More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1081 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
316 aa  628  1e-179  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0954  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.46 
 
 
341 aa  415  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.671843  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0678  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.17 
 
 
307 aa  282  5.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3152  oligopeptide ABC transporter (permease)  46.18 
 
 
296 aa  280  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279701  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26150  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  49.12 
 
 
331 aa  280  3e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.286946  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2538  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.53 
 
 
314 aa  276  4e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000570196 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0256  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter permease  46.21 
 
 
303 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0738977  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0488  putative oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  43.1 
 
 
330 aa  273  4.0000000000000004e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.359431 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.5 
 
 
309 aa  272  6e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.505775  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3821  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.37 
 
 
313 aa  270  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0857155  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.77 
 
 
330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.403444  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8932  dipeptide ABC transporter (permease)  47.04 
 
 
308 aa  268  8e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3798  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.97 
 
 
322 aa  266  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4178  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.24 
 
 
322 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.848155  hitchhiker  0.0018252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.02 
 
 
312 aa  263  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.736196  hitchhiker  0.00675709 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3309  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  46.28 
 
 
314 aa  258  6e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3913  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.8 
 
 
316 aa  256  3e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11070  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  44.79 
 
 
318 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.682818  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12590  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  46.03 
 
 
347 aa  252  6e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.219021 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.92 
 
 
326 aa  244  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.205092 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.53 
 
 
309 aa  244  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13694  dipeptide-transport integral membrane protein ABC transporter dppC  48.4 
 
 
266 aa  226  4e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0652275 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4244  oligopeptide ABC transporter, permease  37.24 
 
 
299 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4609  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  37.24 
 
 
299 aa  219  5e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4391  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  37.24 
 
 
299 aa  219  5e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4232  oligopeptide transport system, permease  37.24 
 
 
299 aa  219  5e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4731  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  37.24 
 
 
299 aa  219  5e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.61 
 
 
293 aa  218  1e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000296229  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.31 
 
 
310 aa  215  7e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.99 
 
 
310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0465132  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.36 
 
 
296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2756  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.11 
 
 
303 aa  210  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.85 
 
 
299 aa  210  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1395  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  42.96 
 
 
288 aa  209  5e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.064701  decreased coverage  0.00784209 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2030  oligopeptide ABC transporter permease protein  38.49 
 
 
293 aa  208  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0128641  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.78 
 
 
311 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.910518  normal  0.0436133 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.51 
 
 
299 aa  202  6e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.94 
 
 
299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499686  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.86 
 
 
280 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.46 
 
 
309 aa  200  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0643  oligopeptide ABC transporter, permease protein  41.74 
 
 
292 aa  199  5e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.93 
 
 
301 aa  199  5e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.27 
 
 
310 aa  199  7e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.86 
 
 
287 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.144364 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.86 
 
 
291 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_930  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  40.2 
 
 
301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.438382  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.01 
 
 
280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.68 
 
 
310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0590  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.89 
 
 
302 aa  196  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.02 
 
 
284 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  39.71 
 
 
282 aa  194  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.57 
 
 
313 aa  194  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5359  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  40.29 
 
 
289 aa  193  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.632265  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0385  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.68 
 
 
343 aa  192  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.519425 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.84 
 
 
340 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1282  oligopeptide ABC transporter, permease protein  40.66 
 
 
300 aa  192  6e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284613  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0611  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.71 
 
 
300 aa  192  6e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.84 
 
 
303 aa  192  7e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0903  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  34.84 
 
 
303 aa  191  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0983  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  34.84 
 
 
303 aa  191  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.631876 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.6 
 
 
495 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.99676  normal  0.0550466 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0857  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  34.84 
 
 
303 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2516  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  34.84 
 
 
303 aa  191  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245881  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00799  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  34.49 
 
 
303 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.49 
 
 
303 aa  191  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.482593  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00816  hypothetical protein  34.49 
 
 
303 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.72 
 
 
301 aa  191  2e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24260  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  38.83 
 
 
313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.97 
 
 
318 aa  189  4e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.643704  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
303 aa  189  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0890  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  34.49 
 
 
303 aa  189  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.221253  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0011  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.88 
 
 
307 aa  189  4e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.59 
 
 
297 aa  189  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.21 
 
 
313 aa  189  5e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.18 
 
 
285 aa  189  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
304 aa  189  5.999999999999999e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292743  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3511  oligopeptide ABC transporter (permease)  38.28 
 
 
317 aa  189  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 
294 aa  189  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.789298  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
314 aa  189  7e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.67 
 
 
308 aa  189  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.13 
 
 
344 aa  189  7e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2587  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.94 
 
 
341 aa  188  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.969826  hitchhiker  0.0068543 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1157  peptide ABC transporter, permease protein, putative  39.42 
 
 
473 aa  188  1e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.82 
 
 
497 aa  188  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.826633 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3674  oligopeptide ABC transporter, permease  38.46 
 
 
279 aa  187  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0467802 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 
301 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265268  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02947  hypothetical protein  34.95 
 
 
302 aa  187  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
306 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0838  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  38.26 
 
 
301 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00766751  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.51 
 
 
299 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.356305  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.41 
 
 
305 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.238767  normal  0.85069 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1948  oligopeptide transport system permease protein C  35.64 
 
 
300 aa  187  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.42 
 
 
287 aa  187  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0370  nickel ABC transporter, permease subunit NikC  38.1 
 
 
284 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
299 aa  186  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.23 
 
 
301 aa  186  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.36 
 
 
494 aa  185  7e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.79 
 
 
285 aa  185  8e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
299 aa  185  9e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213083  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.32 
 
 
301 aa  185  9e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>