		 580 aa  82  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.869606  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00756  beta-galactosidase (Eurofung)  30.05 
 
 		 985 aa  80.5  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.688581 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3250  Beta-galactosidase  29.61 
 
 		 796 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04160  beta-galactosidase  28.57 
 
 		 631 aa  79.7  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1479  Beta-galactosidase  28.42 
 
 		 801 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.988744  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37160  beta-galactosidase  30.36 
 
 		 832 aa  75.9  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.119292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14250  beta-galactosidase  29.51 
 
 		 802 aa  76.3  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.507972  normal  0.940831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  34.4 
 
 		 1392 aa  76.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00980  beta-galactosidase (Eurofung)  36.63 
 
 		 996 aa  72  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.938367 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45673  beta-galactosidase  27.55 
 
 		 951 aa  68.2  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0900  Beta-galactosidase  27.78 
 
 		 892 aa  68.2  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.698907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1364  Beta-galactosidase  26.2 
 
 		 827 aa  63.9  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441144 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3197  Beta-galactosidase  24.07 
 
 		 661 aa  55.5  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271106  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5486  Beta-galactosidase  23.89 
 
 		 663 aa  55.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761989  hitchhiker  0.000330975 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4931  Beta-galactosidase  24.07 
 
 		 663 aa  54.3  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0648611 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4578  Beta-galactosidase  25 
 
 		 664 aa  53.9  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144299 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5657  Beta-galactosidase  25 
 
 		 664 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00663858  normal  0.40275 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5202  Beta-galactosidase  25 
 
 		 664 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.856038  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2352  Beta-galactosidase  22.97 
 
 		 660 aa  53.9  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0870691  normal  0.136979 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4585  Beta-galactosidase  23.44 
 
 		 660 aa  52.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3288  Beta-galactosidase  24.41 
 
 		 656 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4877  Beta-galactosidase  24.41 
 
 		 656 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.713772  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2811  Beta-galactosidase  23.04 
 
 		 646 aa  49.3  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.206861 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3380  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  22.76 
 
 		 699 aa  48.9  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3245  Beta-galactosidase  22.92 
 
 		 673 aa  45.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2015  Beta-galactosidase  23.28 
 
 		 657 aa  45.1  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000219156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0871  hypothetical protein  31 
 
 		 628 aa  44.3  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794534 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>