292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1366 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1366  acyl-CoA hydrolase  100 
 
 
349 aa  726    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.4957199999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1343  thioesterase superfamily protein  73.28 
 
 
348 aa  547  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1721  thioesterase superfamily protein  66.95 
 
 
347 aa  481  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000371928  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2365  thioesterase superfamily  64.66 
 
 
347 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0563  thioesterase superfamily protein  61.81 
 
 
361 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0566  thioesterase superfamily protein  61.81 
 
 
361 aa  441  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0534  thioesterase superfamily protein  61.22 
 
 
390 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.208081  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3039  thioesterase superfamily protein  60.7 
 
 
358 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.535979  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2952  thioesterase superfamily protein  60.12 
 
 
358 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3147  thioesterase superfamily protein  59.53 
 
 
358 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0369215  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3708  thioesterase superfamily protein  54.3 
 
 
351 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1061  thioesterase superfamily protein  53.73 
 
 
351 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.366227  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3599  thioesterase superfamily protein  53.71 
 
 
351 aa  339  2.9999999999999998e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4040  thioesterase superfamily protein  38.41 
 
 
161 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10552  acyl-CoA thioester hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07060)  28.91 
 
 
463 aa  81.6  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.555587  normal  0.28728 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4748  Thioesterase superfamily  38.64 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_003296  RS05225  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  40 
 
 
164 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.917425 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1557  thioesterase superfamily protein  35.22 
 
 
188 aa  78.6  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000371893  hitchhiker  0.00000555084 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0732  thioesterase superfamily protein  37.21 
 
 
178 aa  79  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.424709  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0743  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  37.21 
 
 
187 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38503  predicted protein  25.48 
 
 
368 aa  78.2  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  36.2 
 
 
168 aa  76.3  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4022  thioesterase superfamily protein  37.23 
 
 
167 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.0000000809189  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3908  thioesterase superfamily protein  37.23 
 
 
167 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000524164  normal  0.88258 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11393  putative acyl-CoA thioester hydrolase  32.48 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29290  hypothetical protein  36.84 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1994  thioesterase family protein  35.46 
 
 
146 aa  72.4  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3968  hypothetical protein  36.09 
 
 
166 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0023  acyl-CoA hydrolase  34.75 
 
 
173 aa  70.9  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72810  hypothetical protein  37.12 
 
 
188 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.432575  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2333  thioesterase superfamily protein  34.81 
 
 
166 aa  70.5  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4153  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 
167 aa  70.5  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104889  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2844  thioesterase superfamily protein  34.81 
 
 
166 aa  70.5  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2365  thioesterase superfamily protein  36.43 
 
 
168 aa  70.1  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405025  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3367  thioesterase superfamily protein  36.43 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241986  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05790  conserved hypothetical protein  25.81 
 
 
493 aa  69.3  0.00000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.747278  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0127  Acyl-Coa thioester hydrolase protein  38.94 
 
 
153 aa  68.9  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2101  thioesterase superfamily protein  34.81 
 
 
168 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0616916  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6320  hypothetical protein  36.36 
 
 
160 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329807  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0067  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 
182 aa  67.4  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2512  thioesterase superfamily protein  34.75 
 
 
167 aa  67.4  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00440997 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1695  thioesterase superfamily protein  32.89 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.472508  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2829  thioesterase superfamily protein  38.24 
 
 
180 aa  65.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.61254  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2092  thioesterase superfamily protein  33.78 
 
 
162 aa  65.9  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2480  Acyl-CoA hydrolase-like  35.29 
 
 
185 aa  64.7  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4528  thioesterase superfamily protein  38.14 
 
 
161 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01760  Thioesterase superfamily protein  34.88 
 
 
163 aa  65.1  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3519  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 
162 aa  64.3  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0788817  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5520  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  35.96 
 
 
161 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5649  thioesterase superfamily protein  34.71 
 
 
160 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0146738 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1441  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 
161 aa  63.9  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2939  thioesterase superfamily protein  34.01 
 
 
171 aa  63.5  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3558  putative thioesterase  33.74 
 
 
162 aa  62.8  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5069  thioesterase superfamily protein  35.09 
 
 
161 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1352  thioesterase superfamily protein  37.89 
 
 
180 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0082018  hitchhiker  0.000000391158 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5134  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 
161 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  32.2 
 
 
176 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3511  thioesterase superfamily protein  35.85 
 
 
189 aa  62  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269627  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  27.81 
 
 
176 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  27.81 
 
 
176 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5356  thioesterase superfamily protein  36.08 
 
 
161 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.923329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5264  thioesterase superfamily protein  36.08 
 
 
161 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5405  thioesterase superfamily protein  36.84 
 
 
161 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0779904 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3235  thioesterase superfamily protein  32.46 
 
 
143 aa  59.3  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0561934 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4068  thioesterase superfamily protein  25.89 
 
 
158 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00186471  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3882  thioesterase superfamily protein  23.99 
 
 
327 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000227508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5821  thioesterase superfamily protein  35.16 
 
 
185 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.380127 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4109  thioesterase superfamily protein  23.17 
 
 
328 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2910  thioesterase superfamily protein  26.81 
 
 
165 aa  57.8  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0240786  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  26.02 
 
 
176 aa  57.4  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0351  thioesterase superfamily protein  26.89 
 
 
147 aa  57  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2184  acyl-CoA thioester hydrolase  33.33 
 
 
140 aa  57  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117978  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1253  thioesterase superfamily protein  34.18 
 
 
334 aa  57  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.40136  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02221  Thioesterase superfamily protein  29.85 
 
 
169 aa  57  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5219  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 
170 aa  56.6  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0502  thioesterase superfamily protein  23.7 
 
 
315 aa  56.2  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1596  thioesterase superfamily protein  22.22 
 
 
161 aa  55.5  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1906  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  27.35 
 
 
171 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1869  acyl-CoA hydrolase  27.35 
 
 
171 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146008  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1859  acyl-CoA hydrolase  27.35 
 
 
171 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00890651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2053  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  27.35 
 
 
168 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.255856  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2086  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  27.35 
 
 
168 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2154  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  27.35 
 
 
168 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0276384  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1190  thioesterase superfamily protein  26.87 
 
 
144 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1542  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 
168 aa  55.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00786106  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2218  putative Acyl-CoA thioester hydrolase  28.46 
 
 
136 aa  55.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0027  thioesterase superfamily protein  31.39 
 
 
139 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0243965 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3266  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  26.5 
 
 
168 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0875914  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3071  thioesterase superfamily protein  26.87 
 
 
144 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1229  thioesterase superfamily protein  26.24 
 
 
175 aa  55.1  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.506551  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2043  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  26.5 
 
 
168 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.701837  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1457  thioesterase superfamily protein  28.04 
 
 
132 aa  54.3  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.412041  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2122  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  27.35 
 
 
168 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548255  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4412  thioesterase superfamily protein  29.58 
 
 
187 aa  54.3  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3088  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 
129 aa  54.7  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.941483 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5550  YkhA  25.34 
 
 
170 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73691  predicted protein  23.43 
 
 
502 aa  53.9  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.405416  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2516  putative acyl-CoA hydrolase  33.68 
 
 
158 aa  53.9  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3818  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 
151 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.268375  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5401  YkhA  27.35 
 
 
170 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>