More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0434 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0434  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
460 aa  914    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1581  glycosyl transferase family protein  43.07 
 
 
466 aa  250  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0428  glycosyl transferase family 2  38.86 
 
 
438 aa  219  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1586  glycosyl transferase family protein  40.44 
 
 
444 aa  213  7e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807446  normal  0.639173 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2680  glycosyl transferase family protein  37.22 
 
 
426 aa  190  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  37.19 
 
 
413 aa  182  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2949  glycosyl transferase family 2  36.04 
 
 
392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3195  glycosyl transferase family 2  33.14 
 
 
394 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0399  glycosyl transferase family 2  42.51 
 
 
454 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2462  glycosyl transferase family 2  29.48 
 
 
421 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.278728  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2063  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 
321 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 
310 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 
924 aa  94  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3054  glycosyl transferase family protein  32.75 
 
 
305 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3253  glycosyl transferase family 2  31.74 
 
 
305 aa  90.9  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24393  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  33.61 
 
 
836 aa  90.1  8e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  32.27 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  30.61 
 
 
300 aa  84.3  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4093  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  30.66 
 
 
311 aa  82.8  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3392  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 
287 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2753  glycosyl transferase family 2  28.09 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10710  membrane sugar transferase  30.77 
 
 
470 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  26.71 
 
 
838 aa  79  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  27.71 
 
 
927 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  28.11 
 
 
1115 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2573  glycosyl transferase family 2  25.08 
 
 
338 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  28.11 
 
 
1119 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  33.16 
 
 
313 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.31 
 
 
1115 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.11 
 
 
1115 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.71 
 
 
1115 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
470 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  27.31 
 
 
872 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 
309 aa  74.7  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  28.96 
 
 
525 aa  74.3  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  24.33 
 
 
528 aa  74.3  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  24.92 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  27.17 
 
 
260 aa  73.6  0.000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2956  glycosyl transferase family 2  25.07 
 
 
319 aa  73.6  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3277  glycosyl transferase family protein  24.6 
 
 
273 aa  73.2  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5280  glycosyl transferase, group 2 family protein  21.62 
 
 
273 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5124  glycosyl transferase, group 2 family protein  21.62 
 
 
273 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5677  group 2 family glycosyl transferase  21.62 
 
 
267 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3347  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 
308 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2107  glycosyl transferase family 2  27.71 
 
 
313 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2151  glycosyl transferase family 2  27.71 
 
 
313 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  24.12 
 
 
308 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 
470 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5523  glycosyl transferase, group 2 family protein  21.62 
 
 
273 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  34.21 
 
 
753 aa  71.2  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  27.32 
 
 
311 aa  71.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3045  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 
305 aa  70.9  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144194  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  31.54 
 
 
301 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  26.12 
 
 
841 aa  71.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  27.98 
 
 
236 aa  70.9  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1004  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 
470 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  29.53 
 
 
1124 aa  70.9  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1021  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 
470 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 
308 aa  70.9  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1031  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 
470 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0821008  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0868  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 
331 aa  70.5  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  29.34 
 
 
307 aa  70.1  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  24.5 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0158  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 
386 aa  70.1  0.00000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
353 aa  70.1  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  27.05 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  24.9 
 
 
337 aa  69.7  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  27.1 
 
 
322 aa  69.7  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0441  glycosyl transferase family 2  30.86 
 
 
315 aa  69.3  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.266223  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00986  glycosyl transferase, family 2  26 
 
 
303 aa  69.7  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0498062  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  24.86 
 
 
1101 aa  69.7  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
312 aa  69.7  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  29.35 
 
 
310 aa  69.7  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1244  glycosyl transferase family 2  27.38 
 
 
328 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.161463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1214  glycosyl transferase family 2  27.38 
 
 
328 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  25.3 
 
 
403 aa  68.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  31.97 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0540  glycosyl transferase family 2  28.25 
 
 
310 aa  67  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 
598 aa  66.6  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  27.13 
 
 
428 aa  66.6  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0150  glycosyl transferase family protein  25.15 
 
 
331 aa  66.6  0.0000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4681  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 
345 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627848  normal  0.36467 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  28.09 
 
 
350 aa  65.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  26.83 
 
 
461 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  24.84 
 
 
785 aa  66.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 
313 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2561  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.98 
 
 
957 aa  65.5  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1578  cell wall membrane glycosyltransferase  35.45 
 
 
349 aa  65.5  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  24.53 
 
 
632 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0926  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
310 aa  65.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  24.79 
 
 
300 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0633  glycosyl transferase family 2  34.17 
 
 
333 aa  64.7  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.718934 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  27.51 
 
 
318 aa  64.7  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  26.69 
 
 
355 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3998  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 
310 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.756459  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4588  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 
307 aa  63.9  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.151626  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2354  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
297 aa  63.5  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.358669  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  27.86 
 
 
422 aa  63.2  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  33.19 
 
 
637 aa  63.2  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>