More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0482 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0482  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
313 aa  598  1e-170  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.97 
 
 
310 aa  359  3e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373009  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36510  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  59.75 
 
 
322 aa  340  2.9999999999999998e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.118572  normal  0.969549 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.97 
 
 
311 aa  335  7e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19560  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  59.54 
 
 
312 aa  329  4e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.980516  normal  0.0687461 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2996  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.17 
 
 
307 aa  320  3e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.253818 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0257  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.14 
 
 
321 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0295996  hitchhiker  0.00179701 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01750  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  62.15 
 
 
330 aa  301  1e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0218  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.63 
 
 
320 aa  299  4e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.810512 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.89 
 
 
318 aa  299  4e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.84 
 
 
313 aa  299  5e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3635  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.51 
 
 
347 aa  293  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409582  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2195  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.42 
 
 
312 aa  293  3e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4391  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  44.09 
 
 
299 aa  247  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4232  oligopeptide transport system, permease  44.09 
 
 
299 aa  247  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4244  oligopeptide ABC transporter, permease  44.09 
 
 
299 aa  247  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4731  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  44.09 
 
 
299 aa  247  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4609  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  44.09 
 
 
299 aa  247  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1183  putative permease of ABC transporter  47.14 
 
 
301 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.056047  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.72 
 
 
299 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.55 
 
 
299 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.99 
 
 
287 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.53 
 
 
296 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3233  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  42.66 
 
 
300 aa  230  3e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.66 
 
 
300 aa  230  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.76 
 
 
294 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.789298  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.99 
 
 
289 aa  222  8e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.109416  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3965  hypothetical protein  42.96 
 
 
300 aa  222  8e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2358  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.73 
 
 
325 aa  221  9e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0041111  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0755  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.52 
 
 
291 aa  221  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0593743  normal  0.296521 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.65 
 
 
298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00781305  normal  0.217965 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.45 
 
 
304 aa  217  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292743  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.4 
 
 
304 aa  216  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.581816  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.24 
 
 
276 aa  215  7e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3250  dipeptide ABC transporter, permease protein DppC, putative  43.8 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193894  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0811  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.81 
 
 
308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.261533  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.46 
 
 
312 aa  213  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2349  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  40.57 
 
 
295 aa  213  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.87 
 
 
300 aa  213  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.765267  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2680  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.57 
 
 
290 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.129024  normal  0.890863 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5359  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  44 
 
 
289 aa  212  4.9999999999999996e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.632265  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
296 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271529  normal  0.0400541 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.43 
 
 
294 aa  212  5.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881682  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.64 
 
 
298 aa  210  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0407535  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1867  ABC-type transport system protein  43.01 
 
 
288 aa  211  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.71 
 
 
303 aa  210  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.01 
 
 
308 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848897  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45 
 
 
311 aa  210  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.87 
 
 
300 aa  211  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.12 
 
 
291 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.15 
 
 
301 aa  209  5e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.44 
 
 
309 aa  209  5e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0112  dipeptide transporter  40.21 
 
 
304 aa  209  6e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.81 
 
 
310 aa  208  9e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.46 
 
 
299 aa  208  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.553979  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.46 
 
 
299 aa  207  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111328  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0983  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  40.43 
 
 
303 aa  206  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.631876 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2849  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.24 
 
 
304 aa  207  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0857  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  40.43 
 
 
303 aa  206  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2716  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.64 
 
 
301 aa  206  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0903  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  40.43 
 
 
303 aa  206  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2516  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  40.43 
 
 
303 aa  206  3e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245881  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.07 
 
 
303 aa  206  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00799  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  40.07 
 
 
303 aa  206  5e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.07 
 
 
303 aa  206  5e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.482593  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1382  transmembrane ABC transporter protein  41.73 
 
 
299 aa  206  5e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.131281  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00816  hypothetical protein  40.07 
 
 
303 aa  206  5e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0890  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  40.07 
 
 
303 aa  205  6e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.221253  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.65 
 
 
299 aa  206  6e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213083  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.29 
 
 
299 aa  205  7e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.356305  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.32 
 
 
300 aa  205  7e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1570  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  40.07 
 
 
298 aa  205  8e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.76 
 
 
305 aa  205  9e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.988544  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01443  D-ala-D-ala transporter subunit  40.07 
 
 
298 aa  205  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.45304  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4563  dipeptide ABC transporter, permease protein  43.4 
 
 
303 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.5 
 
 
284 aa  204  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1688  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  40.07 
 
 
298 aa  204  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.175944  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2172  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  40.07 
 
 
298 aa  204  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.96 
 
 
302 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.0471149 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1674  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  40.07 
 
 
298 aa  205  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01455  hypothetical protein  40.07 
 
 
298 aa  205  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.47297  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4240  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.06 
 
 
303 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247353  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2097  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  40.07 
 
 
298 aa  203  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.71 
 
 
298 aa  202  4e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00686598  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.52 
 
 
305 aa  202  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.16 
 
 
308 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.706102  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.39 
 
 
306 aa  202  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.05 
 
 
309 aa  202  5e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2463  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.64 
 
 
300 aa  202  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.342595  normal  0.319214 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.21 
 
 
297 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774005  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.21 
 
 
297 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723958 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.21 
 
 
297 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110641  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3674  oligopeptide ABC transporter, permease  38.99 
 
 
279 aa  201  9e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0467802 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0805  ABC dipeptide transporter, inner membrane subunit DppC  43.27 
 
 
300 aa  201  9e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.01 
 
 
301 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0977  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  41.37 
 
 
302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.699856  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5351  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  38.61 
 
 
317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2053  peptide ABC transporter permease  41.67 
 
 
303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.942235  normal  0.455607 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.93 
 
 
308 aa  200  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0241  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  41.37 
 
 
302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>