30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3592 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3592  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 96 aa  190  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000372185  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3353  DNA polymerase beta subunit  60 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1735  DNA polymerase beta domain protein region  55.43 
 
 		 106 aa  107  7.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3505  DNA polymerase beta subunit  55.79 
 
 		 115 aa  103  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3010  restriction modification system DNA specificity subunit  47.92 
 
 		 549 aa  92.4  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1021  nucleotidyltransferase  45.74 
 
 		 99 aa  88.6  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.598559  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0918  putative nucleotidyltransferase  44.68 
 
 		 99 aa  86.7  9e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0221  hypothetical protein  41.94 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2086  DNA polymerase beta subunit  48.45 
 
 		 111 aa  83.6  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.166795  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4035  DNA polymerase beta subunit  47.37 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0268  DNA polymerase beta domain protein region  34.38 
 
 		 100 aa  74.7  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0417  DNA polymerase beta domain protein region  49.49 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2935  DNA polymerase beta subunit  47.47 
 
 		 115 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07030  nucleotidyltransferase  36.08 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0551  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2535  DNA polymerase, beta-like region  33.73 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000686331  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0893  DNA polymerase beta domain-containing protein region  32.29 
 
 		 143 aa  50.1  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  38.71 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1691  DNA polymerase beta domain protein region  43.94 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0339005 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1772  DNA polymerase beta domain protein region  36.23 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1471  DNA polymerase beta domain protein region  38.89 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.764189  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3599  DNA polymerase beta domain protein region  29.03 
 
 		 102 aa  45.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000413662  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0766  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 		 139 aa  42.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2432  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.71469  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0095  DNA polymerase beta subunit  38.78 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.365343 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1475  DNA polymerase beta domain protein region  27.96 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0270  nucleotidyltransferase domain-containing protein  43.59 
 
 		 135 aa  41.2  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.440685  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0997  DNA polymerase beta subunit  46.94 
 
 		 115 aa  40.4  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.995341  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1674  DNA polymerase, beta-like region  34.85 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.538651  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3962  DNA polymerase beta domain protein region  34.94 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>