More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3636 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  75.38 
 
 		 399 aa  638    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  100 
 
 		 397 aa  818    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  95.97 
 
 		 397 aa  795    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  83.12 
 
 		 396 aa  699    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  77.89 
 
 		 399 aa  633  1e-180  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  71.03 
 
 		 398 aa  598  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  73.62 
 
 		 399 aa  592  1e-168  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  63.73 
 
 		 396 aa  535  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  56.42 
 
 		 402 aa  476  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  57.18 
 
 		 396 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  57.43 
 
 		 397 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  55.64 
 
 		 400 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  56.59 
 
 		 396 aa  461  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  55.67 
 
 		 403 aa  456  1e-127  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  55.04 
 
 		 395 aa  436  1e-121  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  55.04 
 
 		 394 aa  433  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  52.97 
 
 		 396 aa  434  1e-120  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  54.01 
 
 		 395 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  53.49 
 
 		 394 aa  429  1e-119  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  52.56 
 
 		 399 aa  425  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  54.95 
 
 		 391 aa  426  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  54.52 
 
 		 395 aa  422  1e-117  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  53.96 
 
 		 417 aa  419  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  52.21 
 
 		 395 aa  421  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  51.78 
 
 		 426 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  50.26 
 
 		 399 aa  405  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  49.75 
 
 		 418 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  50.26 
 
 		 427 aa  398  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  53.23 
 
 		 400 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  49.75 
 
 		 418 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  51.64 
 
 		 396 aa  397  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  49.75 
 
 		 398 aa  392  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  51.54 
 
 		 398 aa  390  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  50 
 
 		 423 aa  390  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  50 
 
 		 400 aa  390  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.74 
 
 		 427 aa  390  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2429  acetylornithine aminotransferase  49.62 
 
 		 398 aa  386  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2179  acetylornithine aminotransferase  49.74 
 
 		 398 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.569965  normal  0.442274 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  50.52 
 
 		 390 aa  388  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  50.13 
 
 		 418 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3002  acetylornithine aminotransferase  49.11 
 
 		 398 aa  382  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.555766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.96 
 
 		 398 aa  382  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3572  acetylornithine aminotransferase  49.11 
 
 		 404 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0906  acetylornithine aminotransferase  47.81 
 
 		 402 aa  380  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  47.93 
 
 		 392 aa  381  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2121  acetylornithine aminotransferase  48.62 
 
 		 404 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00994118  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  49.62 
 
 		 392 aa  378  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3011  acetylornithine aminotransferase  48.09 
 
 		 404 aa  379  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.98 
 
 		 387 aa  377  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  49.49 
 
 		 398 aa  378  1e-103  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3029  acetylornithine aminotransferase  47.3 
 
 		 410 aa  373  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.51469  normal  0.939431 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  45.18 
 
 		 397 aa  372  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  49.74 
 
 		 398 aa  374  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  46.53 
 
 		 390 aa  374  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1452  acetylornithine aminotransferase  47.97 
 
 		 402 aa  371  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  47.64 
 
 		 391 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0943  acetylornithine aminotransferase  48.59 
 
 		 422 aa  370  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1901  acetylornithine aminotransferase  47.59 
 
 		 400 aa  368  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133726  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.01 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  48.18 
 
 		 388 aa  366  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0914  acetylornithine aminotransferase  43.78 
 
 		 399 aa  363  3e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1851  acetylornithine aminotransferase  48.45 
 
 		 394 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3149  acetylornithine aminotransferase  44.56 
 
 		 402 aa  362  8e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.457305 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  47.27 
 
 		 403 aa  360  3e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1426  acetylornithine aminotransferase  44.73 
 
 		 400 aa  359  4e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0402  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.47 
 
 		 446 aa  358  6e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0395  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.94 
 
 		 413 aa  357  1.9999999999999998e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.538676 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4916  acetylornithine transaminase protein  48.14 
 
 		 405 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2151  acetylornithine aminotransferase  43.88 
 
 		 405 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0731978 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1958  acetylornithine aminotransferase  43.67 
 
 		 401 aa  355  5e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0867  acetylornithine aminotransferase  46.31 
 
 		 393 aa  355  5.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0858  acetylornithine aminotransferase  47.46 
 
 		 434 aa  355  5.999999999999999e-97  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7457  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.75 
 
 		 397 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484657  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2124  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.17 
 
 		 410 aa  355  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.975893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.11 
 
 		 388 aa  354  2e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  46.11 
 
 		 388 aa  354  2e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  46.35 
 
 		 401 aa  354  2e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17211  acetylornithine aminotransferase  46.19 
 
 		 420 aa  353  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  45.48 
 
 		 385 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4285  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.34 
 
 		 406 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1951  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.14 
 
 		 398 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.620278  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2318  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.01 
 
 		 396 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.156448 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.2 
 
 		 399 aa  352  5.9999999999999994e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.716815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0513  acetylornithine transaminase protein  47.34 
 
 		 403 aa  352  8e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.508573 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3770  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.29 
 
 		 406 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0233516 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1180  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.36 
 
 		 410 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2541  acetylornithine transaminase protein  47.58 
 
 		 398 aa  350  2e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1157  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.85 
 
 		 410 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.861166  normal  0.0351204 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2767  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.46 
 
 		 403 aa  351  2e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4556  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.88 
 
 		 396 aa  350  3e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.974298 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5259  acetylornithine transaminase protein  44.88 
 
 		 403 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4075  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.88 
 
 		 396 aa  350  3e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0701  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.1 
 
 		 410 aa  349  4e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520056  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.94 
 
 		 399 aa  349  5e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0759  acetylornithine transaminase protein  47.24 
 
 		 403 aa  349  5e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803695 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2911  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.25 
 
 		 406 aa  348  8e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.408245 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3033  acetylornithine aminotransferase  46.91 
 
 		 390 aa  348  9e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.850335  normal  0.390329 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34500  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.41 
 
 		 406 aa  348  9e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50577  acetylornithine aminotransferase  45.73 
 
 		 476 aa  348  1e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1061  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.59 
 
 		 410 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.964628  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>