More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2832 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2832  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  100 
 
 		 324 aa  662    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1809  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  29.25 
 
 		 339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.835829  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2401  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  31.22 
 
 		 279 aa  122  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0698  hypothetical protein  26.9 
 
 		 343 aa  119  9e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2834  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  31.17 
 
 		 249 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3029  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.82 
 
 		 357 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3028  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.1 
 
 		 250 aa  99.4  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1807  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  26.41 
 
 		 258 aa  98.6  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0700  hypothetical protein  25.81 
 
 		 259 aa  96.3  7e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1491  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.38 
 
 		 261 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1808  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.79 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.580439  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0699  hypothetical protein  24.02 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6856  hypothetical protein  25.12 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3383  gas vesicle synthesis GvpLF  26.46 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2373  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.6 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4705  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.46 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2376  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.98 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2335  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.98 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90915  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2382  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.98 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.204726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0332  GvpF  22.89 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.734625 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0335  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.36 
 
 		 211 aa  57  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1411  DnaJ family protein  46.43 
 
 		 330 aa  55.5  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2355  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.67 
 
 		 243 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1192  molecular chaperone, DnaJ family  48.21 
 
 		 330 aa  55.5  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.159001  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0027  chaperone protein DnaJ  52 
 
 		 374 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0527  chaperone protein DnaJ  51.02 
 
 		 364 aa  55.1  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  52 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0285  chaperone DnaJ domain protein  44.64 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08256  chaperone protein dnaJ  42.59 
 
 		 376 aa  54.3  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.482747  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0039  chaperone protein DnaJ  50 
 
 		 377 aa  53.9  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0198  chaperone protein DnaJ  48 
 
 		 404 aa  54.3  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0132968  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  43.64 
 
 		 377 aa  54.3  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0034  chaperone protein DnaJ  50 
 
 		 378 aa  54.3  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.953723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  40.35 
 
 		 373 aa  53.9  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  39.29 
 
 		 287 aa  54.3  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2117  chaperone protein DnaJ  47.06 
 
 		 387 aa  54.3  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.0390426 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1218  chaperone DnaJ domain-containing protein  46.3 
 
 		 330 aa  53.5  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0453172  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1670  chaperone protein DnaJ  44.9 
 
 		 382 aa  53.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.890746  normal  0.0271561 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0771  DnaJ-like curved DNA-binding protein  48 
 
 		 296 aa  53.5  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.63005e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0236  chaperone protein DnaJ  48.98 
 
 		 380 aa  53.5  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  46 
 
 		 377 aa  53.1  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0345  heat shock protein DnaJ domain protein  47.27 
 
 		 258 aa  52.8  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00881466 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  41.82 
 
 		 377 aa  52.8  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24547  predicted protein  44.44 
 
 		 2272 aa  52.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.733966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74586  DnaJ-like protein  42.11 
 
 		 460 aa  52  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.869575  normal  0.702487 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1995  chaperone protein DnaJ  44 
 
 		 379 aa  52.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.396046  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1980  chaperone protein DnaJ  46 
 
 		 378 aa  52  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04440  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  44.9 
 
 		 332 aa  52  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.253974 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1437  chaperone protein DnaJ  44 
 
 		 379 aa  52  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4701  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.88 
 
 		 254 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0854  chaperone protein DnaJ  46 
 
 		 395 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000496587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2162  chaperone protein DnaJ  46.94 
 
 		 367 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1148  chaperone protein DnaJ  46.94 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.697031  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  41.07 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2103  heat shock protein DnaJ domain protein  39.29 
 
 		 220 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000586336  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12180  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  42.86 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.856046  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.35 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3619  chaperone DnaJ domain protein  46 
 
 		 326 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38560  chaperone protein DnaJ  44.9 
 
 		 387 aa  51.2  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0413563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1756  chaperone protein DnaJ  44.9 
 
 		 384 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.426165  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_002620  TC0619  chaperone protein DnaJ  46 
 
 		 392 aa  50.8  0.00003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1460  chaperone protein DnaJ  46 
 
 		 385 aa  50.8  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1487  chaperone protein DnaJ  46 
 
 		 382 aa  50.8  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.992778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2074  chaperone protein DnaJ  45.1 
 
 		 376 aa  51.2  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  40.35 
 
 		 311 aa  50.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0055  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  21.31 
 
 		 205 aa  50.8  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00610804  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0245  chaperone protein DnaJ  44 
 
 		 383 aa  50.8  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1258  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  19.75 
 
 		 268 aa  50.8  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.811139 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02731  protein mitochondrial targeting protein (Mas1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05040)  41.18 
 
 		 412 aa  50.4  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.493664  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  44 
 
 		 376 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1396  chaperone protein DnaJ  39.39 
 
 		 373 aa  50.4  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.427983  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1255  chaperone protein DnaJ  44 
 
 		 297 aa  50.4  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.559961  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1065  DnaJ domain-containing protein  47.27 
 
 		 298 aa  50.4  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0465  chaperone protein DnaJ  39.39 
 
 		 374 aa  50.4  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141639  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0200  chaperone DnaJ domain protein  44 
 
 		 297 aa  50.4  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000536584 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0623  chaperone protein DnaJ  46 
 
 		 384 aa  50.4  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0379  chaperone protein DnaJ  46 
 
 		 376 aa  50.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2310  chaperone protein DnaJ  42 
 
 		 381 aa  50.1  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0217  chaperone DnaJ domain protein  44 
 
 		 297 aa  50.1  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000962373  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1288  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.07 
 
 		 316 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479526  normal  0.450004 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03871  DnaJ3 protein  40.38 
 
 		 319 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.148184 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0569  chaperone DnaJ domain protein  39.29 
 
 		 318 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0390561 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0934  chaperone DnaJ domain-containing protein  34.29 
 
 		 320 aa  50.1  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0828376 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1571  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.19 
 
 		 348 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.869023  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3361  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 		 374 aa  49.7  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151638  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3570  chaperone protein DnaJ  40 
 
 		 383 aa  50.1  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2960  heat shock protein DnaJ domain protein  40.68 
 
 		 340 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00431414  normal  0.488513 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5050  chaperone protein DnaJ  44 
 
 		 368 aa  49.7  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  38.16 
 
 		 341 aa  49.7  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0009  chaperone protein DnaJ  38.78 
 
 		 385 aa  49.7  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111301  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4973  chaperone protein DnaJ  46 
 
 		 386 aa  49.7  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0482542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1572  chaperone DnaJ domain protein  43.14 
 
 		 386 aa  49.7  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.123159  normal  0.0160005 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3323  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42 
 
 		 643 aa  49.7  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.429446  normal  0.119258 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05510  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  40 
 
 		 361 aa  49.3  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.731884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1645  chaperone protein DnaJ  44.9 
 
 		 383 aa  49.3  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0266103  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.6 
 
 		 324 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1751  chaperone protein DnaJ  46 
 
 		 374 aa  49.3  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1276  chaperone protein DnaJ  37.88 
 
 		 374 aa  49.3  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00131629  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1776  chaperone protein DnaJ  42 
 
 		 383 aa  49.3  0.00009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2626  chaperone DnaJ  39.29 
 
 		 326 aa  49.3  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>