204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1343 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1343  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
348 aa  717    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1366  acyl-CoA hydrolase  73.28 
 
 
349 aa  547  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.4957199999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1721  thioesterase superfamily protein  75.86 
 
 
347 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000371928  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2365  thioesterase superfamily  67.82 
 
 
347 aa  480  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0563  thioesterase superfamily protein  65.1 
 
 
361 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0566  thioesterase superfamily protein  64.81 
 
 
361 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0534  thioesterase superfamily protein  64.52 
 
 
390 aa  438  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.208081  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2952  thioesterase superfamily protein  60.77 
 
 
358 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3039  thioesterase superfamily protein  60.77 
 
 
358 aa  414  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.535979  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3147  thioesterase superfamily protein  60.47 
 
 
358 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0369215  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3708  thioesterase superfamily protein  57.66 
 
 
351 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1061  thioesterase superfamily protein  56.76 
 
 
351 aa  365  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.366227  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3599  thioesterase superfamily protein  57.66 
 
 
351 aa  355  5e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05790  conserved hypothetical protein  27.49 
 
 
493 aa  88.2  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.747278  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38503  predicted protein  25.66 
 
 
368 aa  81.3  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10552  acyl-CoA thioester hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07060)  28.47 
 
 
463 aa  80.1  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.555587  normal  0.28728 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2092  thioesterase superfamily protein  33.73 
 
 
162 aa  77.8  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1557  thioesterase superfamily protein  37.23 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000371893  hitchhiker  0.00000555084 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4040  thioesterase superfamily protein  36.73 
 
 
161 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0732  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
178 aa  75.5  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.424709  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4748  Thioesterase superfamily  33.72 
 
 
169 aa  74.7  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 
168 aa  72.8  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0743  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  37.3 
 
 
187 aa  71.2  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3968  hypothetical protein  36.09 
 
 
166 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05225  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  34.69 
 
 
164 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.917425 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29290  hypothetical protein  35.34 
 
 
166 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3908  thioesterase superfamily protein  34.01 
 
 
167 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000524164  normal  0.88258 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4022  thioesterase superfamily protein  34.01 
 
 
167 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.0000000809189  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1695  thioesterase superfamily protein  35.77 
 
 
161 aa  67.8  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.472508  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3367  thioesterase superfamily protein  39.6 
 
 
178 aa  67  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241986  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2365  thioesterase superfamily protein  34.33 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405025  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2333  thioesterase superfamily protein  34.31 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2844  thioesterase superfamily protein  34.31 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2512  thioesterase superfamily protein  34.75 
 
 
167 aa  66.2  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00440997 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72810  hypothetical protein  36.36 
 
 
188 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.432575  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6320  hypothetical protein  36.36 
 
 
160 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329807  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3519  thioesterase superfamily protein  31.91 
 
 
162 aa  64.3  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0788817  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0127  Acyl-Coa thioester hydrolase protein  38.61 
 
 
153 aa  63.9  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2829  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
180 aa  64.3  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.61254  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2101  thioesterase superfamily protein  34.31 
 
 
168 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0616916  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1994  thioesterase family protein  34.31 
 
 
146 aa  64.3  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1441  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
161 aa  63.9  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3511  thioesterase superfamily protein  31.48 
 
 
189 aa  63.9  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269627  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11393  putative acyl-CoA thioester hydrolase  30 
 
 
180 aa  63.2  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5069  thioesterase superfamily protein  34.68 
 
 
161 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01760  Thioesterase superfamily protein  35.56 
 
 
163 aa  62.4  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4528  thioesterase superfamily protein  36.89 
 
 
161 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1352  thioesterase superfamily protein  37.89 
 
 
180 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0082018  hitchhiker  0.000000391158 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2939  thioesterase superfamily protein  34.03 
 
 
171 aa  61.2  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0023  acyl-CoA hydrolase  33.58 
 
 
173 aa  61.6  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5520  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  34.82 
 
 
161 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0067  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 
182 aa  61.2  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5649  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 
160 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0146738 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4153  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 
167 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104889  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  27.56 
 
 
176 aa  57.4  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  27.56 
 
 
176 aa  57.4  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73691  predicted protein  22.94 
 
 
502 aa  57.4  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.405416  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5134  thioesterase superfamily protein  35.79 
 
 
161 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  28.69 
 
 
176 aa  56.2  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1797  thioesterase superfamily protein  31.94 
 
 
167 aa  56.2  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.076404  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5356  thioesterase superfamily protein  35.05 
 
 
161 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.923329 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5405  thioesterase superfamily protein  35.05 
 
 
161 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0779904 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5264  thioesterase superfamily protein  35.05 
 
 
161 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3558  putative thioesterase  32.62 
 
 
162 aa  55.8  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3235  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
143 aa  55.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0561934 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0385  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 
142 aa  53.5  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.125314  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4068  thioesterase superfamily protein  24.56 
 
 
158 aa  52.8  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00186471  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0694  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 
155 aa  52.8  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0261705  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1397  thioesterase superfamily protein  34.33 
 
 
172 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1262  thioesterase superfamily protein  25.78 
 
 
174 aa  52.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.68115 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2122  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  25.55 
 
 
168 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548255  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1906  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  25.55 
 
 
171 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1869  acyl-CoA hydrolase  25.55 
 
 
171 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2086  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  25.55 
 
 
168 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1859  acyl-CoA hydrolase  25.55 
 
 
171 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00890651  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2516  putative acyl-CoA hydrolase  34 
 
 
158 aa  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0336  thioesterase family protein  32.61 
 
 
176 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000518739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2053  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  25.55 
 
 
168 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.255856  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  23.68 
 
 
176 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2154  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  25.55 
 
 
168 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0276384  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5821  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 
185 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.380127 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1542  thioesterase superfamily protein  24.81 
 
 
168 aa  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00786106  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0351  thioesterase superfamily protein  25.21 
 
 
147 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0899  thioesterase family protein  27.27 
 
 
137 aa  50.8  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000117168  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3882  thioesterase superfamily protein  21.43 
 
 
327 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000227508 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2480  Acyl-CoA hydrolase-like  32.63 
 
 
185 aa  51.2  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2809  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
173 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0030  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 
139 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137519  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0993  thioesterase family protein  27.27 
 
 
137 aa  50.8  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3266  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  24.82 
 
 
168 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0875914  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2043  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  24.82 
 
 
168 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.701837  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0922  thioesterase family protein  27.27 
 
 
137 aa  50.8  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000350062  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0027  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 
139 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0243965 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3088  thioesterase superfamily protein  30.97 
 
 
129 aa  50.1  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.941483 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 
164 aa  50.1  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1596  thioesterase superfamily protein  21.71 
 
 
161 aa  50.1  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2218  putative Acyl-CoA thioester hydrolase  30.63 
 
 
136 aa  49.7  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2184  acyl-CoA thioester hydrolase  30.77 
 
 
140 aa  49.3  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117978  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0650  thioesterase superfamily protein  23.3 
 
 
270 aa  49.3  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2084  thioesterase superfamily protein  22.5 
 
 
311 aa  49.3  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.305359  normal  0.763617 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>