22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0602 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0602  N-terminal methylation protein  100 
 
 		 201 aa  414  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000162543 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0589  N-terminal methylation protein  94.53 
 
 		 201 aa  360  7.0000000000000005e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3370  N-terminal methylation  51.74 
 
 		 211 aa  201  6e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.306452 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0677  hypothetical protein  53.4 
 
 		 190 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0323  general secretion pathway protein j, putative  50.27 
 
 		 186 aa  175  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1275  N-terminal methylation  47.69 
 
 		 202 aa  152  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0714  hypothetical protein  29.25 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0511321  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0680  hypothetical protein  29.67 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.197262  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0715  hypothetical protein  29.49 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2614  putative general secretion pathway protein J  24.77 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1418  general secretion pathway protein J  22.73 
 
 		 216 aa  48.5  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0724  hypothetical protein  27.23 
 
 		 239 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521463  normal  0.453877 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001886  general secretion pathway protein J  25.35 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2854  general secretion pathway protein J  22.73 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3422  general secretion pathway protein J  37.1 
 
 		 232 aa  45.8  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000633509 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4585  general secretion pathway protein J  24.14 
 
 		 219 aa  45.4  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24060  general secretion pathway protein J  41.54 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2035  general secretion pathway protein J  39.39 
 
 		 237 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1035  hypothetical protein  25.76 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  31.5 
 
 		 239 aa  43.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00607  general secretion pathway protein J  25.62 
 
 		 250 aa  42.4  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2388  general secretion pathway protein J  29 
 
 		 212 aa  42  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000292779 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>