More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3708 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3708  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 351 aa  729    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3599  thioesterase superfamily protein  90.6 
 
 		 351 aa  620  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1061  thioesterase superfamily protein  78.06 
 
 		 351 aa  558  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.366227  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1343  thioesterase superfamily protein  57.66 
 
 		 348 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1366  acyl-CoA hydrolase  54.3 
 
 		 349 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.4957199999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1721  thioesterase superfamily protein  53.29 
 
 		 347 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000371928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2365  thioesterase superfamily  52.54 
 
 		 347 aa  341  9e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0563  thioesterase superfamily protein  51.49 
 
 		 361 aa  338  8e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0566  thioesterase superfamily protein  51.49 
 
 		 361 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3147  thioesterase superfamily protein  52.84 
 
 		 358 aa  332  7.000000000000001e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0369215  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2952  thioesterase superfamily protein  52.84 
 
 		 358 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3039  thioesterase superfamily protein  52.84 
 
 		 358 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.535979  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0534  thioesterase superfamily protein  50.45 
 
 		 390 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.208081  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3367  thioesterase superfamily protein  39.26 
 
 		 178 aa  88.6  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241986  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38503  predicted protein  26.3 
 
 		 368 aa  86.3  7e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4040  thioesterase superfamily protein  39.86 
 
 		 161 aa  86.3  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10552  acyl-CoA thioester hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07060)  30.27 
 
 		 463 aa  85.1  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.555587  normal  0.28728 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1695  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 161 aa  83.6  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.472508  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05790  conserved hypothetical protein  26.81 
 
 		 493 aa  82.8  0.000000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.747278  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1557  thioesterase superfamily protein  39.23 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000371893  hitchhiker  0.00000555084 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0732  thioesterase superfamily protein  39.23 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.424709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4748  Thioesterase superfamily  36.62 
 
 		 169 aa  82.4  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1994  thioesterase family protein  40.43 
 
 		 146 aa  82.4  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2092  thioesterase superfamily protein  35.51 
 
 		 162 aa  80.9  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0023  acyl-CoA hydrolase  39.72 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72810  hypothetical protein  36.92 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.432575  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05225  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  35.82 
 
 		 164 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.917425 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4153  thioesterase superfamily protein  35.88 
 
 		 167 aa  78.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4022  thioesterase superfamily protein  35.51 
 
 		 167 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.0000000809189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3908  thioesterase superfamily protein  35.51 
 
 		 167 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000524164  normal  0.88258 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0743  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  37.69 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6320  hypothetical protein  36.15 
 
 		 160 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329807  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29290  hypothetical protein  34.62 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11393  putative acyl-CoA thioester hydrolase  32.54 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  34.33 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3519  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 		 162 aa  75.9  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0788817  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3968  hypothetical protein  33.85 
 
 		 166 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01760  Thioesterase superfamily protein  33.8 
 
 		 163 aa  73.9  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2829  thioesterase superfamily protein  35.96 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.61254  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2512  thioesterase superfamily protein  35.82 
 
 		 167 aa  72  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00440997 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2939  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 171 aa  71.2  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0127  Acyl-Coa thioester hydrolase protein  38.53 
 
 		 153 aa  70.9  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4109  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5520  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.29 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2365  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5649  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146738 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1282  thioesterase superfamily protein  29.09 
 
 		 136 aa  69.3  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.484211 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1441  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 161 aa  68.9  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5069  thioesterase superfamily protein  38.39 
 
 		 161 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0067  thioesterase superfamily protein  28.74 
 
 		 182 aa  68.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2101  thioesterase superfamily protein  34.07 
 
 		 168 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0616916  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1489  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 		 142 aa  68.2  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.596462 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2333  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 		 166 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1352  thioesterase superfamily protein  34.62 
 
 		 180 aa  67.8  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0082018  hitchhiker  0.000000391158 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2844  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 		 166 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1929  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 		 139 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.433296  normal  0.844818 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5405  thioesterase superfamily protein  34.07 
 
 		 161 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779904 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2205  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 		 139 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1820  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 139 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.45574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3882  thioesterase superfamily protein  25.31 
 
 		 327 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000227508 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5134  thioesterase superfamily protein  31.34 
 
 		 161 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2480  Acyl-CoA hydrolase-like  32.33 
 
 		 185 aa  65.1  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0694  thioesterase superfamily protein  31.43 
 
 		 155 aa  63.9  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0261705  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4528  thioesterase superfamily protein  37.89 
 
 		 161 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  29.36 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0502  thioesterase superfamily protein  22.53 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0899  thioesterase family protein  28.95 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000117168  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4187  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0922  thioesterase family protein  28.95 
 
 		 137 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000350062  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0796  acyl-CoA thioester hydrolase, putative  32.81 
 
 		 157 aa  62  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0993  thioesterase family protein  28.95 
 
 		 137 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2948  thioesterase superfamily protein  29.08 
 
 		 168 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0987  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 		 169 aa  62.4  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3558  putative thioesterase  34.33 
 
 		 162 aa  62  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5356  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 161 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.923329 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  30.43 
 
 		 176 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0359  putative acyl-CoA thioester hydrolase  33.64 
 
 		 155 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  30.43 
 
 		 176 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2214  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 170 aa  62  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5264  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 161 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1642  acyl-CoA thioester hydrolase YciA  31.25 
 
 		 137 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0172566  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1037  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  30.08 
 
 		 168 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3088  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 129 aa  61.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941483 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0410  thioesterase superfamily protein  29.38 
 
 		 171 aa  60.8  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0584  thioesterase superfamily protein  30.91 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0477  hypothetical protein  31.3 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7651  thioesterase superfamily protein  34.11 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1457  thioesterase superfamily protein  29.36 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.412041  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1542  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00786106  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2742  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0603577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0858  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2103  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174742  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3511  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2715  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0650  thioesterase superfamily protein  24.54 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1763  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4412  thioesterase superfamily protein  29.76 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2569  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029827  hitchhiker  0.00345212 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73691  predicted protein  23.84 
 
 		 502 aa  59.7  0.00000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.405416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1720  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00965102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>