More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1915 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1915  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
349 aa  699    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.482777  normal  0.264492 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0948  putative L-idonate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  46.22 
 
 
344 aa  281  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0609  alcohol dehydrogenase  46.49 
 
 
352 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0295083  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6416  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.57 
 
 
343 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124082  normal  0.304265 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5030  zinc-binding dehydrogenase  45.32 
 
 
343 aa  277  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.959168  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4509  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.57 
 
 
343 aa  275  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0159  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  46.2 
 
 
347 aa  275  8e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.306594  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0642  alcohol dehydrogenase  46.2 
 
 
352 aa  275  9e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3728  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.91 
 
 
352 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.854934  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2124  L-idonate 5-dehydrogenase, NAD-binding  47.51 
 
 
343 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3523  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  47.73 
 
 
349 aa  273  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.538037  normal  0.114116 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5333  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.19 
 
 
345 aa  273  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0397204  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3340  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.7 
 
 
356 aa  270  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5671  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.18 
 
 
343 aa  264  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2436  alcohol dehydrogenase  43.99 
 
 
345 aa  263  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1003  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.32 
 
 
342 aa  262  8e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.124693 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.68 
 
 
348 aa  259  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3277  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.55 
 
 
345 aa  260  3e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1590  alcohol dehydrogenase  47.37 
 
 
342 aa  259  4e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00466455  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4094  alcohol dehydrogenase  41.81 
 
 
358 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.958788  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02400  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  45.19 
 
 
345 aa  258  7e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.242832  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3545  alcohol dehydrogenase  44.61 
 
 
345 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.715464  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3621  alcohol dehydrogenase  46.2 
 
 
347 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3685  alcohol dehydrogenase  43.79 
 
 
347 aa  250  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.112233 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2451  alcohol dehydrogenase  46.53 
 
 
355 aa  249  5e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.11 
 
 
368 aa  248  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.61 
 
 
344 aa  246  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.477759 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0836  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.65 
 
 
347 aa  243  3e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21210  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  43.66 
 
 
336 aa  243  5e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2131  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.22 
 
 
349 aa  242  6e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4771  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.31 
 
 
344 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.107599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5057  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.27 
 
 
340 aa  239  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.73696  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3565  alcohol dehydrogenase  41.16 
 
 
345 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5063  alcohol dehydrogenase  42.69 
 
 
347 aa  233  4.0000000000000004e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.724577  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41 
 
 
345 aa  233  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268542  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4739  L-idonate 5-dehydrogenase  41.72 
 
 
343 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.130148 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4769  L-idonate 5-dehydrogenase  41.72 
 
 
343 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0966138  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4869  L-idonate 5-dehydrogenase  41.72 
 
 
343 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0951463 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4832  L-idonate 5-dehydrogenase  41.72 
 
 
343 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4888  L-idonate 5-dehydrogenase  41.72 
 
 
343 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138899  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04097  hypothetical protein  41.85 
 
 
343 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04133  L-idonate 5-dehydrogenase, NAD-binding  41.85 
 
 
343 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3730  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.85 
 
 
343 aa  224  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3287  L-idonate 5-dehydrogenase  40.06 
 
 
344 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4748  L-idonate 5-dehydrogenase  41.53 
 
 
343 aa  223  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4523  L-idonate 5-dehydrogenase  41.85 
 
 
343 aa  223  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0181227  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0221  L-idonate 5-dehydrogenase  40.58 
 
 
343 aa  222  8e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0944  L-idonate 5-dehydrogenase  36.68 
 
 
350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.272351  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1538  L-idonate 5-dehydrogenase  36.9 
 
 
347 aa  212  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.58 
 
 
342 aa  206  4e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2830  alcohol dehydrogenase  36.36 
 
 
341 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.782331  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2786  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.36 
 
 
341 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2813  alcohol dehydrogenase  36.07 
 
 
341 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0594163  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2013  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.98 
 
 
344 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.238084  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01090  xylitol dehydrogenase, putative  35.96 
 
 
375 aa  189  5.999999999999999e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.55 
 
 
346 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2864  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36 
 
 
359 aa  186  4e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  36.66 
 
 
342 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01050  sorbitol dehydrogenase, putative  32.58 
 
 
379 aa  182  8.000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917438  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4289  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.88 
 
 
360 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.70382 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.5 
 
 
344 aa  181  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  34.56 
 
 
350 aa  181  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28190  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  36.5 
 
 
345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.83 
 
 
356 aa  178  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02666  sorbitol/xylitol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02000)  34.55 
 
 
373 aa  177  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  30.84 
 
 
348 aa  176  6e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02580  sorbitol dehydrogenase, putative  30.24 
 
 
416 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  37.74 
 
 
352 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09064  hypothetical protein similar to xylitol dehydrogenase (Broad)  34.94 
 
 
359 aa  171  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.715081 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4389  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.46 
 
 
356 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.189858  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2445  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.59 
 
 
347 aa  170  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.682207  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2713  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.39 
 
 
333 aa  170  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.49 
 
 
373 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  35.49 
 
 
373 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.93 
 
 
373 aa  169  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  35.49 
 
 
373 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  35.77 
 
 
373 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.3 
 
 
341 aa  166  4e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  35.88 
 
 
373 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1714  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.02 
 
 
352 aa  163  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  32.72 
 
 
362 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.14 
 
 
352 aa  161  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  32.72 
 
 
362 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2609  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
348 aa  161  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00774  zinc-dependent alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14390)  33.33 
 
 
400 aa  160  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  33.54 
 
 
354 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  33.54 
 
 
354 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  33.02 
 
 
363 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  32.72 
 
 
362 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.84 
 
 
350 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1000  putative alcohol dehydrogenase  35.43 
 
 
352 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  31.83 
 
 
365 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0357  zinc-dependent dehydrogenase  30.45 
 
 
349 aa  155  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2551  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.48 
 
 
341 aa  155  8e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0163607  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00100  L-arabinitol 4-dehydrogenase, putative  30.45 
 
 
392 aa  155  9e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.603371  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  32.71 
 
 
363 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  31.79 
 
 
354 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.79 
 
 
354 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  32.25 
 
 
364 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02880  L-iditol 2-dehydrogenase, putative  31.75 
 
 
400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>