103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0003 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0003  peptidase M28  100 
 
 
319 aa  654    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1913  peptidase M28  36.22 
 
 
304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1040  peptidase M28  31.49 
 
 
320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3904  peptidase M28  32.1 
 
 
344 aa  136  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.581158  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2157  glutamine cyclotransferase-related protein  34.04 
 
 
333 aa  133  5e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5551  peptidase M28  30.62 
 
 
343 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7526  hypothetical protein  35.13 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3417  leucine aminopeptidase  30.42 
 
 
339 aa  109  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2681  peptidase M28  28.53 
 
 
325 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0134  peptidase M28  30 
 
 
314 aa  98.6  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0768  hypothetical protein  30.54 
 
 
335 aa  92  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0856  peptidase M28  28.35 
 
 
336 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1835  peptidase M28  27.86 
 
 
315 aa  87.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.174438  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  27.61 
 
 
775 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  30.53 
 
 
391 aa  76.3  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1748  peptidase M28  28.34 
 
 
430 aa  72.8  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2164  peptidase M28  34.69 
 
 
512 aa  71.2  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.502107  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  24.57 
 
 
333 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0652  hypothetical protein  29.52 
 
 
591 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  27.49 
 
 
574 aa  65.5  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0660  hypothetical protein  29.81 
 
 
568 aa  63.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61826 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  28.02 
 
 
1103 aa  63.2  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  29.1 
 
 
338 aa  63.2  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1604  peptidase M28  27.84 
 
 
291 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.548091 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1386  peptidase M28  32.28 
 
 
323 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.492148  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2420  M28A family peptidase  32.28 
 
 
323 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.564351  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5675  peptidase M28  25.85 
 
 
457 aa  60.8  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00555231 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  26.24 
 
 
674 aa  60.8  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  30.43 
 
 
598 aa  60.1  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2428  M28 family peptidase  36.52 
 
 
273 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2848  aminopeptidase  26.36 
 
 
457 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000136315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3155  peptidase M28  29.06 
 
 
436 aa  57.4  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000680764  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0187  peptidase M28  25.91 
 
 
356 aa  57.4  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5420  peptidase M28  31.75 
 
 
759 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.240058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8611  peptidase M28  27.78 
 
 
764 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0628073  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0032  hypothetical protein  27.03 
 
 
397 aa  53.9  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0754  peptidase M28  24.75 
 
 
339 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.050482 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0031  hypothetical protein  26.52 
 
 
397 aa  53.5  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3374  hypothetical protein  25.56 
 
 
476 aa  53.1  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0508877  normal  0.0110235 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0809  peptidase M28  32.96 
 
 
625 aa  53.5  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0052  peptidase M28  25.09 
 
 
308 aa  52.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000295021 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16010  predicted aminopeptidase  27.27 
 
 
335 aa  52.8  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.964199  hitchhiker  0.000000285922 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0920  peptidases M20 and M28  26.04 
 
 
282 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3011  peptidase M28  31.79 
 
 
325 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844179  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3053  peptidase M28  31.79 
 
 
325 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.387481 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1065  peptidase M28  29.82 
 
 
455 aa  52.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.377443  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2427  peptidase family protein  28.12 
 
 
447 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2137  peptidase family protein  28.12 
 
 
447 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  23.98 
 
 
407 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04290  hypothetical protein  30.77 
 
 
647 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00560134  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0419  hypothetical protein  30.26 
 
 
647 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1044  peptidase M28  26.05 
 
 
306 aa  50.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0202745 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0054  peptidase M28  24.11 
 
 
335 aa  50.4  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0141  peptidase M28  27.24 
 
 
524 aa  49.7  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.481582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3936  peptidase M28  29.17 
 
 
616 aa  50.1  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  25.26 
 
 
466 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  25.26 
 
 
466 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  28.16 
 
 
440 aa  48.9  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1537  peptidase M28  26.67 
 
 
571 aa  48.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000191422 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  25.82 
 
 
555 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4664  peptidase M28  27.08 
 
 
526 aa  47.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062927  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  24.88 
 
 
450 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4970  aminopeptidase-like protein  38.14 
 
 
442 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2070  peptidase M28  33 
 
 
309 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  23.37 
 
 
947 aa  46.6  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  24.23 
 
 
466 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3219  peptidase M28  25.67 
 
 
306 aa  46.6  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.115329  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  23.91 
 
 
323 aa  46.2  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  24.74 
 
 
466 aa  46.2  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  24.74 
 
 
466 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0578  peptidase M28  29.13 
 
 
373 aa  46.2  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.43286  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  24.74 
 
 
466 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17180  predicted aminopeptidase  29.77 
 
 
747 aa  46.2  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00826733  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  29.95 
 
 
501 aa  45.8  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  22.9 
 
 
1247 aa  45.8  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  24.74 
 
 
466 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02603  aminopeptidase in alkaline phosphatase isozyme conversion  28.85 
 
 
345 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0935  peptidase M28  28.85 
 
 
345 aa  45.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1467  peptidase M28  33.64 
 
 
305 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  27.37 
 
 
466 aa  45.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2891  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  28.85 
 
 
345 aa  45.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3054  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  28.85 
 
 
345 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.957011  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  30 
 
 
309 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0959  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  28.85 
 
 
345 aa  45.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.73903 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2879  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  28.85 
 
 
345 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3121  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  28.85 
 
 
345 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4005  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  28.85 
 
 
345 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02568  hypothetical protein  28.85 
 
 
345 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2824  peptidase M28  28.14 
 
 
771 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264014  normal  0.0144765 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  36.73 
 
 
944 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3437  peptidase M28  34.04 
 
 
453 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160047 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0815  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  24.65 
 
 
357 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1107  peptidase M28  28.41 
 
 
576 aa  45.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  29.89 
 
 
465 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  29.12 
 
 
463 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  25.59 
 
 
584 aa  43.9  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  29.89 
 
 
466 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  28.74 
 
 
466 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  25.4 
 
 
308 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2998  peptidase M28  29.87 
 
 
778 aa  43.9  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>