74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0901 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0901  import inner membrane translocase, subunit Tim44  100 
 
 		 314 aa  642    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000201824  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3295  import inner membrane translocase, subunit Tim44  79.06 
 
 		 318 aa  436  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081668  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3566  import inner membrane translocase, subunit Tim44  73.19 
 
 		 317 aa  431  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000205074  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1284  import inner membrane translocase subunit Tim44  65.62 
 
 		 318 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.45671e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2938  import inner membrane translocase subunit Tim44  65.62 
 
 		 318 aa  355  3.9999999999999996e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000555932  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0785  import inner membrane translocase, subunit Tim44  66.14 
 
 		 314 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0683467  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1010  import inner membrane translocase subunit Tim44  63.24 
 
 		 322 aa  292  4e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3250  import inner membrane translocase subunit Tim44  64.29 
 
 		 321 aa  291  7e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1091  putative lipoprotein  53.58 
 
 		 321 aa  258  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000494647  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1927  import inner membrane translocase, subunit Tim44  50.61 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000885618  normal  0.873638 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1788  import inner membrane translocase, subunit Tim44  47.55 
 
 		 341 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000825798  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0482  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.44 
 
 		 331 aa  108  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0544  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.49 
 
 		 295 aa  102  8e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2280  import inner membrane translocase subunit Tim44  62.5 
 
 		 134 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000369229 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0311  import inner membrane translocase subunit Tim44  35.11 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0470868 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6540  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.48 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398166  normal  0.199544 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2207  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.89 
 
 		 329 aa  79  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4404  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.96 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.583271  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2567  import inner membrane translocase, subunit Tim44  36.75 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5490  hypothetical protein  37.61 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1701  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.48 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3768  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.59 
 
 		 338 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2529  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.96 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2211  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.38 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.895169  normal  0.192893 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2254  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.96 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.349216  normal  0.0696359 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5066  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.32 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0334  import inner membrane translocase subunit Tim44  32.77 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.137155 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2165  hypothetical protein  35.04 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.810394 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1240  hypothetical protein  33.65 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0197113  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1269  hypothetical protein  24.77 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.753871  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5517  hypothetical protein  25 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6128  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.19 
 
 		 331 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.418522  normal  0.280335 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0214  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.11 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.525387  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1921  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.46 
 
 		 348 aa  62  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.464054  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5646  import inner membrane translocase, subunit Tim44  23.63 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169336 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0773  hypothetical protein  27.79 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3590  hypothetical protein  27.56 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0375  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.55 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5842  import inner membrane translocase subunit Tim44  30.4 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5103  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.67 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2135  import inner membrane translocase subunit Tim44  24.16 
 
 		 216 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3268  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.55 
 
 		 325 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1858  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.46 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767036  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0554  Tim44-like domain-contain protein  25.3 
 
 		 340 aa  52.8  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0551  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.3 
 
 		 324 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031829 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0538  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.93 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2119  import inner membrane translocase, subunit Tim44  23.69 
 
 		 343 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434025  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2731  import inner membrane translocase, subunit Tim44  23.69 
 
 		 343 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.767216  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3047  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.27 
 
 		 272 aa  51.6  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2758  import inner membrane translocase subunit Tim44  23.69 
 
 		 343 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.778073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72930  hypothetical protein  20.83 
 
 		 285 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6329  hypothetical protein  21.38 
 
 		 281 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2759  hypothetical protein  25.7 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2319  hypothetical protein  25.7 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2399  hypothetical protein  25.7 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0187  hypothetical protein  25.7 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3713  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.08 
 
 		 237 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500571 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0684  Tim44-like domain-containing protein  25.86 
 
 		 323 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0990  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.83 
 
 		 295 aa  46.6  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0845  transmembrane protein  25.55 
 
 		 323 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2861  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.77 
 
 		 308 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1256  hypothetical protein  26.42 
 
 		 204 aa  46.6  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1681  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.21 
 
 		 242 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00430  Tim44-like domain protein  26.28 
 
 		 284 aa  46.2  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.924994  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1839  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.53 
 
 		 239 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.32542 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2065  import inner membrane translocase subunit Tim44  23.79 
 
 		 320 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0100272 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1896  import inner membrane translocase, subunit Tim44  23.4 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0839059  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1560  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.53 
 
 		 239 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.69866 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0650  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.38 
 
 		 330 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.983868 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0668  Tim44-like domain-containing protein  25.47 
 
 		 324 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0305  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.44 
 
 		 235 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2096  hypothetical protein  23.31 
 
 		 318 aa  42.7  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0739383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2016  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.01 
 
 		 221 aa  42.7  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392424 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1012  hypothetical protein  26.62 
 
 		 273 aa  42.4  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>