74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2412 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2412  cytochrome c class I  100 
 
 
120 aa  245  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000673714  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0159  cytochrome c class I  82.5 
 
 
120 aa  206  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3018  cytochrome c class I  48.33 
 
 
118 aa  120  8e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0223373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0828  cytochrome c-550  49.17 
 
 
118 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000131619  hitchhiker  6.35976e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4408  cytochrome c-550  49.17 
 
 
118 aa  118  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000137345  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4143  cytochrome c class I  50 
 
 
118 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000375642  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4031  cytochrome c-550  49.17 
 
 
118 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000040592  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4425  cytochrome c-550  48.33 
 
 
118 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000170237  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4371  cytochrome c-550  48.33 
 
 
118 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00063902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4193  cytochrome c-550  49.17 
 
 
118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000176262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4313  cytochrome c-550  49.17 
 
 
118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.74805e-54 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4514  cytochrome c-550  49.17 
 
 
118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000708555  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4041  cytochrome c-550  48.33 
 
 
118 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000123285  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3190  cytochrome c class I  44.44 
 
 
111 aa  94.7  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3005  cytochrome c class I  52.11 
 
 
110 aa  87.4  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000505825  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4979  cytochrome c-551  32.11 
 
 
107 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5035  cytochrome c-551  31.19 
 
 
107 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5273  cytochrome c-551  31.19 
 
 
107 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717075 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5417  cytochrome c-551  31.19 
 
 
107 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4880  cytochrome c-551  31.19 
 
 
107 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4865  cytochrome c-551  31.19 
 
 
107 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3724  cytochrome c-551  35.29 
 
 
112 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5653  cytochrome c-551  29.36 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.432356 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5303  cytochrome c-551  29.36 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5291  cytochrome c-551  28.18 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5348  cytochrome c-551  28.18 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0848  cytochrome c class I  34.69 
 
 
121 aa  54.3  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0942  cytochrome c class I  31.52 
 
 
329 aa  52.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.240089 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0490  cytochrome c class I  31.53 
 
 
254 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1378  Quinoprotein glucose dehydrogenase  35.71 
 
 
769 aa  50.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.618452 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2650  hypothetical protein  43.33 
 
 
97 aa  50.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2129  cytochrome c class I  31.3 
 
 
255 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000120589  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2961  cytochrome c, class I  35.21 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.428474  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1985  nitrite reductase NirS  33.75 
 
 
546 aa  47.4  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000493691  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1132  PQQ-dependent enzyme-like protein  41.18 
 
 
701 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0946665  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4957  Pyrrolo-quinoline quinone  36.67 
 
 
698 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.897916 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1434  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  29.17 
 
 
255 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0832764  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1248  cytochrome c class I  30.93 
 
 
255 aa  45.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.254815  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1406  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c subunit  29.17 
 
 
255 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1546  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  29.17 
 
 
255 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1618  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  29.17 
 
 
255 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.117912 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5018  nitrite reductase (NO-forming)  36.84 
 
 
503 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1678  cytochrome c class I  28.46 
 
 
289 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3765  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  29.17 
 
 
255 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3132  hydroxylamine reductase  42.62 
 
 
504 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1449  cytochrome c class I  29.17 
 
 
255 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.150697  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3169  cytochrome d1, heme region  35.21 
 
 
493 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  33.73 
 
 
101 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1651  hypothetical protein  30.34 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1651  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  29.17 
 
 
255 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1580  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  29.17 
 
 
255 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0062  Pyrrolo-quinoline quinone  43.14 
 
 
704 aa  44.3  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3662  cytochrome c class I  41.18 
 
 
124 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0843  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 
330 aa  43.9  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1687  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  28.12 
 
 
255 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.615326  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1406  hypothetical protein  31.51 
 
 
291 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1587  hypothetical protein  26.26 
 
 
291 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1406  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c subunit  28.12 
 
 
255 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118842  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3172  nitrite reductase protein N  33.33 
 
 
517 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.854794 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1450  cytochrome d1 heme region  34.67 
 
 
525 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.593871 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1441  Pyrrolo-quinoline quinone  44.44 
 
 
708 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0121309 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0952  cytochrome c, class I  39.34 
 
 
192 aa  42.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000198815  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7193  cytochrome c class I  28.26 
 
 
409 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal  0.500209 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1045  cytochrome c class I  35.29 
 
 
98 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2103  cytochrome c class I  30.63 
 
 
124 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2147  cytochrome c class I  30.63 
 
 
124 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.620434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2450  PQQ-dependent enzyme-like protein  40 
 
 
718 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264561  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15291  cytochrome cM  25.45 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.427205  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1900  quinoprotein glucose dehydrogenase  36.07 
 
 
720 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2140  cytochrome c, class I  37.68 
 
 
87 aa  40.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0189398  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11621  hypothetical protein  29.73 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11631  cytochrome cM  30.43 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.362816  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1068  cytochrome cM  30.43 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2618  cytochrome c-555  44.68 
 
 
123 aa  40.8  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>