263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0577 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0577  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  100 
 
 
686 aa  1334    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0505087  hitchhiker  0.0000000000000536601 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2185  glycine--tRNA ligase  51.84 
 
 
723 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4369  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  49.79 
 
 
701 aa  548  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1239  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.69 
 
 
760 aa  551  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4348  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.17 
 
 
728 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.314297  hitchhiker  0.00562302 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2586  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.45 
 
 
727 aa  544  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.577877  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1095  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.32 
 
 
760 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.729278  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2357  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  46.47 
 
 
701 aa  535  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306896  normal  0.223006 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3329  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  46.6 
 
 
733 aa  535  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10801  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2955  glycine--tRNA ligase  48.4 
 
 
721 aa  522  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0728  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  45.61 
 
 
741 aa  525  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0540  glycine--tRNA ligase  47.78 
 
 
685 aa  520  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228601  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2759  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  49.09 
 
 
704 aa  512  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2731  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.79 
 
 
739 aa  513  1e-144  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0985358  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2111  glycine--tRNA ligase  42.59 
 
 
738 aa  509  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.541212  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2402  glycyl-tRNA synthetase beta chain  45.34 
 
 
720 aa  504  1e-141  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0966728  normal  0.754916 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2310  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  46.1 
 
 
687 aa  503  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.75706 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1858  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  46.31 
 
 
697 aa  498  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3210  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  42.49 
 
 
764 aa  496  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.58245  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2175  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  42.9 
 
 
728 aa  497  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.754598  normal  0.117585 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0507  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  46.16 
 
 
697 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250134  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3416  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  49.37 
 
 
696 aa  492  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.269984  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3096  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  47.01 
 
 
726 aa  492  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0714  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  41.72 
 
 
789 aa  488  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1611  glycine--tRNA ligase  43.44 
 
 
723 aa  479  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1138  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  47.68 
 
 
699 aa  476  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2178  glycine--tRNA ligase  42.74 
 
 
738 aa  478  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0538  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  42.05 
 
 
727 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.533831  normal  0.300886 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0644  glycine--tRNA ligase  43.01 
 
 
758 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121642  normal  0.442369 
 
 
-
 
NC_004310  BR0404  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.85 
 
 
777 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4858  glycine--tRNA ligase  44.94 
 
 
677 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0413  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.72 
 
 
777 aa  471  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0466  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  41.71 
 
 
721 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0380  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  38.87 
 
 
740 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3289  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  46.19 
 
 
724 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0726267  normal  0.258667 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0583  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  41.14 
 
 
704 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.496315 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0522  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  41.69 
 
 
764 aa  466  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0956  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.24 
 
 
764 aa  459  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1109  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  46.13 
 
 
737 aa  456  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1221  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  46.29 
 
 
822 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2126  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  47.61 
 
 
821 aa  398  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.15 
 
 
692 aa  383  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.58 
 
 
689 aa  379  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0155  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.72 
 
 
705 aa  370  1e-101  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.117933  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0079  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.59 
 
 
683 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248487  decreased coverage  0.0000000000235888 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1686  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  37.39 
 
 
696 aa  370  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78284  normal  0.0276337 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.24 
 
 
689 aa  372  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000111985 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.3 
 
 
683 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.589695  hitchhiker  0.000000000290731 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1441  glycine--tRNA ligase  37.3 
 
 
700 aa  367  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.764176  normal  0.147312 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.78 
 
 
684 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000133889  normal  0.112381 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2033  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  37.32 
 
 
696 aa  365  1e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00144588  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3726  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.15 
 
 
688 aa  365  1e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0060  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.92 
 
 
684 aa  365  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3881  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.31 
 
 
689 aa  362  1e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0185  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.88 
 
 
684 aa  362  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0446  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.55 
 
 
707 aa  361  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.56 
 
 
694 aa  362  2e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0025  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.79 
 
 
689 aa  361  2e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0144037 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4054  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.31 
 
 
689 aa  360  6e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0218  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.49 
 
 
699 aa  359  9e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2350  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.49 
 
 
699 aa  359  9e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2430  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.49 
 
 
699 aa  359  9e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.726931  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2728  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.49 
 
 
699 aa  359  9e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03410  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.17 
 
 
689 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0152  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.17 
 
 
689 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4934  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.17 
 
 
689 aa  359  9.999999999999999e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.711684 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03361  hypothetical protein  36.17 
 
 
689 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3761  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.17 
 
 
689 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.677293  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1022  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.04 
 
 
687 aa  359  9.999999999999999e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.208045  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0156  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.17 
 
 
689 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3966  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.17 
 
 
689 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0716  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.33 
 
 
699 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0881  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.33 
 
 
699 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.59966  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.54 
 
 
684 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000238485  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0701  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.33 
 
 
699 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2051  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.75 
 
 
692 aa  356  5.999999999999999e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0011  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.3 
 
 
684 aa  356  6.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0400  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.34 
 
 
697 aa  355  1e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.543468 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.68 
 
 
684 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0014  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.71 
 
 
689 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000639104 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0415  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.19 
 
 
697 aa  353  7e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474954  normal  0.979484 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.71 
 
 
689 aa  352  1e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0163  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.46 
 
 
689 aa  352  1e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0579  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.36 
 
 
687 aa  351  3e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0656  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.47 
 
 
687 aa  350  4e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70031e-23 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.4 
 
 
685 aa  350  4e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0023  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.81 
 
 
689 aa  350  5e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3782  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.81 
 
 
689 aa  350  5e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3849  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.32 
 
 
689 aa  350  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4130  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.81 
 
 
689 aa  350  5e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3059  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.52 
 
 
687 aa  350  5e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0584  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  38.28 
 
 
699 aa  350  7e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2702  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  38.54 
 
 
699 aa  349  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0207133  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3868  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.32 
 
 
689 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2090  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  38.54 
 
 
699 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339656  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4037  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.18 
 
 
689 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.414013 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0061  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.33 
 
 
689 aa  347  3e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3931  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.18 
 
 
689 aa  348  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3977  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.18 
 
 
689 aa  348  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0599  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.85 
 
 
688 aa  345  1e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>