More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1231 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1231  GTP-binding proten HflX  100 
 
 		 370 aa  743    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1309  GTP-binding protein HflX  47.8 
 
 		 372 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1886  GTP-binding protein HflX  47.74 
 
 		 406 aa  268  2e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.968139 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  48.17 
 
 		 396 aa  263  3e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  40.88 
 
 		 441 aa  259  4e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1171  GTP-binding protein, HSR1-related  45.05 
 
 		 409 aa  256  4e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04515  GTP-binding protein HflX  45.34 
 
 		 407 aa  254  1.0000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.546831  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  40.93 
 
 		 421 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  43.77 
 
 		 401 aa  254  2.0000000000000002e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  41.39 
 
 		 442 aa  253  3e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0275  GTP-binding proten HflX  42.34 
 
 		 564 aa  252  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  42.34 
 
 		 564 aa  252  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6253  GTP-binding proten HflX  44.13 
 
 		 426 aa  251  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  42.9 
 
 		 435 aa  250  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  42.95 
 
 		 553 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3121  GTP-binding proten HflX  39.49 
 
 		 411 aa  248  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653968 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  45.86 
 
 		 422 aa  246  4.9999999999999997e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2221  GTP-binding proten HflX  40.06 
 
 		 387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0658  GTP-binding proten HflX  43.89 
 
 		 425 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1906  GTP-binding proten HflX  41.62 
 
 		 583 aa  243  3e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  41.5 
 
 		 433 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1232  hypothetical protein  39.28 
 
 		 395 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.125901 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1339  GTP-binding protein HflX  39.76 
 
 		 387 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  39.76 
 
 		 387 aa  243  6e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  39.76 
 
 		 387 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  39.76 
 
 		 392 aa  242  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  39.76 
 
 		 387 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1100  GTP-binding protein HflX  39.76 
 
 		 387 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0590  GTP-binding proten HflX  43.77 
 
 		 396 aa  241  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1834  GTP-binding protein, HSR1-related  41.86 
 
 		 528 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  39.46 
 
 		 392 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  39.62 
 
 		 419 aa  241  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1717  GTP-binding proten HflX  39.16 
 
 		 396 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658318  normal  0.277641 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  39.16 
 
 		 396 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1414  GTP-binding proten HflX  40.06 
 
 		 414 aa  239  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000434774 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1600  small GTP-binding protein  39.76 
 
 		 404 aa  240  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0793347  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2535  GTP-binding proten HflX  39.76 
 
 		 404 aa  239  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955087  hitchhiker  0.0000726108 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4208  GTP-binding protein, HSR1-related  42.02 
 
 		 574 aa  240  4e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0410  GTP-binding protein HflX  41.93 
 
 		 420 aa  239  5e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5107  small GTP-binding protein  38.86 
 
 		 396 aa  238  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  40.62 
 
 		 434 aa  238  1e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  40 
 
 		 509 aa  238  1e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1830  GTP-binding proten HflX  38.86 
 
 		 395 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1744  small GTP-binding protein  38.86 
 
 		 396 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1806  small GTP-binding protein  38.86 
 
 		 395 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2747  GTP-binding proten HflX  39.37 
 
 		 419 aa  238  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303435  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  39.77 
 
 		 401 aa  237  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1212  GTP-binding protein HflX  42.03 
 
 		 412 aa  238  2e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2448  GTP-binding protein HflX  40.17 
 
 		 535 aa  237  2e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382552 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0122  GTP-binding protein HSR1-related  39.94 
 
 		 421 aa  237  3e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000776229  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  41.64 
 
 		 440 aa  237  3e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  47.81 
 
 		 395 aa  236  3e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  43.49 
 
 		 413 aa  236  4e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1506  GTP-binding proten HflX  39.19 
 
 		 433 aa  236  5.0000000000000005e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00115562  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  38.8 
 
 		 419 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  38.8 
 
 		 419 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  41.78 
 
 		 419 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  41.42 
 
 		 406 aa  235  8e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  39.64 
 
 		 435 aa  235  8e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  38.79 
 
 		 461 aa  235  9e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  40.27 
 
 		 428 aa  235  9e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  41.45 
 
 		 419 aa  235  9e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  38.9 
 
 		 419 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  38.9 
 
 		 419 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  42.76 
 
 		 431 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  39.88 
 
 		 435 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  38.9 
 
 		 419 aa  233  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  37.54 
 
 		 417 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  38.53 
 
 		 441 aa  233  5e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  40.2 
 
 		 436 aa  232  6e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  39.19 
 
 		 419 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  40.79 
 
 		 426 aa  232  7.000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  39.88 
 
 		 435 aa  232  7.000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1922  GTPase  39.78 
 
 		 375 aa  232  7.000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.321489  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  40.79 
 
 		 426 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  41.45 
 
 		 419 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  39.19 
 
 		 454 aa  232  8.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  40.79 
 
 		 426 aa  232  9e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  40.79 
 
 		 426 aa  232  9e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  40.79 
 
 		 426 aa  232  9e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  40.79 
 
 		 426 aa  232  9e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  40.79 
 
 		 426 aa  232  9e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  40.79 
 
 		 426 aa  232  9e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  40.79 
 
 		 426 aa  232  9e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  41.47 
 
 		 426 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  41.47 
 
 		 426 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  41.47 
 
 		 426 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0599  GTP-binding protein, HSR1-related  40.77 
 
 		 435 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00843062  hitchhiker  0.00021975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3431  GTP-binding protein, HSR1-related  40.77 
 
 		 435 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253406  normal  0.0436905 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  39.82 
 
 		 479 aa  231  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  41.47 
 
 		 426 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  41.45 
 
 		 431 aa  231  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  41.47 
 
 		 426 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0069  GTP-binding protein  40.68 
 
 		 450 aa  231  2e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  35.54 
 
 		 436 aa  231  2e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0356  putative GTPase HflX  41.95 
 
 		 426 aa  231  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.152366  hitchhiker  0.00466267 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1195  GTP-binding protein  39.49 
 
 		 412 aa  231  2e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00118595  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0598  GTP-binding protein, HSR1-related  40 
 
 		 435 aa  231  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.472321  hitchhiker  0.00000215533 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0811  GTP-binding proten HflX  42.34 
 
 		 509 aa  230  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000455725  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  38.21 
 
 		 435 aa  230  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>