41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1275 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1275  N-terminal methylation  100 
 
 		 202 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3370  N-terminal methylation  47 
 
 		 211 aa  184  5e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.306452 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0323  general secretion pathway protein j, putative  46.07 
 
 		 186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0589  N-terminal methylation protein  48.47 
 
 		 201 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0602  N-terminal methylation protein  47.69 
 
 		 201 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000162543 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0677  hypothetical protein  42.33 
 
 		 190 aa  150  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4585  general secretion pathway protein J  27.37 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2614  putative general secretion pathway protein J  27.03 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001886  general secretion pathway protein J  25.5 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2854  general secretion pathway protein J  23.66 
 
 		 216 aa  52  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2300  general secretion pathway protein J  27.94 
 
 		 221 aa  52  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00607  general secretion pathway protein J  23.59 
 
 		 250 aa  50.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1418  general secretion pathway protein J  22.46 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0103  general secretion pathway protein J  25.14 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0714  hypothetical protein  25.62 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0511321  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2553  Type II secretory pathway component PulJ-like  31.87 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0056  putative general secretion pathway protein J  32.23 
 
 		 231 aa  45.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1305  general secretion pathway protein J  27.42 
 
 		 246 aa  45.8  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0147  general secretion pathway protein J  32.17 
 
 		 253 aa  45.4  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  28.57 
 
 		 239 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0680  hypothetical protein  27.32 
 
 		 220 aa  45.4  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.197262  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3132  general secretion pathway protein J  26.42 
 
 		 201 aa  44.7  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0014  general secretory pathway protein J  30.83 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0965  N-terminal methylation  38.33 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0074  putative general secretion pathway protein J  33.33 
 
 		 222 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3241  general secretion pathway protein GspJ  25.91 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.575634 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0973  hypothetical protein  40.24 
 
 		 156 aa  44.3  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3237  putative general secretion pathway protein J  33.33 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.722967  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0227  general secretory pathway protein J  30.83 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.291181  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2778  general secretory pathway protein J  30.83 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2669  general secretory pathway protein J  30.83 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0015  general secretion pathway protein J  30.83 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0015  general secretion pathway protein J  30.83 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1883  general secretory pathway protein J  30.83 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0715  hypothetical protein  25.12 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3406  general secretion pathway protein GspJ  25.91 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3421  general secretion pathway protein J  25.91 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0045  putative general secretion pathway protein J  32.97 
 
 		 234 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0055  putative general secretion pathway protein J  32.97 
 
 		 224 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0954003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1476  general secretion pathway protein J  25 
 
 		 237 aa  41.6  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0111  general secretion pathway protein J  25.4 
 
 		 236 aa  41.6  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>